كلية العلوم
Permanent URI for this communityhttps://repository.neelain.edu.sd/handle/123456789/482
Browse
936 results
Search Results
Item Phytochemical Screening and Antimicrobial Activity of Boswellia papyrifera Extracts(Al-Neelain University, 2020-11) Mihad Mohammed ALhafiz ALtiganyAbstract Boswellia papyrifera is used in traditional medicine to treat cough and inflammation generally. In this study, Gums of Boswellia papyrifera sample was extracted successively using maceration method with ethanol, chloroform and petroleum ether, Chloroform gave highest value of total weight in percentage yield (68.4%) followed by ethanol (62.5%) finally petroleum ether (18.8%). Phytochemical screening was carried out on the ethanolic extract (80%) by maceration of powder plant which revealed the presence of alkaloids, tannins, terpenes, flavonoids, phenols, saponins, and cumareins. Quantitative determination revealed that the crude extracts of Boswellia papyrifera gave alkaloids with the highest percent (44.6%), followed by tannins (35.2%), and finally flavonoids (27.0%). The Antimicrobial activity of Boswellia papyrifera showed that the chloroform extract is high active than petroleum ether extract and ethanol extract is partially active.. The result revealed important need concerning on Boswellia papyrifera as antimicrobial active plant. Intensive analytical investigation were needed to carry out on the most active chloroform extract in order to isolate and identify the effective compounds using modern chromatographic and spectroscopic techniques. مستخلص البحث نبات اللبان يستخدم في الطب الشعبي لعلاج نزلات البرد و الالتهابات عموما. في هذه الدراسة تم استخلاص نبات اللبان باستخدام طريقة النقع بمذيبات الايثر البترولي ,الكلوروفورم و الايثانول حيث سجل مستخلص الكلوروفورم أعلى نسبة إستخلاص (68.4% )، يليه الايثانول (62.5%) ثم الإيثر البترولي (18.8%). عند اجراء المسح النباتي الكيميائي لمستخلص الايثانول (80%) لمعرفة مكوناته الاساسية وجد انه يحتوي على تانينات, صابونينات, فلافونويدات, قلويدات, تربينات, فينولات و كومارينات. أسفرت طرق التحليل الكمى للنبات عن وجود أعلى نسبة للقلويدات (44.6%)، التانينات (35.2%), والفلافونويدات (27.0%). عند تحديد الفعالية ضد الميكروبات اعطى مستخلص الكلوروفورم أعلى فعالية يليه مستخلص الايثر البترولي بينما كان مستخلص الايثانول فعال جزئيآ. هذه النتائج نوضح ضرورة الاهتمام بنبات اللبان كمضاد للبكتيريا. الاختبارات التحليلية المكثفة على مستخلص الكلوروفورم للفصل و التعرف على المركبات الفعالة باستخدام طرق الكروماتوغرافيا الحديثة والتقنيات المطيافية.Item Phytochemical Screening, GC-MS Analysis and Antioxidant Activity of Leaves of Azadiracta indica.(ALNEELAIN UNIVERSITY, 2022-08) Alamein Ibrahim Yhaya IshagABSTRACT Azadirachta indica, has a long history of medicinal usage in the treatment of various chronic diseases. The present study was undertaken to explore the phytocomponents present in the A. indica. The methanol extract and petroleum ether extract of Azadirachta indica leaves were first evaluated for phytochemical study. The phytochemical screening of the two extracts of Azadirachta indica exhibited the presence of important secondary metabolites such as flavonoids, alkhaloid,saponin, glycoside and tannins. Secondly, the petroleum ether was evaluated using Gas Chromatography–Mass Spectrometry analysis. The analysis of the GC-MS analysis of the neem leaves extract revealed the existence of the GC-MS chromatogram of fifteen peaks present. Lup-20(29)-en-3-ol, acetate, (3.beta.)- (53.83%), Lanosta-8, 24-dien-3-ol, acetate, (3.beta.)- (28.00%), Hexadecanoic acid, 2-hydroxy-1-(hydroxyme) (4.22%),10-Octadecenoic acid, methyl ester (3.91%),9,12-Octadecadienoic acid, methyl ester(2.61).The study showed that the maximum inhibition obtained anti-oxidant of methanolic and petroleum ether extracts of leaves at a concentration of 50mg/ml showed height percentage inhibition. Low percentage inhibition showed at concentration of 0,5mg/ml extract by petroleum ether and methanol. the study results indicated that Azadirachta indica possesses remarkable anti-oxidant activity. المستخلص النيم لها تاريخ طويل في الاستخدام الطبي في علاج الأمراض المزمنة المختلفة ، عمدت الدراسة الحالية لاستكشاف المكونات الكيميائية النباتية الموجودة في نبات النيم ،أظهر الفحص الكيميائي لمستخلص الميثانول ومستخلص ايثر البترول للنيم وجود مركبات ايض ثانوية مهمة مثل :الفلافونيد ، الكالويد ،الصابونين ، الجلايكوسيد ، التانين، ثانيا:ً تم تقييم الأيثر البترولي بإستخدام تحليل قياس الطيف الكتلي للكروماتوغرافيا الغازية كَشَفَ تحليل اوراق النيم وجود عدد خمسة عشر المركبات منها الاتي: : ، اسيتات لوبيل ) 53.83% ( اسيتات اللانوستيرول ) 28.00% (، حمض هيكساديكانويك ، 2 - هيدروكسي - 1 هيدروكسي استر ) 4.22٪ ( ، حمض 10 اوكتاديكانويك ، ميثيل أستر ) - 3.91% ) 9-12 اوكتاديكانويك ،ميثيل أستر ) 2.61% ( .أكدت الدراسة أن اقصي نقطة تثبيت للاكسدة تم الوصول إليها لكل من مستخلصات اوراق الميثانول والايثر البترولي كانت عند التركيز 50 ملجرام \مل ونسبة التثبيت المنخفض ظهرت عند إستخدام التركيز 0.5 ملجرام.\مل أشارت الدراسة أن لنبات النيم فعالية لافتة لمضادات الأكسدة .Item Mechanistic Analysis of the Cytotoxicity of Some Phenanthridine-1,7,10(2H)-triones via QSAR Modeling(Al-Neelain University, 2020-11) Aia Alfatih MusaAhmmedAbstract(English) The anticancer activity trend of 24 known 3,4-dihydrophenanthridine1,7,10(2H)-triones (DPT) was analyzed through QSAR methodology. Their anticancer activity against human gastric adenocarcinoma (AGS) cell line as IC50 was regressed with the logarithm of their octanol/water partition coefficient (Log P) and molar refractivity (MR). Statistical metrics show poor correlation (R2=0.14 for Log P and R2=0.37 for MR and R2 =0.38 for both Log P and MR combined). As these compounds show good activity against AGS cell line, clustering was utilized to expose possible mechanistically distinct subgroups nesting inside the main data set. This was done through a kind of a previously reported regression clustering procedure based on Log P which was chosen owing to its wide-spread use in QSAR. This procedure was found to yield four clusters with high R2 values (0.6~ 0.8) which exhibit distinct trends in their respective regression lines suggesting different operational mechanism for each. Molar refractivity was used afterwards to give depth to the clustering procedure through emphasizing the distinction of each clusters from the others. According to these descriptor, cluster 1 depend on both Log P and MR (R2s= 0.83 and 0.87 respectively) Cluster 2 depends on Log P and virtually independent from MR (R2s= 0.92 and 0.18 respectively). cluster 3 depends moderately on Log P (R2= 0.60) and completely independent from MR (R2= 0). Cluster4 depends on MR more than its dependence on Log P by one order of magnitude (R2s= 0.83 and 0. 73 respectively). The soundness of the clustering procedure employed was subsequently followed up through the use of some quantum mechanical descriptors. These descriptors include total energy (Et), heat of formation (Hf), dipole moments (Dx, Dy, Dz, Dt), the energy of the highest occupied molecular orbital (εHOMO), energy of the lowest unoccupied molecular orbital(εLUMO), and electrophilicity index(ω), in addition to the enthalpy change due to conversion of quinone form to its hydroquinone (∆HQ-HQ). The impact of the descriptors on each cluster takes a definite pattern implying the presence of mechanistic dissimilarity among them. The first cluster implies mechanism which is dependent on the bulk-dependent thermodynamic parameters of the quinone form, on the dipole moment and on acceptance rather donation of electrons. it is totally independent from thermodynamics of quinone –hydroquinone interconversion. The second cluster suggests a mechanism which is highly dependent on x- and y-components of the dipole, enthalpy change due to quinone-hydroquinone interconversion and moderately on acceptance/donation behavior. The mechanism for second cluster is totally independent from bulk and bulk-dependent thermodynamic descriptors. The third cluster indicates a mechanism which is dependent on enthalpy change due to quinone-hydroquinone interconversion and on x-component of the dipole moment while it is independent from the rest of parameters. The fourth cluster designates a mechanism which depends on acceptance/donation behavior and on y-component of the dipole moment. The soundness of the reported clustering of DPTs is thus reasonably established. Abstract(Arabic) مستخلص البحث تم تحليل توجهات النشاط المضاد للسرطان ل 24 مركب معروف من مشتقات فينانثردينترايون (DPT)عبر منهجية العلاقات الكمية بين النشاط والفاعلية (QSAR). تم تمثيل النشاط المضاد للسرطان والمأخوذ في شكل تركيز المثبط ل 50% (IC50) من خط خلايا السرطان الغدي المعوي عند البشر (AGS) ضد إثنتين من الواصفات الجزيئية لهذه المركبات تشمل لوغريثم معامل التجزؤ بين الماء والأوكتانول (Log P) والإنكسارية الجزيئية (MR) فأظهرت المؤشرات الأحصائية علاقات ضعيفة (معامل الربط الإحصائي R2 = 0.14 لمعامل التجزؤ بينما قيمته للإنكسارية الجزيئية = 0.37 ولهما معا = 0.38). بما أن هذا المركبات تظهر نشاطية جيدة ضد خلايا السرطان الغدي المعوي فقد استخدم التحزيم لإظهار المجموعات المتميزة من حيث آلية العمل والمحتمل اختفاؤها داخل طقم البيانات الأصلي. نفذ هذا التحزيم عبر نوع من طرق التحزيم الانحداري بناء على Log P والذي اُختير بسبب شيوع استعماله في QSAR وُجد أن هذه الطريقة تولد أربع حزم ذات معامل ربط إحصائي عالي (0.6-0.8) والتي تظهر توجهات متميزة في خطوط الانحدار لكل منها مما يوحي بوجود آلية متميزة لكل منها عن آليات الحزم الأخرى. ولإعطاء التحزيم عمقا فقد استخدمنا الواصفة التقليدية الأخري هي MR وذلك للتأكيد على التمايز في آلية عمل المركبات قيد الدراسة. بناء على هذا الواصفة فإن الحزمة الأولى تعتمد على كل من Log PوMR (معاملي الترابط = 0.83 و0.87 على التتابع بينما تعتمد الحزمة الثانية على Log P ولا تعتمد على MR بصورة تذكر (معاملي الترابط = 0.92 و0.18 على التتابع). وكذلك فإن الحزمة الثالثة تعتمد بصورة متوسطة على Log P(معامل الترابط = 0.60) ولا تعتمد نهائيا على MR (معامل الترابط = 0). أما في حالة الحزمة الرابعة فتعتمد علىMR أكثر من اعتمادها على Log P بمقدار رتبة عشرية واحدة (معاملي الترابط = 0.83 و0.73 على التتابع). كفاءة حيثيات التحزيم المستخدمة تمت متابعتها باستخدام واصفات ميكانيكا الكم والتي تشمل الطاقة الكلية (Et) حرارة التكوين (Hf)، عزوم ثنائي القطب (Dx,Dy,Dz,Dt)، طاقة المدار المشغول الأعلى (εHOMO)، طاقة المدار غير المشغول الأدنى (εLUMO)، مؤشر محبة الإلكترون (الالكتروفيلية ω) إضافة تغير الأنثالبي نتيجة لتحول الكينون- هيدروكينون (∆HQ-HQ) تأثير هذه الواصفات على كل حزمة أخذ نمطاً محدداً مدللاً على وجود تباين في آلية العمل بين هذه الحزم. فالحزمة الأولى ألمحت إلى آلية عمل تعتمد على المحددات الثريموديناميكية المعتمدة على الحجم (Et & Hf) أضافة إلى عزم ثنائي القطب كما تعتمد على سحب الإلكترونات عوضا عن وهبها ولا تعتمد تلك الآلية على التغير في الإنثالبي الناشئ عن تحول الكينون-هايدروكينون. تحليل الحزمة الثانية دلل على آلية عمل تعتمد بصور كبير على مكوني عزم ثنائي القطب (Dx & Dy) وعلى (∆HQ-HQ) ولا تعتمد نهائيا على أي من Et أو Hf. الحزمة الثالثة دلت على آلية تعتمد على ∆HQ-HQوعلى مكون عزم ثنائي القطب Dx بينما لا تعتمد على الواصفات الأخرى. وأخيرا فإن الحزمة الرابعة تشير إلى آلية تعتمد على النزوع إلى السحب أو الوهب وعلىDy. وبهذا فقد أثبتنا بصورة منطقية كفاءة طريقة التحزيم التي استخدمت في هذا التحليل.Item Comparative Studies of Chemical Constituents and Genetic Profiles of Seed of Four Gossypium sp varieties BY Nada Makki Abdallh Mostafa M.Sc in Biology (Microbiology) A thesis submitted to the University of ALNeelain in fulfillment of the requirements of the degree of Ph.D.in Biology (Plant Physiology) Department of Biology & Biotechnology Faculty of Science & Technology ALNeelain University Supervisor: Prof. Mawahib ElAmin Mohamed ElNour(ALNEELAIN UNIVERSITY, 2022-12) Nada Makki Abdallh MostafaAbstract The aim of this study was to compare chemical constituents, gossypol content and genetic profiles of seeds oil extracted from three varieties of Gossypium hirsutum L. and variety of Gossypium barbadense L. Cotton seeds used in this study were obtained from the Agricultural Research Corporation (ARC), Wad Medani, Sudan. Seed oils methanolic extracts of Gossypium hirsutum varieties and Gossypium barbadense were screened for their accumulated primary and secondary compounds. The total protein Gossypium hirsutum varieties range (25-22%), while G. barbadense ‘Barakat 90’ was recorded (18%). All four varieties showed low starch content. Flavonoids gave high amount by all varieties. High amount of saponins, steroids and terpenoids were determined from petroleum ether extracts of all varieties. The methanolic and petroleum ether extracts of varieties of seeds tested for their antioxidant activity using DPPH. The antioxidant activity was observed in highest concentration (0.5mg/ ml) of the tested samples. Significant differences (P ≤ 0.05) were detected among different antioxidant potential of G. hirsutum and G. barbadense seeds extracts. Methanolic extracts of seeds of all varieties. were recorded low antioxidant activity. The highest scavenging activity was obtained from the petroleum ether extract from G. hirsutum ‘Hamid’ 63.0 ± 0.12. The content of total phenols in all tested seeds extracts varieties was low. The highest flavonoids content was observed in methanolic extract of seeds of different varieties. Gossypol content in four varieties of cotton grown in Sudan using thin layer chromatography was determined. The varieties of Gossypium sp content gossypol in the seeds oil extract. Physicochemical properties analyses were carried out using standard analytical methods. Results of physical properties showed that the specific gravity at 25C0 were 6.33± 0.12 , 5.18±0.12, 6.73±0.12 and 6.87±0.13 for G. hirsutum ‘ Abden’ , G. hirsutum ‘Seni 1’, G. hirsutum ‘Hamid’ and G. barbadense ‘Barakat 90’ respectively, whereas the refractive index at 25C0 were 1.470±0.21 and 1.474±0.24 for G. hirsutum ‘ Abden’ and G. hirsutum ‘ Seni 1’ , and 1.470±0.24 & 1.475±0.12 for G. hirsutum L.‘Hamid’ and G. barbadense L.‘Barakat 90’ in order. The Density (g/c3) of seed oils were 0.884±0.25 and 0.914±0.29 for G. hirsutum ‘Abden’ and G. hirsutum ‘Seni1’ ,0.935 and 0.939 for G. hirsutum L.‘Hamid’ and G. barbadense L.‘Barakat 90’ in order. pH was 6.25 & 6.42 for G. hirsutum ‘ Abden’ and G. hirsutum ‘ Seni 1’ and 6.76 & 5.76 for G. hirsutum L.‘Hamid’ and G. barbadense L.‘Barakat 90’ in order. The chemical properties of seeds oils of G. hirsutum ‘ Abden’ G. hirsutum ‘ Seni 1’, G. hirsutum ‘Hamid’ and G. barbadense ‘Barakat 90’ are as follows; acid values (mg KOH/ g) 8.1±0.12, 14.1±0.12,7.1±0.01and 20.3±014, free fatty acids (%) 4.0 ±0.11,7.1±0.12,3.3±0.12and 10.3±0.13, peroxide values (meq/Kg fat) is zero in all varieties, saponification value (mg KOH/g) 191±0.01, 194 ±0.01, 188±0.01and195±0.02 and iodine value (I/g oil) 112.8±0.01, 109.9±0.01,113.6±0.01 and 110.4±0.01. The fatty acid profile of seed oils of four varieties were revealed using the gas chromatography-mass spectrometry (GC-MS) technique. The unsaturated fatty acids of G. hirsutum L. ‘Abden’ seed oils were oleic acid 21.27% and linoleic acid 35.43%, while the saturated were palmitic acid 27.87 % and methyl stearate acid (stearic acid) 5.05%. Comparatively, the unsaturated fatty acids of G. hirsutum ‘Seni1’ were oleic acid 25.50 % and linoleic acid 15.61 %, whereas the saturated were palmitic acid 46.07% and methyl stearate (stearic acid) 5.11%. The unsaturated fatty acids of G. hirsutum ‘Hamid’ seed oils were oleic acid 13.11% and linoleic acid 44.25%, while the saturated were palmitic acid 29.16 % and methyl stearate acid (stearic acid) 5.06%.The unsaturated fatty acids of G .barbadense L. ‘Barakat 90’ were oleic acid 22.63 % and linoleic acid 9.65 %, whereas the saturated were palmitic acid 40.12%, methyl stearate (stearic acid) 7.18%. Random Amplified polymorphic DNA (RAPD) markers were used to determine the diversity and relationships among the four varieties of Gossypium spp. The resulted application of the markers 42 bands with 61% polymorphisms and 27 bands with 39% monomorphic. المستخلص هدفت الدراسة الى مقارنة المكونات الكيميائية ومحتوى الجوسيبول والصفات الجينية لزيت و بذور ثلاثة أصناف من القطن الامريكي وصنف واحد من القطن المصرى . تم الحصول على بذور القطن المستخدمة فى الدراسة من هيئة البحوث الزراعية، ود مدنى ، السودان. تم فحص المستخلصات الميثانولية ومستخلص الايثر البترولى فى الاصناف الامريكية الثلاثة والصنف المصرى وتحديد نسبة البروتين والنشا كمواد اولية وكذلك تحديد المواد الثانوية الموجودة فى المستخلصات المذكورة . تراوحت نسبة البروتين الكلي فى الاصناف المريكية (22-25%) بينما سجل صنف بركات المصرى (18%). جميع الاصناف الاربعة تحتوى على نسبة منخفضة من النشا. سجلت المواد الفلافونويدات كمية عالية فى جميع الاصناف ،وتم تحديد الاسيتيرويدات والتيربينات فى مستخلصات الايثر البترولى ومستخلص الميثانول فى جميع الاصناف . تم إختبار مستخلصات الايثر البترولى فى أصناف القطن الامريكي والقطن المصري لتحديد نشاطها كمضادات اكسدة باستخدام طريقة DPPHومقارنتها مع نسبة تثبيط Propyl gallateالقياسية لنشاط ازالة الجذور الحرة DPPH .أعطى تركيز(0.05مجم /مل) للعينات المختبرة اعلى نسبة لمضادات الاكسدة. تم تحديد فروق معنوية P ≤0.05)) بين مختلف مضادات الاكسدة لمستخلصات النوعين المصرى والامريكي. المستخلصات الميثانولية مستخلصات الايثر البترولى لجميع الاصناف سجلت نشاط منخفض كمضادات للاكسدة عدا الصنف حامد الذى سجل نسية 63.0±0.12 من مستخلص الايثر البترولى. محتوى الفينولات الكلى فى جميع اصناف مستخلصات البذور المختبرة منخفضا بينما كانت نسبة الفلافونويد عالية في جميعها. تم تحديد محتوى الجوسيبول فى الاصناف الاربعة المزروعة فى السودان باستخدام كروماتوجرافيا الطبقة الرقيقة ووجد ان الاصناف الاربعة تحتوى على الجوسيبول فى مستخلص زيت البذور .تم إجراء تحليلات الخصائص الفيزيائية والكيميائية للزيوت المستخلصة باستخدام الطرق التحليلة القياسية . أظهرت نتائج الخواص الفيزيائية ان الثقل النوعى عند درجة 25 درجة مئوية كانت 6.33± 0.12 , 5.18±0.12, 6.73±0.12 and 6.87±0.13 لكل من صنف عابدين وصنف الصينى وصنف حامد وصنف بركات على التوالى . فى حين ان معامل الانكسار عند 25 درجة مئوية كان 1.470±0.21 و 1.474±0.24 بالنسبة لصنف عابدين والصيني 1.470±0.24 و 1.475±0.12 لصنفي حامد وبركات بالترتيب.وكانت الكثافة (جم/ج3) لزيوت البذور 0.884±0.25 and 0.914±0.29 لصنفي عابدين والصينى و 0.935 0.939 لصنفى حامد وبركات بالترتيب .وكان الرقم الهيدورجينى 6.25 و6.42 لكل من صنفي عابدين والصيني و6.76 و5.76 لصنفي حامد وبركات .اما الخواص الكيمائية لزيت البذور للأصناف الامريكية والصنف المصري كمايلى: القيم الحمضية (mg KOH/ g) 8.1±0.12, 14.1±0.12,7.1±0.01and 20.3±014 لصنف عابدين والصيني وحامد صنف بركات. اما الاحماض الدهنية الحرة % 4.0 ±0.11,7.1±0.12, 3.3±0.12 و 10.3±0.13، وقيم البيروكسيد((meq/Kg fat) كانت صفر فى جميع الاصناف ، قيم التصبن (mg KOH/g) 191±0.01, 194 ±0.01, 188±0.01 و195±0.02 ) ، وقيمة اليود (I/g oil) 112.8±0.01, 109.9±0.01,113.6±0.01 و110.4±0.01 ) . باستخدام تقنية الكروماتوجرافيا الغازية لقياس الطيف الكتلى(GC-MS) تم تحديد ونسبةا الاحماض الدهنية المشبعة وغير المشبعة. وكانت الاحماض الغير مشبعة فى زيت بذور صنف عابدين كمايلي حمض الاوليك 21.27% و حمض اللينوليك 35.43%, اما الاحماض الدهنية المشبعة حمض البالمتيك27.87 % و حمض السيتريك 5.05%. مقارنة مع صنف الصيني كانت الاحماض الغير مشبعة حمض الاوليك 25.50 % و حمض اللينوليك 15.61 % بينما الاحماض المشبعة حمض البالمتيك 46.07% و حمض الستيريك 5.11% . اما الاحماض الهنية الغير مشبعةلصنف حامد حمض الاوليك 13.11%و حمض اللينوليك 44.25% ، بينما الاحماض المشبعة حمض البالمتيك 29.16 % وحمض الستيريك ) 5.06%. . بينما الاحماض الدهنية الغير مشبعة فى صنف بركات حمض الاوليك 22.63 % وحمض اللينوليك 9.65 % , بينما الاحماض المشبعة حمض البالمتيك 40.12% وحمض الستيريك 7.18% . وتم قياس الاختلاف فى المادة الوراثية او التركيب الجينى بين الاصناف الاربعة باستخدام RAPD markers. تم اختبار 15 نوع من primers .Item Brachytherapy Dosimetry for 125I source using Monte Carlo N-Particle Code(ALNEELAIN UNIVERSITY, 2022-10) Aya Nasraldeen Karar BabikrAbstract: Sealed 125I sources are use as permanent implants sources for prostate cancer Low Dose Rate (LDR) brachytherapy. it decreases dose with radial distant because of low energy emission (35.5 KeV) and higher dose rate due short half-life (59.4 days) which makes it suitable for this purpose. Many designs of encapsulated sources are available, including the type Source Tech Medical model STM1251 source. In order to produces dosimetric accuracy in Source Tech Medical model STM1251 source, dosimetric parameters such as anisotropy function F (r, θ) and radial dose function g(r) were investigated, the Monte Carlo N-Particle code MCNP was used for modeling STM1251 source and measuring the dosimetric parameters of the source. MCNP visual editor version (vised 5-38C-16D) which was used in this work is a general purpose Monte-Carlo radiation transport code, full details of Source Tech Medical model STM1251 source (dimensions, materials and energy spectrum) were implemented in MC simulations. STM1251 source was centered in 30×30×30 mm³ water phantom and the anisotropy function calculated by 0.02 cm spheres were bounded with two oblique distances 0.5 cm and 1.0 cm with interval angle of 10̊, just from 0̊ to 90̊ due to symmetry of the source geometry and in order to reducing errors and time, radial dose function calculation the dose was scored in spheres with different sizes(0.02, 0.8, 0.2) cm with range of distances (0.25, 0.5, 0.75, 1.0, 1.5, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10) cm so to compromise between accuracy and spatial resolution, input program was run with sufficient number of particle histories about 500 million, stared until one week to minimize statistical uncertainties and to become insignificant. The dosimetric parameters needed for dose calculation using the American Association of Physicists in Medicine Task Group No. 43 (TG-43) formalism were determined and compared with the results of a Monte Carlo simulation by an independent research group and with the TG-43 consensus values of the well-established model, as well as Carleton university research group. This study was focused on the dosimetry parameters of the model STM1251 source. Our results for anisotropy function F (r, θ) compared with AAPM TG43U1 (2004) and Carleton group (2007) at distance r=0.5cm and r=1cm from the source were (18% for θ≤10̊, 3% for θ≥70̊) and (1cm 9% for θ≤10̊, 8% for θ≥70̊) respectively. The high gradient for anisotropy function especially at shorter distances may due to source self-absorption and filtration of photon, the values of radial dose g(r) were significantly (p-value (0.05<<. different with previously published data by AAPM 43U1 (2004) and Carleton group (2007) in 54% for r≤1.5cm, 10% for r≤10cm. This may due to the approximation used for the merged three thin layers. According to our observations selecting long simulation time or low energy cutoff is key to obtain more accurate simulation results, a lot of corrections factors necessary to get accurate result special Geometry factor and Scatter factor, should put in consider water Phantom Not completely tissue equivalent, Carleton university group they recommended it good to apply polynomial equation to fitting of radial dose function value. المستخلص: يستخدم اليود 125 المشع كمصدر دائم للعلاج من مسافة قريبة لسرطان البروستاتا ذا الجرعة المنخفضة (LDR) حيث تقل الجرعة في الاعضاء المجاورة للبروستاتا كلما ذادت المسافة من المصدر بسبب انبعاث الطاقة المنخفض (35.5 كيلو فولت) ومعدل الجرعة الأعلى بسبب قصر عمر النصف (59.4 يومًا) مما يجعله مناسبًا لهذا الغرض. تتوفر العديد من تصميمات المصادر المغلفة ، بما في ذلك مصدر نموذج Source Tech Medical طراز STM1251 . من أجل إنتاج دقة قياس للجرعات في مصدر نموذج STM1251 من Source Tech Medical ، تم التحقق من قياس للجرعات مثل دالة تاثير الزاوية (r ,θ)F ، ودالة تاثير المسافة g (r) ، تم استخدام كود Monte Carlo N-Particle MCNP لنموذج STM1251 المصدر وقياس معاملات قياس الجرعات للمصدر. MCNP من الطراز (vised 5-38C-16D) الذي تم استخدامه في هذا العمل هو كود مونت كارلو للأغراض العامة ، تم تنفيذ التفاصيل الكاملة لمصدر Source Tech Medical نموذج STM1251 (الأبعاد والمواد وطيف الطاقة) في MC المحاكاة. تم توسيط مصدر STM1251 في حوض مائي 30 × 30 × 30 مم، وتم تحديد دالة تأثير الزاوية بواسطة كرات 0.02 سم بمسافتين مائلتين 0.5 سم و 1.0 سم بزاوية فاصلة 10̊ ، فقط من 0̊ إلى 90̊بسبب تناظر هندسة المصدر ولتقليل الأخطاء والوقت ، حساب دالة تأثير المسافة ، تم تسجيل الجرعة في كرات بأحجام مختلفة (0.02 ، 0.8 ، 0.2) سم مع مدى مسافات (0.25 ، 0.5 ، 0.75 ، 1.0 ، 1.5 ، 2 ، 3 ، 4 ، 5 ، 6 ، 7 ، 8 ، 9 ، 10) سم ، تم تشغيل البرنامج بعد ضبط اسبوع واحد لتتبع 500مليون من الفوتونات المتفاعلة وكان ذلك كافٍ للمحاكاة. تم تحديد معاملات لحساب الجرعة اللازمة بالرجوع الي توصيات الجمعية الأمريكية للفيزياء في الطب رقم 43 TG-43) ) ومقارنتها بنتائج محاكاة مونت كارلو بواسطة مجموعتنا البحثية ، بالإضافة إلى مجموعة أبحاث جامعة Carleton. ركزت نتائج هذة الدراسة على معاملات القياس الإشعاعية للمصدر الإشعاعي (STM1251 ). و بمقارنة نتائج هذه الدراسة مع AAPM TG43U1(2004) والنتائج المنشورة للمجموعة البحثية لجامعة كارلتون Carleton (2007) وجد أن تباين تاثير الزاوية( F (r θ) ) على بعد 0.5 سم يساوي ( 18% للزوايا ≤ 10̊ و 3% للزوايا ≥ 70̊). و وجد بانه يساوي (( 9% للزوايا ≤10̊ و 8% للزوايا ≥ 70̊ ) على بعد 1 سم من المصدر. اختلاف بشكل ملحوظ القيم للمسافات القريبة من المصدر مع الدراسات السابقة قد يكون نتيجة للامتصاص في الطبقات الداخلية للمصدر (فلترة الفوتونات). كما تبين بأنه يوجد تباين بين نتائج هذه الدراسة و الدراسات السابقة لنتا لقياسات الإشعاعية تاثير المسافة g (r) و هذا الأمر من الممكن أن يكون نتيجة لدمج الثلاث طبقات الرفيعة جداً للمصدر بغرض تسهل بناء نموذج محكاة المصدر. وفقاً للملاحظات يعد اختيار زمن المحاكاة الطويل واختيار مدى طاقة منخفض امراً أساسياً ومهما للحصول على نتائج محاكاة اكتر دقة كما يمكن تطبيق العديد من المعاملات التصحيحة من معامل تصحيح ومعامل تصحيح التشتت ، بجانب ذلك الحوض المائي القياسي ليس مكافئ تماماً لأنسجة جسم الانسان ، المجموعة البحثية من جامعة كارلتون أوصت بتطبيق معادلة كثيرة الحدود عند حساب دالة تأثير المسافة.Item Eco-taxonomy of the Vegetation of Zalingei Locality, Central Darfur State – Sudan(ALNEELAIN UNIVERSITY, 2022-08) Ekhlas Abaker Khlyfa AbdallahABSTRACT The main objective of this study is to document the vegetation status and plant diversity in Zalingei locality - Central Darfur State - Sudan and to provide an updated species list. The field work was carried out in the period from January 2018 to December 2020 covering both dry and wet seasons. The work was split into two phases. In the first phase all plant species available in the study area were obtained through intensive field investigations. Classification, identification, updating the scientific names and synonyms of plant species and preparation of herbarium specimens was carried out using standard methods in the available literature. The second phase includes assessment of quantitative ecological characteristics of the vegetation communities, determining species composition, density, dominance, richness, evenness, similarity and species diversity of the vegetation; to determine their importance as a natural resource to the locals. For these studies 6 sites (3 of which in hill slopes and 3 in plains) were selected depending on differ topography and soil types. For assessing mature woody species and natural regeneration systematic circular sample plots design was use and for herbaceous species m² quadrate was used. Important value Index (IVI) was calculated to estimate the phytosociological characteristics of mature and regenerating woody species, and the herbaceous cover. The Shannon Wiever, and Margalof indices were used to assess species diversity and Pielous for eveness, and Sorensen for similarity between the studied sites was assessed. Taxonomically the results cover 256 plant species included in 167 genera belonging to 52 families and grouped into 12 clades. Most of the species belonging to the clade Mesangiosperms/ Eudicots /Superrosids/Rosids/ Fabids. The family Fabaceae (Leguminosae) and Poaceae are well represented in Zalingei locality. Fabaceae (Leguminosae) recorded the highest number of species (50) followed with Poaceae which is represented with 30 species. From the recorded 256 species 76 are woody (including 7 exotic species) and 180 are herbaceous species. The vegetation comprised a variety of different life-forms most are therophytes 46.09%, phanerophytes 29.69 %, chamaephytes 19.92 %; the remaining are hydrophytes, hemicryptophytes, geophytes, and epiphytes. The majority of the plant species have important economic uses. The results also revealed that all the recorded woody and most herbaceous plants have had significant, impacts on people’s livelihood strategies. They have various contributions from cash income to multiple other uses such as fodder, traditional medical uses, construction material, fuel wood, fruits, food, shelter, environmental, industrial and recreation. The collected specimens were deposited in Alneelain and Zalingei Universities, and the Forestry Research Center herbaria. Ecologically the phytosociological characteristics revealed the presence of 33 woody species inside sampled plots. Four woody species are dominating the studied area; Senegalia senegal in site 1 and 4 in the low hill slopes, Albizia amara in site 3 in stony hill slope, Dichrostachys cinerea in sites 2 and 5 in plains and Vacellia nilotica in site 6 in a sedentary plain. Species density is high in the area with varying amounts between sites. Four sites (1, 3, 5 and 6) recorded high diversity values. Site 4 recorded medium diversity values and site 2 recorded the lowest values. The percentage similarity between the sites is relatively high. The results revealed the presence of 60 herbaceous plant species inside sampled plots. 4 species dominating the studied area Spermacoce chaetocephala in site 1 in low hill slope, Dactyloctenium aegyptium in site 6 and 2 in plains, Aristida mutabilis in site 3and 4 low hill slope, Echinochloa colona in site 5 in plains. Species density is high in the area with varying amounts between sites. Site 5 and 2 recorded high diversity values. Site 3 and 6 recorded medium diversity values and site 1and 4 recorded the lowest values. The percentage similarity between the sites is relatively low. Generally, the results showed relative differences between the sites in species composition in the study area. It is clear that human activities and climate change are the main factors which affect Zalingei locality so conservation of the natural vegetation is recommended. The studied area includes important medicinal plants which can be utilized in the pharmaceutical industry and natural herbal remedy, and hence it can be a source of income to the local inhabitants and the country. الملخص بالعربي الهدف الرئيسي من هذه الدراسة هو توثيق التنوع وحالة الغطاء النباتي في محلية زالنجي بولاية وسط دارفور – السودان و تقديم قائمة محدثة للأنواع النباتية. تم تنفيذ العمل الميداني في الفترة من يناير 2018 إلى ديسمبر 2020 وشمل كل من الموسم الجاف والممطر. تم تقسيم العمل الي مرحلتين: في المرحلة الاولي تم جمع جميع أنواع النباتات المتوفرة في منطقة الدراسة من خلال الزيارات الميدانية المكثفة. تم تصنيف وتحديد وتحديث الاسماء العلمية والمرادفات للأنواع النباتية وأعداد عينات المعشبة بالطرق القياسية في الأدبيات المتاحة. شملت المرحلة الثانية تقييم الخصائص البيئية الكمية للمجتمعات النباتية، وتحديد تركيب الأنواع، الكثافة، السيادة، الثراء، التكافؤ، التشابه والتنوع في أنواع النباتات لتحديد أهميتها كمورد طبيعي يستفيد منه السكان المحليين. في هذه الدراسة تم اختيار 6 مواقع (3 منها في منحدرات التلال و 3 في السهول) اعتمادًا على التباين في التضاريس وأنواع التربة. لتقييم الأنواع الخشبية الناضجة والتجدد الطبيعي فيها استخدم منهج التصميم الدائري لاخذ العينات، و للأنواع العشبية استخدم نظام المربعات (م²). تم حساب مؤشر قيمة الاهمية النسبية (IVI) لتقدير الخصائص الاجتماعية النباتية للأنواع الخشبية (الأشجار الشجيرات) الناضجة والمتجددة والغطاء العشبي. استخدمت مؤشرات Shannon و Wiever و Pielous وMargalof لتقييم تنوع الأنواع و Sorensen للتشابه بين مواقع الدراسة . تصنيفيا شمل النتائج 256 نوعا نباتيا يشمل 167 جنسا تنتمي الي 52 عائلة تم تجميعها في 12clades معظم الانواع تنتمي إلي مجموعة كاسيات البذور Messangiosperms/ Eudicots /Superrosids/Rosids/ Fabids . أظهرت النتائج أن العائلة البقولية والنجيلية ذات تمثيل عالي في منطقة زالنجي. فالعائلة البقولية شملت اكبر عدد من الأنواع (50) تليها النجيلية متمثلة بثلاثون (30) نوعاً. كما أظهرت الدراسة اختلاف طرز الحياة في النباتات المتحصل عليها حيث كانت 76 نباتات خشبية (شملت 7نوع مستجلب من خارج السودان) و 180 نوعاً عشبياً. تتالف النباتات من مجموعة متنوعة من طرز الحياة فكان معظمها نباتات عشبية حولية (46.09٪)، والخشبية 29.69 ٪، العشبية المعمرة 19.92٪، البقية هي من النباتات المائية و نباتات تنمو بالقرب من سطح الأرض و نباتات ذات سيقان أرضية و نباتات الهوائية. غالبية الأنواع النباتية لها استخدامات اقتصادية مهمة، أظهرت النتائج أيضًا أن جميع النباتات الخشبية ومعظم الأعشاب المسجلة كان لها تأثير كبير على استراتيجيات معيشة السكان المحليين. ولها مساهمات مختلفة في الدخل النقدي إلى جانب استخدامات أخرى متعددة مثل العلف والاستخدامات الطبية التقليدية ومواد البناء وخشب الوقود والفواكه والغذاء والمأوى والاغراض البيئية والصناعية والترفيهية. تم ايداع العينات التي تم جمعها في جامعتي النيلين وزالنجي ومركز ابحاث الغابات. في الدراسات البيئية الكمية أظهرت نتائج الخصائص الاجتماعية النباتية الي وجود 33 نوعاً شجرياً داخل مواقع اخذ العينات. ثبت وجود أربعة انواع خشبية سائدة في منطقة الدراسة هي الهشاب(Senegalia senegal) في الموقع 1 و 4 في منحدرات التلال المنخفضة، عرد (Albizia amara) في الموقع 3 في منحدر التل الصخري ، كداد (Dichrostachys cinerea) في الموقعين 2 و 5 في السهول و قرض- سنط (Vachellia nilotica ) في الموقع 6 في سهل مستقر. كثافة الأنواع عالية في المنطقة مع تباين كمي بين المواقع. سجلت أربعة مواقع (1 و 3 و 5 و 6) قيم تنوع عالية. سجل الموقع 4 قيمة تنوع متوسط وسجل الموقع 2 أدنى قيمة للتنوع. النسبة المئوية للتشابه بين المواقع عالي نسبيا. تشير النتائج الي وجود 60 نوعاً من النباتات العشبية داخل مواقع اخذ العينة. يسود في منطقة الدراسة 4 انواع هي محلب- تمر الفار (Spermacoce chaetocephala) في الموقع 1 في منحدر التل المنخفض أبو أصابع (Dactyloctenium aegyptium)، في الموقع 6 و 2 في السهول ،القو (Aristida mutabilis) في الموقع 3 و 4 منحدر التل المنخفض و الدفرة (Echinochloa colona) في الموقع 5 في السهول. كثافة الأنواع عالية في المنطقة مع تفاوت كمي بين المواقع. سجل الموقعان 5 و 2 قيم تنوع عالية، سجل الموقعان 3 و 6 قيم تنوع متوسط وسجل الموقع 1 و 4 أدنى قيم للتنوع . النسبة المئوية للتشابه بين المواقع منخفضة نسبياً. عموماً أظهرت النتائج اختلافات نسبية بين المواقع في تركيب الأنواع في منطقة الدراسة. اتضح ان الأنشطة البشرية وتغير المناخ هي العوامل الرئيسية التي تؤثر علي منطقة زالنجي لذلك نوصي بالحفاظ علي الغطاء النباتي الطبيعي. تحتوي منطقة الدراسة علي نباتات طبية مهمه يمكن الاستفادة منها في صناعة الادوية والعلاج بالاعشاب الطبيعية , لذلك نوصي بالعناية بها لانها يمكن ان تكون مصدر دخل لسكان المنطقة وللبلاد.Item Determination of Conventional Sugars in Some Sudanese Honey Samples(AL-Neelain University, 2014) SHEEREEN MOHAMMED ABD ALLAH MOHAMMEDThe aim of this research is to determine the percentage of conventional sugars (glucose, sucrose fructose and maltose) in three honey samples collected from BORAM and JEBEL MARRA and KRFAI . The value of refractive index, PH and water content were measured and obtained to be : refractive index 1.49 , 1.49 and 1.489 respectively.PH 4.00 , 4.40 and 4.29 respectively .water content 20 , 19 and 12.6 respectively. The percentage of glucose and fructose and sucrose determined by classical methods (lane-Eynon and iodometric titration) were 36.2 . 37.48 and 35.2 respectively in Boram sample 33.9 , 36.5 and 3.9 in Jebel Marra sample 40.0 ,19.66 andll.36 in Krfai sample. The percentage of glucose and fmctose, sucrose, and maltose determined by HPLC were in Boram sample 31.98 , 38.41 , 0.423 and 1.249 in Jebel Marra sample 35.32 , 37.41 , 0.702 and 0.790 in Krfai sample 35.80 , 33.40 , 15.71 and zero The results obtained by HPLC were usually more accurate , because the technique is more sensitive compared to classical methods From estimation (Fructose / glucose)F/G ratio we found that honey of Boram and Jebel Marra seem to be more genuine ,but the honey of a Krfai may be mixed with other sweeteners most probably cane honey or molasses (artificial honey).Item Assessment of Metals in Pigeon pea and Grewia tenax (Algudim)(AL-Neelain University, 2014) Zeinab Hussain Hassan AbdallaThis study was conducted on the pigeon pea collected from White Nile State and grawia tenax collected from Aldeain area in northDarfur State to determine the concentration of some essential trace elements such as (Ca, Mg, Zn, Fe) by using AAS and UV visible spectroscopy . The result ofpigeon pea analysis by AAS showed a high concentration of Magnesium (77.9 ppm), and (7.1538 ppm) of Ca ( 6.1758 ppm) of Zn and low concentration ofFe (0.7993 ppm). The grawia tenax revealed the following Ca concentration is high (60.03l2 ppm), Mg (4.6912 ppm), Fe (l.0864 ppm), and Zn was found at low concentration(0.387 ppm). The Assessment of iron using UV visible spectroscopy in both samples, it was found that the concentration of iron is fairly identical. -Item Assessment of Lead and Cadmium in Lipstick from Local Markets in Khartoum State(AL-Neelain University, 2014) Suliman ahmedEvidence of the use of cosmetics, including lipsticks has been found in civilizations as early as ancient Mesopotamia. Many of the cosmetics used throughout history have contained potentially toxic elements and other contaminants. Ancient Egyptians used cosmetics containing large amounts of lead and cadmium. Modern cosmetic is perceived to be free of dangerous toxins due to the widespread regulations of many consumer products. Heavy metals toxicity to the humans and animals is the result of long term, low or high level exposure to pollutants common in our environment including air we breathe, water, food etc. A part from these, numerous consumer products like cosmetics and toiletries have been reported as source of heavy metal exposure to human beings. Heavy metals like lead and cadmium may result in poisoning and skin problems. This study concerns about determination of two toxic metals lead and cadmium, and the main purpose is to examine the potential for lead and cadmium contamination in lipsticks. l6 lipsticks from different brand and countries and different colors were tested for the presence and amount of lead and cadmium by ICP.OES and F—AAS Standard addition technique and used for comparison of contents of lead and cadmium concentration. All samples of lipstick were higher than US-FDA Standard (0.lppm) for lead and cadmium and the average of the lead contents in colors were 5.385ppm for blood red color, 4.485ppm for pink color and 3.602ppm for strawberry color. While the average of the cadmium contents in colors were 2.872ppm for blood red color, l.8l7ppm for pink color, l.772ppm for strawberry color and l.649ppm for brown color.Item Assessment of Trace Elements in Carrots(AL-Neelain University, 2014) Somaia Abd-Alhafeez Hamad HassanCarrot is the most useful vegetable certain for supplying the human body with important elements. The aim of this study is to determine the concentration of trace elements (calcium, magnesium, iron and potassium) in carrot samples by using atomic absorption spectroscopy. The results revealed the highest concentrations of these elements are calcium (13.1 18) ppm (16.95) ppm (14.024) ppm.