علوم - ماجستير
Permanent URI for this collectionhttps://repository.neelain.edu.sd/handle/123456789/510
Browse
Item Application of Molecular Techniques for Identification of Insects Blood meal(AL-Neelain University, 2015) Olla Mohammed Awad MohammedAbstract Malaria and leishmaniasis are endemic diseases in Sudan and they represent major health problems. Malaria is caused by Plasmodium spp and transmitted by mosquitoes while leishmaniasis is caused by Leishmania parasites and transmitted by sand flies. The life cycle of the two parasites includes many wild and domestic reservoir hosts. Identification of the insect vector, its preferred habitats and different habits represent a milestone in designing control programmes. The objectives of this study were to evaluate the effect of two different DNA extraction methods (Collin’s method and Steiner’s method), in the quantity and quality of extracted host DNA from the blood meal of the insect vector, and to apply a RFLP- PCR protocol to identify the source of the blood meal which can be used as an indicator of the host-preferences of the vector. Wild sandfly specimens were collected from a leishmaniasis endemic site in Gedarif State, Southeastern Sudan, while blood fed female Anopheles arabiensis mosquitoes were obtained from a laboratory colony reared at the Department of Medical Entomology, Ministry of Health. The quantity and quality of extracted DNA was measured using Nanodrop spectrophotometer and the efficiency of each of the extraction methods used was estimated by comparing the quality and quantity of the extracted DNA using statistical analysis. All the extracted blood meal samples were screened twice, one time for the presence of human blood and another time for the presence of animal blood. Positive and negative controls were run simultaneously with the samples to ensure no contamination occurs during the extraction steps, and only DNA from extracted blood meal is amplified not the DNA from insect itself. The two extraction methods showed significant differences (p<0.05) in the quantity and purity of the extracted DNA with Steiner’s method was found to be suitable for DNA extraction from sandflies. The two extraction method didn’t show any significance difference (p>0.05) in the DNA concentration for mosquito samples. However, a significant difference (p<0.05) was observed when sandfly samples were used, with Steiner method produced much DNA concentration than Collin’s one. On the other hand, Steiner method showed high ii ratio of protein contamination in both mosquito and sandfly specimens. While Collin’s method showed a higher ratio of other contaminants for mosquito specimens. No PCR products were obtained when the primers amplifying human blood were used for sandfly samples. It couldn't be confirmed that no amplification were obtained due to the low human DNA concentration in the blood meal or because there was no human blood in the extracted samples. Or may be humans were not preferred hosts for the collected sand flies. Concerning mosquito samples, no human DNA was amplified because the used specimens were from a colony which has been fed by a cow blood. Only 9 sand flies and 3 mosquitoes gave bands when amplified using the animal primer pairs. This indicates that animals were available at the collection sites and they were preferred hosts. When the amplified bands were digested using Hae III restriction enzyme which digests the amplified cyt b fragment from the vertebrates host blood; no bands were observed. This may be due to the low concentration of the amplified fragment or the inefficiency of the enzyme in recognizing the restriction sites. Large number of freshly collected samples, inclusion of a DNA purification step and the use of more sensitive molecular approach were recommended. iii ملخص البحث یعتبر مرضي الملاریا و اللیشمانیا من الامراض المنقولة بنواقل حشریة وھما من الامراض المستوطنة فى السودان ومن ابرز المشاكل الصحیة بالقطر. یسببھما طفیلي البلازمودیوم و اللیشمانیا كما ینقل المرضین بواسطة نواقل من الباعوض و الذباب الرملي على التوالى. تشمل دورة حیاة الطفیلین العدید من الحیواناتالبریة و الألیفة التى تمثل عائل خازن للطفیل . یعتبر تصنیف الانواع المختلفة من النواقل و دراسة عاداتھا و عوائلھا المحببة من اھم ركائز برامج مكافحة المرض. تتمثل أھداف ھذه الدراسة فى تقییم كفاءة طریقتین مختلفتین لاستخلاص الحمض النووى على اساس كمیة و نوعیة الحمض المستخلص من وجبة الدم لعینات من الباعوض والذباب الرملي و التعرف على العوائل المحببة للأجناس و من خلال التعرف على مصدر وجبة الدم التى تتغذى علیھا ھذة الحشرات. تم جمع عینات الذباب الرملي المتغذیة على الدم من ولایة القضارف فى جنوب شرق السودان . وتم الحصول على عینات الباعوض متغذیة على الدم من مستعمرة تمت تربیتھا داخل معمل. تم استخلاص الحمض النووى من وجبة الدم داخل الحشرات بطریقتین مختلفین: طریقة تم تطویرھا بواسطة كولین ( 1987 ) و طریقة تم تطویرھا بواسطة ستینر ( 1995 ). تم قیاس كمیة و نوعیة الحمض النووى المستخلص باستخدام جھاز النانو دروب. و تمت مقارنة كفاءة الاستخلاص لكل من الطریقتین بمقارنة كمیة ونوعیة الحمض المستخلص بواسطة التحلیل الاحصائى . تم استخدام زوجین مختلفین من البادئة النوویة لتضخیم اجزاء مختلفة من جین ( سیتوكروم ب) الخاص بالحمض النووى للمیتوكندریا. تعمل ھذه البادئات على تضخیم اجزاء ذات احجام مختلفة لعینات دم الانسان و الفقاریات الاخرى . تم الكشف على جمیع العینات المستخلصة من الحمض النووى مرتین، مرة للكشف عن وجود دم الانسان ومرة اخرى للكشف عن دم الحیوان، كما تم استخدام نوعین من العینات الحاكمة الموجبة والسالبة وذلك للتأكد من عدم وجود ملوثات اثناء خطوات الاستخلاص المختلفة و للتأكد من ان العینات المتضخمة بتفاعل البلمرة التسلسلى ھى للحمض النووى للعائل و لیس لاناث الذباب و الباعوض. لم تظھر طریقتى الاستخلاص اختلافا واضحا فى تركیز الحمض النووى بالنسبة لعینات الباعوض ، فى حین اظھرتا اختلافا واضحا فى تركیز الحمض النووى فى عینات الذباب الرملى حیث كان تركیز الحمض النووى اعلى بكثیر فى عینات الذباب المستخلصة ب طریقة ستینر مقارنة مع المستخلصة بطریقة كولین. اظھرت طریقة ستینر نسبة اعلي من تلوث الحمض النووى بالبروتین قي عینات الذباب والباعوض. بینما اظھرت طریقة كولین نسبة اعلي من تلوث الحمض النووى بالملوثات الأخرى فى عینات الباعوض، فى حین لم یوجد اختلاف واضح بین عینات الذباب الرملى.Item Assessment of Sub-acute Toxicity of Mercury on Wistar Rats(Al Neelain University, 2015) Limia Khateim Salh MohmmedMercury is a metallic element, used in dental amalgams, cosmetic products and some industrial manufacturing. Study aim ed to investigate the effects of various oral doses of mercuric chloride , on the growth, biochemical, hematological and pathological characteristics of treated Wistar rats. The rats were allotted to 4 groups, each of six rats. Group one res e r ved as control. Groups 2, 3 and 4 were given mercuric chloride in daily oral doses of 1 , 3 , and 9mg/kg/day for 3 weeks. The weight gain, hematological and serobiochemical parameters were recorded in addition to pathological changes and certain behavioral changes were observed in rats during the experiment period at 3weeks . The doses (1,3 and 9 mg/kg/day selected were somewhat toxic and leth al to Wistar rats and caused gradual reduction of reflexes, inability to move and huddling together, significant de crease in weight, hepatotoxicity, nephrotoxicity and neurotoxicity and alteration in AST, ALT, ALP, Total protin ,Globulin,Creatinine, urea co ncentration and granulocytosis inaddition to alteration in blood concentration of RBC, PCV,MCHC, MCH , MCV and Lymphocytes. The damage to vital organs of rats given daily oral doses of 1 mg/kg mercuric chloride was less marked. We concluded that 3 weeks administration of the various oral doses of mercuric chloride 3 and 9mg/kg/dayis toxic to Wistar rats.Item Association of FOK1 gene mutation (Exon2,codon 38) with breast cancer in Sudanese female patients(AL-Neelain University, 2017) IMTENAN MOHAMMED AL HASSAN MUSSA AHMADAbstract Introduction: Breast cancer is the major cancer affecting Sudanese female. VitaminD receptor (VDR) gene plays a central role in cell cycle control, initiation of apoptosis and regulation of genes involved in cellular growth, differentiation, invasion and metastasis of tumour cells . Mutation in VDR-FOK1 gene at Codon 38 exon 2 was reported to be associated with many types of diseases including cancer. Aim: This study aimed to investigate the possible association between VDR-FOK1 polymorphism at Codon 38 exon 2 and the susceptibility to breast cancer among Sudanese female patients. Methodology: A hospital based case control study was conducted. A total of 30 female patients with breast cancer were enrolled in this study. Demographic data and other data regarding age, ethnic and family history were obtained using pre-designed questionnaire. Tumor and normal tissue samples were collected from each patient for DNA extraction. DNA extraction was performed using guanidine chloride method followed by PCR for genotyping. The VDR- FOK1 exon 2 Codon 38 genotypes were determined by (PCR-RFLP) analysis. The PCR products were digested with FOK1 restriction enzyme and the DNA fragments were then detected by electrophoresis in 2% agarose gel. Results obtained were statistically analyzed using SPSS and Excel program. Result: From demographic data, the highest incidence of breast cancer was among the age group (30-40) years representing 27% with a mean age 40 years, 41% of patient subjects from canteral and 64% had family history and 77% diagnosed as invasive ductal carcinoma, 57% in grade II and 50% in stage III. The most common genotype in tumor tissue is heterozygous mutant c\t 79.3%, followed by 20.7% wild type and 0.0% homozygous mutant. While in control tissue the most common genotypes wild type 66.7% followed by 33.% heterozygous mutant. With significant association between mutation in VDR-FOK1 gene exon 2 codon 38 in tumor and control (P<. 0. 000) .No association was found between VDR-FOK1mutation at codon38cc was at different tumor stage (P<. 0.17) and grade (P<. 0.73) . Conclusion: Heterozygous mutation in VDR-FOK genotype occurred in tumor tissue more than in control tissue taken from same patient and this results indicate that mutation in VDR-FOK gene at codon3 8 cc is one of the factor that contribute to the development of breast carcinogenesis in Sudanese female. مستخلص البحث مقدمة: سرطان الثدي هو السرطان الرئيسي الذي يصيب الإناث السودانيات. مستقبلات فيتامين د VDR)) تلعب دورا عاما في السيطرة على دورة الخلية، والشروع في موت الخلايا المبرمج.وتمايز الخلايا وهجرة الخلايا السرطانيه اثبتت الدراسات ان الطفرات في الجين VDR-FOK1 بها علاقة بالاصابة بالامراض المختلفة والبسرطان. الهدف من البحث: هدفت هذه الدراسة إلى التحقق من إمكانية وجود إرتباط بين تعدد الأشكال في تسلسل معلومات النظام الجيني (VDR-FOK1) في( exon 2 ,codon 38 والقابلية للإصابة بسرطان الثدي بين المريضات السودانيات. المنهجية: أجريت هذه الدراسة على 30 مريضة مصابة بسرطان الثدي من مستشفى الشريف. وقد تم الحصول على البيانات الديموغرافية وبيانات أخرى تتعلق بالعمر والتاريخ العرقي والعائلي بإستخدام إستبيان صمم لهذه الدراسة. تم جمع عينات من أنسجة المرضى (عينة سليمة وعينة من الورم من كل مريض) لإستخلاص الحمض النووي. تم إستخلاص الحمض النووي بإستخدام طريقة كلوريد الغوانيدين ومن ثم تم تحديد معلومات النظام الجيني لمورثات (VDR-FOK1) فيexon 2codon38 بواسطة تفاعل البلمرة التسلسلي –ثم قطعها بواسطة انزيمات قطع متخصصه (FOK1) اعتمادا على طول الموروثه والتعدد الجيني بها ثم تحليلها. و تم الكشف عنها بواسطة جهاز الرحلان الكهربي في 2% هلام. تم تحليل النتائج بإستخدام برامج SPSS الإحصائية و Excel . النتائج: أوضحت البيانات الديموغرافية ان اعمار المرضى تراوحت بين بمتوسط عمري 50 عاما و ان إرتفاع معدلات الإصابة بسرطان الثدي بين الفئة العمرية )30-40) سنة التي تمثل.23% من المرضى . 41% من المرضى من وسط السودان . سرطان القنوات المتفشية هو النوع الاكثر شيوعا لاورام الثدي (77% ). أوضحت النتائج أن معظم المرضى تم تشخيصهم في مراحل متقدمة للمرض 50% في المرحلة التانيه و الثالثة و 57% في الطور الثانى . أوضحت النتائج التحليل الجيني أن النمط الجيني الأكثر شيوعا في أنسجة الورم هو النوع T C\بنسبة 79.3%واقل انتشارا في النمط الجيني C\Cبنسبة20.7% . أما بالنسبة للأنسجة السليمة كان النوع الأكثر شيوعا في النوع C\Cبنسبة 66.7%, يليه في النوعC\Tبنسبة33.3% . أوضح تحليل النتائج وجود علاقة معنوية بين الطفرة فيItem Brain function alterations in long-term type-1 diabetes mellitus-like disease induced by streptozotocin in Wistar rats and assessment of histopathological bases.(AL-Neelain University, 2017-03) Sayed Yousif Osman ElSheikhABSTRACT The present study was aimed at assessing the physiological and histological changes in rats following experimental induction of diabetes mellitus-like disease through injection with streptozotocin (STZ). Twenty healthy male rats (Wistar strain, weight 353±90 g, 3 months old) were kept in under a 12/12 h dark-light cycle, at 23.4ºC. They had free access to normal rat chow and tap water. These animals were divided in two groups injected once with either STZ (60 mg/kg, treatment group, 12 animals) or saline (same volume as STZ, control group, 8 animals). Then animals were monitored for 8 months (long-term diabetes model). Behavioural studies (hole board and pole tests) and histological tests were performed, and physiological parameters monitored (glycaemia, body weight). Results of these two groups were analysed using Mann-Whitney U-test, and difference were significant for P<0.05. Behavioural tests’ results revealed that diabetic animals displayed, compared to control group: (i) decreased head-dipping episode number (p<0.05) and increased latency to the first grooming episode (p<0.001); (ii) decreased total locomotor activity and pole time (38 time pole/s, P <0.001), as well increased t-turn time (45%, P <0.01). Also compared to control animals, histological studies in diabetic animals revealed: (i) an increased meningeal thickness and a higher density of circulating cells in the meninges (p<0.05); (ii) mitochondrial alterations such as swelling and/or vacuolation in neuronal cells; (iii) neuronal cell apoptosis; (iv) microglia-like cells and myelin disturbances in the neuropil; as well as (v) numerous activated brain macrophages. Glycaemia was also higher, and body weight lower, in the diabetic group. In conclusion, diabetes mellitus-like disease was marked by cognitive and motor changes possibly due to damage and loss in neuronal populations emerging partly from physiology alterations characteristic of the disease. مستخلص البحث هدفت الدراسة الحالية إلى تقييم التغيرات الفسيولوجية والنسيجية للفئران بعد التحريض التجريبي لمرض السكري الشبيه بالسكري عن طريق الحقن بالستربتوزوتوسين (ستز). تم الاحتفاظ ب 20 جرذان ذكور صحية (سلالة ويستار، الوزن 353 ± 90 غرام، 3 أشهر من العمر) تحت دورة ضوء مظلمة 12/12 ساعة، عند 23.4 درجة مئوية. كان لديهم حرية الوصول إلى تشو الفئران العادية والمياه الصنبور. تم تقسيم هذه الحيوانات إلى مجموعتين تم حقنهما مرة واحدة إما باستخدام ستز (60 ملغم / كغم، مجموعة معالجة، 12 حيوان) أو محلول ملحي (نفس حجم ستز، مجموعة السيطرة، 8 حيوانات). ثم تم رصد الحيوانات لمدة 8 أشهر (نموذج السكري على المدى الطويل). أجريت الدراسات السلوكية (لوحة حفرة واختبار القطب) والاختبارات النسيجية، ورصدت المعلمات الفسيولوجية (سكر الدم، وزن الجسم). تم تحليل نتائج هاتين المجموعتين باستخدام مان-ويتني U-تيست، وكان الفرق معنويا ل P <0.05. أظهرت نتائج الاختبارات السلوكية أن الحيوانات المصابة بالسكري تظهر مقارنة مع المجموعة الضابطة: (1) انخفاض عدد حلقات غمس الرأس (p <0.05) وزيادة زمن الانتقال إلى حلقة الاستمالة الأولى (p <0.001). (2) انخفاض النشاط الحركي الكلي والقطب الوقت (38 مرة القطب / ثانية، P <0.001)، وكذلك زيادة وقت t بدوره (45٪، P <0.01). وبالمقارنة مع حيوانات السيطرة، كشفت الدراسات النسيجية في الحيوانات السكري: (1) زيادة سمك سحائي وكثافة أعلى من الخلايا المتداولة في السحايا (ع <0.05). (2) تغييرات الميتوكوندريا مثل تورم و / أو فراغ في الخلايا العصبية. (3) الخلايا العصبية موت الخلايا المبرمج. (4) الخلايا الدبقية الدبقية الصغيرة واضطرابات المايلين في نيوروبيل؛ وكذلك (v) العديد من الضامة الدماغ تفعيلها. وكان ارتفاع السكر في الدم أعلى أيضا، ووزن الجسم أقل، في مجموعة السكري. وفي الختام، تميز مرض السكري الشبيه بمرض السكري بالتغيرات المعرفية والحركية ربما بسبب الأضرار والخسائر في الخلايا العصبية الناشئة جزئيا عن التغيرات في علم وظائف الأعضاء المميزة للمرض.Item Determination of Mercury Concentration in Some Skin-lightening Creams Sold in Cosmetics Shops in Khartoum State(AL-Neelain University, 2015-10) Safa Mohammed Hashim Abd allaItem Determination of Mercury Concentration in Some Skin-lightening Creams Sold in Cosmetics Shops in Khartoum State(Al Neelain University, 2015) Safa Mohammed Hashim Abd allaWomen in many countries use cosmetic products that lighten their skin, in pur suit of “fair - skinned beauty. Some of the products may be harmless, but others contain potentially hazardous ingredients such as inorganic mercury compounds. These products are often applied to large areas of the skin, left on the skin for hours at a time, and used repeatedly for week s, months or years. In this study, fifty samples of cosmetic products were analyzed for total mercury by Direct Mercury Analyzer and Atomic Absorption Spectrometry. The concentration of mercury in the creams ranged from 0.017 - 93.70 μg/g. forty percent ( 40% ) of the samples contain mercury with high concentration above standard of World Health Organization (WHO) 1 μg/g . The use of such creams may lead to health hazards and significant risks to users. Fifty eight percent (58%) of creams contain mercury lev els lower than t he recommended WHO limit of 1 μg/g . Two percent (2%) no mercury was detected. No warning information was noted on the packaging . pH of the fifty samples ranged from 3 to 11 . 34% of the sample studied had pH which is acidic (3 - 5 ), 58% is sl ightly acidic (5 - 7 ) and 8% is basic (7 - 11). Mercury absorbed through the skin from lightening products can damage the skin itself, the kidneys, and the nervous system. Therefore, it is recommended that all skin - lightening creams should be checked for mer cury levels before marketing and educates consumers about the hazards they pose.Item A Dissertation Submitted in Partial Fulfillment of the Requirement for the Degree of M.Sc. in Biochemistry and Molecular Biology(AL-Neelain University, 2017-03) Ebtesam Mans0ur YousifAbstract It has been shown that heavy metals toxicity to humans is as a result of long term or high level exposure to pollutants common in the environment including the air, water, food and numerous consumer products such as the cosmetics and toiletries. In this study, sixty three samples of cosmetic products were analyzed for total lead, mercury and cadmium by Direct Mercury Analyzer and Atomic Absorption Spectrometry. The samples were divided into three groups A: creams, B: lotions and C, oils and ointments). Our study analysis revealed the pH levels among tested groups were (3.50-7.84) in creams, (3.02-7.30) in lotions, (3.35-10.9)in oils and ointments, while moisture content distribution were, (0.20-99.3 %) in creams, (22.6-93.4 %) in lotions, (23.9-95.8 %) in oils and ointments, for organic matter the level were, (82.5-99.9 %) in creams, (96.5-99.5 %) in lotions, (96.5-99.9 %) in oils and ointments. Regarding the concentration of the heavy metals the results showed that. lead levels were, (0.009-0.093ppm) in creams, (0.005-0.760ppm) in lotions, (0.007-0.620ppm) in oils and ointments ,for mercury the level were, (0.004-93.70ppm)in creams, (0.100-22.19ppm) in lotions, (0.005-16.59ppm) in oils and ointments , and that cadmium were, (No detected) in creams, (No detected) in lotions, (0.004-0.340ppm) in oils and ointments. It is obvious from the present study that the presence of toxic heavy metals in some cosmetic products even occasional occurrence in low concentrations (below the recommended level) like lead and cadmium, while we found high amount of mercury in these cosmetics especially in creams. The use of such creams may lead to health hazards and significant risks to users. Therefore, it is recommended that all skin-lightning creams should be checked for mercury levels before marketing and educates consumers about the hazards they pose. مستخلص البحث لقد تم توضيح درجة سمية المعادن الثقيله ومدى تأثيرها على صحة الانسان نتيجة لتعرض بيئته للتلوث المائي أو الهوائي أو للاستخدام المفرط طويل الأمد لمستحضرات التجميل. في هذه الدراسه، عدد 63 عينات من مستحضرات التجميل حللت لتحديد تركيز الرصاص، الزئبق والكادميوم بواسطة جهاز تحليل الزئبق المباشر وجهاز الامتصاص الذري. قسمت هذه العينات لثلاث مجموعات هي، الكريمات، اللوشنات والزيوت والمراهم. ركزت هذه الدراسه على تقدير نسبة الرطوبه ، قيم الرقم الهيدروجيني ونسبة المواد العضويه في بعض مستحضرات التجميل بالاضافه الى قياس مستويات ثلاث من المعادن الثقيله هي الرصاص، الزئبق والكادميوم، وبعد اجراء الدراسه وجد ان الرقم الهيدروجيني تفاوتت معدلاته بين (3.50-7.84) للكريمات، (3.02-7.30) للوشنات، (3.35-10.9) للزيوت والمراهم، اما معدلات الرطوبه فتراوحت بين (0.20-99.2) للكريمات، (22.6-93.4) للوشنات، (23.9-95.8) للزيوت والمراهم، اما المواد العضويه فتراوحت بين (82.5-99.9) للكريمات، (96.5-99.5) للوشنات، (96.5-99.9) للزيوت والمراهم. اظهرت النتائج وجود كميات قليله من الرصاص تراوحت بين (0.009-0.093) للكريمات، (0.005-0.76) للوشنات، (0.007-0.620) للزيوت والمراهم، اما قيم الزئبق فان كميته تراوحت بين (0.004-93.70) للكريمات، (0.100-22.19) للوشنات، (0.005-16.59) للزيوت والمراهم، وبالنسبه للكادميوم فانه لم يوجد في الكريمات واللوشنات اما في الزيوت والمراهم (0.004-0.34). خلصت الدراسه الى وجود كميات من المعادن الثقيله في مستحضرات التجميل بكميات متفاوته وعلى الرغم من أن بعضها دون المعدل الضار كما في الرصاص و الكادميوم ، بينما وجدت كميات كبيره من الزئبق في بعض من مستحضرات التجميل وخصوصا في الكريمات. استخدام هذه الكريمات قد يؤدي الى مخاطر صحيه كبيره للمستخدمين. امتصاص الزئبق بالجلد من خلال كريمات التفتيح تؤثر على الجلد نفسه، الكليتين والجهاز العصبي لذلك يوصى ان يتم فحص الكريمات قبل دخولها الاسواق وتثقيف المستهلكين بشأن المخاطر التي تشكلها.Item Effect of Different Processing Techniques on Nutritional Composition and Anti-Nutrient Content of Pigeon Pea Seeds (Cajanus cajan L.)(Al Neelain University, 2015) Malaz Mohamed MohayedThis study is conducted to determine the effect of deferent processing methods (boiling, germination and soaking) on chemical composition, anti - nutritional factor content, in vitro protein digestibility of Pegeo pea ( Cajanus Cajan L .). The parameters were assayed using standard methods. The results of proximate analysis showed tha t, for the boiled sample the results were 5.98, 2.65, 1.62, 15.71, 25.27 and 74.03 % for the moisture, ash, oil, protein, protein digestibility and carbohydrates respectively. And for the germinated sample was 6.42, 2.38, 1.36, 20.16, 24.2 and 69.68 % for the moisture, ash, oil, protein, protein digestibility and carbohydrates respectively . And for soak ed sample was 6.04, 2.22, 1.93, 20.4, 25.73 and 69.39 % for the moisture, ash, oil, protein, protein digestibility and carbohydrates respectively. And the anti - nutritional factors the Ta nnic acid was0.27, 0.52 and 0.75 % for the boiling, germin ation and soaking techniques. The Phytic acid was2.56, 1.59 and 1.65 % . There were significant differences at (P≤0.05) in the improvement of the nutrient content, and decrease in the Tannic acid.Item Effects of Different Doses of Caraway (Carum Carvi L.) Essential Oil on Renal Function and Lipid profile in Non-Diabetic and Alloxan- Induced Diabetic Rats(AL-Neelain University, 2017-03) Amna Ibrahim Ahmed Adam MohammedAbstract: Objectives: To evaluate the effect of oral administration of caraway essential oil (Carum carvi) on the blood glucose level, lipid profile, and the renal function (creatinine and urea) of diabetic and non- diabetic rats. Methods: This investigation was carried out in biochemistry lab .Faculty of science and technology, University of Alneelain at 2016-2017. fifteen Wister rats weight 150-200g and randomly divided into 7groups, group 1: normal rats (negative control), group 2: diabetic rats (positive control), group 3: diabetic rats treated with caraway oil (high dose, 0.4mg/dl), group 4: diabetic rats treated with caraway oil (low dose, 0.2mg/dl), group 5: normal rats caraway oil (high dose), group 6: normal rats treated caraway oil (low dose), and group7: diabetic rats treated drugs, Diabetes was induced by intraperitoneal injection of 150mg/kg body weight alloxan. Caraway was given orally at a dose of (0.4 and 0.2mg/dl) daily, and the body weight of animals was measured every day. Blood samples were collected and blood glucose levels and lipid profile creatinine and urea were determined. Results: The results showed that oral administration of caraway caused a significant decrease in blood glucose level of treated rats (p=0.011). Furthermore, it caused significant decrease in total cholesterol(p=0.000) , triglyceride(p=0.000), and low-density lipoprotein cholesterol levels (p=0.016) and increased in high- density lipoprotein cholesrtol levels (0.001)in the treated and normal animals compared with the normal and diabetic control rats, and with no significant change in creatinine and urea. Conclusion: Caraway essential oil has both anti hyperglycemic and Hypolipidemic activity in diabetic rats. Nevertheless, it is not recommended before further investigations in animals and humans,also more research about effect of caraway essential oil on renal function. ملخص البحث الاهداف: تقييم تأثير تناول زيت الكراوية عن طريق الفم على كل من: مستويات جلكوز الدم، وتحليل الدهون،ووظائف الكلى لدى الجرذان الطبيعية والمصابة بالسكري. اجريت هذه الدراسة في جامعة النيلين كلية العلوم والتكنولوجيا قسم الكيمياء الحيوية السودان في العام 2016- 2017. الطريقة: تمت دراسة 15 جرذ من النوع وستر التي تتراوح اوزانها من 150-200 غرام على مدى 3 اسابيع وقد تم تقسيمها الى 7 مجموعات عشوائياً كالتالي: المجموعة الاولى(القياسية) الطبيعية، المجموعة الثانية جرذان مصابة بداء السكري والمجموعة الثالثة جرذان مصابة بداء السكري معالجة بتركيز عالي من زيت الكراوية، المجموعة الرابعة جرذان مصابة بداء السكري معالجة بتركيز منخفض، المجموعة الخامسة جرذان طبيعية معالجة بتركيز عالي من زيت الكراوية ، المجموعة السادسة جرذان طبيعية معالجة بتركيز منخفض من زيت الكراوية والمجموعة السابعة جرذان مصابة بداء السكري معالجة بتركيز دواء المرجعي للسكري تم تحفيزالاصابة بداء السكري عن طريق حقن الالوكسان تحت الجلد ثم تجريع الكراوية فمويا بتراكيز (0.4 و0.2 مليغرام\ديسلتر) يوميا ومع قياس الوزن. جمعت عينات الدم من اجل تحليل مستويات الجلكوز والهون ووظائف الكلى. النتائج: اشارت الدراسة الى ان تناول زيت الكراوية عن طريق الفم قد ادى الى انخفاض واضح في نتائج مستويات سكر الدم وذلك مع المجموعات الطبيعية والمصابة بداء السكري مقارنة بالمجموعة القياسية ، كما انها ادت الى انخفاض مستوى الكولسترول (p=0.000)، والجلسريدات الثلاثية (p=0.000)، والبروتينات الهنية منخفضة الكثافة (p=0.016)، وزيادة في مستوى البروتينات الدهنية عالية الكثافة (p=0.001)، في المجموعات الطبيعية والمصابة بداء السكري مقارنة بالمجموعة القياسية الطبيعية والمصابة بداء السكري مع تغير طفيف في الكرياتينين واليوريا. خاتمة: اثبتت الدراسة دور زيت عشبة الكراوية في خفض مستويات السكر والدهون في الدم لدى الجرذان المصابة بالسكري، الا اننا ننصح باجراء المزيد من الاختبارات على الحيوانات والبشر لمعرفة مدى تأثير هذه العشبة وفعاليتها وايضاً اجراء المزيد من الاختبارات حول تأثير زيت الكراوية على وظائف الكلى.Item Effects of varies doses of metformin on body weight and lipid profile in Wistar Rats.(AL-Neelain University, 2017-03) Esraa Elkhair Ali AlimAbstract Background: Metformin is an oral hypoglycemic agent that is commonly used in the treatment of type 2 diabetes mellitus, its associated metabolic acidosis side in non-diabetic patients used as anti-obesity. Objective: The aim of present study is to assess the effect of various doses of metformin on body weight and lipid profile in Wistar rats. Material and methods: In experimental study the rats were allotted randomly to three groups, each of 6 rats. Group 2 received 4mg/kg of drug daily for one month, which classified as low dose, group 3 received 8mg/kg as high dose while group one received placebo as control group.All rats were housed in the same environmental conditions during the experiment. Body weight and weight gain for each group were recorded weekly. Blood samples of all rats were collected at slaughter. Blood glucose, cholesterol, triglycerides, low- and high-density lipoproteins (LDL and HDL) levels were checked 1 month after for all the participants. Results: Data were analyzed using ANOVA tests. Comparison of meanof lipid profile (Cholesterol, Triglycerides, HDL, LDL and blood glucose) revealed insignificant differences. Moreover, significant decreases were observed in group administrated metformin for one month in when compared with control group. Conclusion:The study concluded that, administration of high dose metformin potentially reduce body weight and blood glucose. Therefore, lowering blood glucose, thus could exaggerate a complication related to hypoglycemia in women received high dose for long period. ملخص الدراسة خلفية: ميتفورمين هو عامل مخفض لسكر الدم عن طريق الفم التي يشيع استخدامها في علاج النوع 2 من داء السكري، ويرتبط جانبها الحموضة الأيضية في المرضى غير المصابين بالسكري بضد السمنة المفرطة الغرض: الهدف من هذه الدراسة تقييم تأثير جرعات مختلفة من الميتفورمين في وزن الجسم والدهون في الفئران التجارب. المواد والطريقة: في دراسة تجريبية تم تخصيص الفئران عشوائيا إلى ثلاث مجموعات، كل مجموعة تتكون من 6 فئران. /كغم من الدواء لمدة شهر واحد كجرعة منخفضة، وتم اعطاء المجموعة الثالثة 8 ملغم/ تم اعطاء المجموعة الثانية 4 ملغم كغم كجرعة مرتفعة، حين تلقت المجموعة الاولى علاج وهمي كمجموعة تحكم.وتم إيواء جميع الفئران في نفس الظروف البيئية خلال التجربة. تم تسجيل وزن الجسم والزيادة في الوزن اسبوعيا وتم جمع عينات الدم من جميع الفئران عند الذبح. تم فحص سكر الدم، الكوليسترول،الدهون الثلاثية والبروتينات الدهنية المنخفضة والعالية الكثافه. النتائج: تم تحليل البيانات باستخدام اختبار انوفا. مقارنة الدهون (الكولسترول، الدهون الثلاثية، البروتينات الدهنية المنخفضة والعالية الكثافة ومستوى السكر في الدم) لم تظهر اي اختلافات ذات اهميه. وعلاوة على ذلك، لوحظ انخفاض كبير في مجموعة التي تعاطت الميتفورمين لمدة شهر واحد في مقارنة مع مجموعة التحكم. الخلاصة: خلصت الدراسة إلى أن تعاطي الميتفورمين بجرعة عالية يحتمل أن يقلل وزن الجسم ومستوى السكر في الدم. لذلك، خفض مستوى السكر في الدم، يمكن أن يزيد من المضاعفات المرتبطة بنقص السكر في الدم لدى النساء الائي تلقين جرعة عالية لفترة طويلة.Item Evaluation of High Sensitive C-Reactive Protein (hs-CRP) and Magnesium Level among Adults Cigarette Smoking in Khartoum State(AL-Neelain University, 2015-10) Duaa Mustafa Mohammed IbrahimABSTRACT The World Health Organization report that, tobacco is the second major cause of death and the fourth most common risk factor for disease worldwide. Complications of smoking are cardiovascular disease and atherosclerosis. CRP used as predictor marker for inflammation and atherosclerosis. Study aims to evaluate hs-CRP and magnesium level among adults cigarette smoking. Eighty subjects were enrolled, 40 smokers males, and 40 non smokers males (aged 18-40 years old). Fasting veinpuncture (5ml) blood specimen was collected from each volunteer, serum obtained then hs-CRP and magnesium was measured by full automatic analyzer COBAS C-311 and ACCENT-200 II GEN respectively. The results showed insignificant difference in serum hs-CRP level of smokers versus non smokers P-value 0.343. There was positive correlation between hs-CRP level and the age and the duration of smoking with P-value 0.001 and 0.009 respectively. Also significant decrease in the mean concentration of serum magnesium of smokers with P-value 0.000 and negative correlation between serum magnesium level and the duration and number of cigarettes per day with P-value 0.000 and 0.001 respectively, and no correlation found between serum magnesium and the age and BMI with P-value 0.392 and 0 .158 respectively. The results conclude that, serum magnesium level is decreased in smoker individuals, and negatively correlate with duration and number of cigarettes, no difference observed in mean concentration hs-CRP of smokers versus nonsmokers, hs-CRP correlate positively with the age and the duration of smoking.ملخص الدراسة تقرير منظمة الصحة العالمية أن التبغ هو السبب الرئيسي الثاني للوفاة و اخطر رابع عامل أكثر شيوعا للامرض في جميع أنحاء العالم. من مضاعفات التدخين أمراض القلب وتصلب الشرايين. البروتين المتفاعل سي عالي الحساسية يستخدم كعلامة للالتهاب، وبالتالي تصلب الشرايين. تهدف هذة الدراسة إلى تقويم البروتين المتفاعل سي عالي الحساسية ومستوى المغنيسيوم بين مدخين السجائر البالغين. التحق ثمانين متبرعين، 40 من المدخنين الذكور، و 40 من الذكور غير المدخنين (الذين تتراوح أعمارهم بين 18-40 سنة). لقد تم جمع 5 مل من الدم عن طريق الوريد و أخذت عينة الدم من كل متطوع وهو صائم ، تم استخدام مصل الدم الذي تم الحصول عليه وحلل تلقائيا لتقدير البروتين المتفاعل سي عالي الحساسية والمغنيسيوم. وأظهرت النتائج أن متوسط تركيز مصل البروتين المتفاعل سي عالي الحساسية كان غير معنوي الفرق بقيمة احتمالية 0.343. كان هناك علاقة طردية بين مستوى البروتين المتفاعل سي عالي الحساسية والعمر ومدة التدخين بقيمة احتمالية .0010 و 0.009 على التوالي. أيضا وجد انخفاض كبير في متوسط تركيز المغنيسيوم في الدم من المدخنين بقيمة احتمالية 0.000 وارتباط سلبي بين مستوى المغنيسيوم في الدم ومدة التدخين وعدد السجائر يوميا بقيمة احتمالية 0.000 و 0.001 على التوالي، وعدم وجود ارتباط بين المغنيسيوم في الدم و العمر، ومؤشر كتلة الجسم بقيمة احتمالية 0.392 و 0.158 على التوالي .و خلصت الدراسة أن مستوى المغنيسيوم إنخفض في الأفراد المدخنين، ويرتبط بشكل سلبي مع مدة التدخين وعدد السجائر، لا فرق لوحظ في متوسط تركيز البروتين المتفاعل سي عالي الحساسية من المدخنين مقابل غير المدخنين، ويرتبط بشكل إيجابي مع والعمر ومدة التدخينItem Evaluation of Serum Trace Elements Chromium and Zinc among Rheumatoid Arthritis Patients(AL-Neelain University, 2017-03) Abd Ulaziz Al-Bashir Yousifالمستخلص: خلفية :التهاب المفاصل الروماتويدي (RA) هو أحد أمراض المناعة الذاتية من سبب غير معروف يتميز التهاب متعدد المفاصل متناظرة من الغشاء الزليلي الذي يؤثر في معظم الأحيان علي مفاصل اليدين والرسغين والقدمين، ويمكن لالتهاب متمركز ومجموعة المفصل يؤدي تدريجيا إلى أضرار العظام والغضاريف تتدهور، حتى فقدان الوظيفة. أهمية العناصر النادرة الزنك والكروم ذات أهمية كبيرة لأن الكثير من هذه العناصر هي عوامل مساعدة في عملية الايض الغذائي. المواد والطرق: تم تسجيل تسعون ، تصنف على أنها (N45) حالة و (N45) كمجموعة طبيعية تتراوحت أعمارهم بين 40-70 سنة. تم قياس الزنك والكروم في الدم باستخدام مطياف الامتصاص الذري(AAS). النتائج:أظهرت التحليلات المستقلة اختبار t، كان الزنك والكروم بمستوى أقل بكثير في المرضى الذين يعانون التهاب المفاصل الروماتيزمي بالمقارنة مع مجموعة الاصحاء مع القيمة الاحتمالية 0.000 و0.000 على التوالي. المرضى الذين لديهم التهاب المفاصل الروماتيزمي يزيد عن 5 سنوات كشفت الدراسة ان مستوى الزنك أقل بكثير مقارنة مع أقل من 5 سنوات ف قيمة 0.032، 0.036 على التوالي. وعلاوة على ذلك، لوحظ نقص الزنك في الإناث مقارنة مع الذكور ف قيمة 0.050. وأخيرا أظهر الدراسة ان هناك ارتباط إيجابي بين الزنك والكروم مع0.369 R ف قيمة 0.013. الخلاصة: خلصت هذه الدراسة إلى أن المرضى الذين يعانون من التهاب المفاصل الروماتيزمي هم أكثر عرضة لنقص الزنك و الكروم وبالتالي،لابد من بروتوكول لرصد الزنك والكروم و يوصى باعطاء الزنك والكروم كمكملاتغذائية. Abstract: Background: Rheumatoid arthritis (RA)is an autoimmune disease of unknown etiology characterized by a symmetrical poly-articular inflammation of synovial membrane that affects most often the joints of the hands, wrists and feet, the localized and systemic inflammation can result in a progressive joint damage causing bone and cartilage degradation, until the loss of function. The importance of trace element in RA is of great interest because many of these trace elements are co-factors in metabolic process. Materials and methods: Ninety subjects were enrolled, classified as (n45) case and (n45) as control group, age ranged from 40 to 70 years old. Serum zinc and chromium were measured by using atomic absorption spectrophotometer (AAS). Results: Independent t-test analyses showed, mean zinc and chromium level were significantly lower in rheumatoid arthritis patients when compared with control group with p-value ( 0.000 and 0.000) respectively. Patients have RA more than 5 years revealed significantly lower of zinc level in comparison with less than 5 years p-value 0.032, 0.036 respectively. Moreover, zinc deficiency was observed in female when compared with malep-value 0.050. Finally the person's correlation test showed there was a positive correlation between zinc and chromium with R 0.369, p-value 0.013. Conclusion: This study concludes that, patients with RA are more susceptible to zinc and chromium deficiency thus, monitoring protocol and zinc and chromium supplementation are recommended.Item Evaluation of the In Vitro and In Vivo Antioxidant effects Of Nigella sativa L. Seed Extract and fixed oil(AL-Neelain University, 2015-10) Rofida Ali Omer Mohamed AhmedAbstract Nigella sativa L. , known as black cumin or Habbat El Baraka in the Arab world, are a member of the Ranonculaceae family. The present study evaluated the antioxidant effects of methanolic extract and fixed oil of Nigella sativa. The antioxidant effects were evaluated using in vitro, 2, 2-diphenylpicrylhydrazine photometric assay and in vivo serum thiobarbituric acid reactive substance TBARS assay method. The Phytochemical screening of the methanolic extracts of Nigella sativa revealed the presence of various bioactive components of which saponins, cumarins, alkaloids, sterols, triterpenes, tannins and glucosides. the in vivo study was done in rats 25 wistar rats which divided into five groups received different dose of methanolic extract (400 and 800)mg/kg/day and fixed oils (4 and 8ml/kg/day and control group received the normal diet for 21 days .In the in vitro DPPH method the methanolic extract were found to be stronger antioxidant which give inhibition percent (79±0.09) % than fixed oil (55.9±0.07)%. The in vivo study showed that the level of TBARS in the extract and fixed oil treated groups decreased in a dose dependent manner when compared to control group. The methanolic extract (800mg/kg) showed a significant (p˂0.05) decrease in the serum level of thiobarbituric acid reactive substance when compare with control group. These finding suggest that the Nigella sativa has potent antioxidant activity which may be responsible for some of its reported pharmacological activities and can be use as antioxidant supplement. ملخص البحث الكمون’ المعروف باسم حبة البركة في العالم العربي، هي نبات ينتمي الي الفصيلة الحوذانية. قيمت هذه الدراسة الآثار المضادة للأكسدة للمستخلص المثيلي والزيوت الثابتة للحبة السوداء. تم تقييم الآثار المضادة للأكسدة في المختبر باستخدام الطريقة الضوئية ، 2، 2- ثنائي الفينيل بيكريل هيدرازين وداخل الكائنات الحية باستخدام مصل الدم و حمض الثيوباربتيريك القابل للتفاعل . أجريت الدراسة داخل الكائنات الحية علي فئران التجارب 25 فأر قسمت الي خمس مجموعات أعطيت جرعات مختلفة من المستخلص الميثيلي للحبة السوداء (400و800) ملجم/كجم/يوم وجرعات مختلفة من الزيوت الثابتة للحبة السوداء (4و8)مل/كجم/يوم وأظهرت النتائج في المختبر باستخدام الطريقة الضوئية ، 2، 2- ثنائي الفينيل بيكريل هيدرازين أن المستخلص المثيلي للحبة السوداء مضادا للأكسدة بنسبة تثبيط (79 ± 0.09)% اعلي من الزيوت الثابتة للحبة السوداء(55.9±0.07)%. وأظهرت الدراسة الكيميائية النباتية وجود مركبات حيوية فعالة منها الصابونين والكيومارين والقلويدات والإسترول والتريتربين والتانين والفلافونيدات. وأظهرت الدراسة أن مستوى حمض الثيوباربتيريك القابل للتفاعل في مجموعات المستخلص المثيلي والزيوت الثابتة انخفض بطريقة تعتمد على الجرعة مقارنة بالمجموعة الضابطة. أظهر المستخلص المثيلي (800ملجم / كجم) انخفاض معنوي p≤0.05)) في مستوى حمض الثيوباربتيريك القابل للتفاعل في مصل الدم عند مقارنتها مع المجموعة الضابطة . هذه النتائج تشير إلى أن الحبة السوداء لها نشاط مضاد للاكسدة والذي قد يكون مسئول عن بعض الأنشطة الدوائية المثبتة ويمكن استخدامها كمكملات مضادة للأكسدة.Item Evaluation of the toxic influence of vitamin E (dl-alpha-tocopheryl acetate) and treatment with aqueous extracts of Cinnamon or Anise on lipid profile and liver functions of female wistar rats.(AL-Neelain University, 2017) Sabah Abdalla Elhag IbrahimAbstract The aim of this study was to examine the toxic effects of vitamin E and its treatment with aqueous extracts of Cinnamon or Anise on lipid profile, and liver functions of female wistar rats. This study was carried out at laboratories in the department of biochemistry, AL-Neelain University, for six weeks on 2016. Eitheen female wistar rats were divided into six groups: The negative control group (given only sunflower oil), the positive control group received a toxic dose of vitamin E (1500 mg/Kg/bw) daily. The four treated groups received a low dose (2.13g/Kg) and a high dose (3.20g/Kg) from Cinnamon aqueous extract (CAE) and Anise aqueous extract (AAE). At the end of the experiment rats were sacrificed then serum and liver tissues were analyzed. The results obtained from this study showed that vitamin E toxic dose caused significant increase in triglycerides (TG) and Alanine aminotransferase (ALT) levels,while it decreased the levels of high density lipoprotein (HDL), low density lipoprotein (LDL), total cholesterol (TC)and Aspartate aminotransferase (AST). All treatments decreased TG and ALT levels. CAE low dose had caused a significant increase in TC, LDL, HDL levels and non significant changes on AST.CAE high dose caused a significant decrease in AST, TC, and LDL with non significant changes on HDL levels. Both doses of AAE, caused significant increases on AST levels, no significant changes on HDL, and only Anise low dose caused significant decreased on TC and LDL levels. Vitamin E toxic dose caused severe fatty change in liver histology, which was near normalin both doses of CAE with a small necrosis in low dose. Only AAE low dose normalized the liver. To conclude Vitamin E oral administration with a dose of (1500 mg/Kg) can induce liver injury with an elevation in ALT levels; it can also cause an increase in TG, which was significantly ameliorated by both treatments. Cinnamon was more effective than Anise in the treatment of vitamin E toxicity. In addition CAE high dose was better than CAE low dose; in contrast AAE low dose was better than AAE high dose. More investigations on vitamin E toxicity on lipid profile and liver enzymes are recommended. This study is the first step toward the utilization of Cinnamon and Anise on the treatment of vitamin E toxicity, more studies should be done to examine these herbs to vitamin interactions. الخلاصة كان الغرض من هذه الدراسة هو التحقق من التأثير السام لفايتمين هـ و معالجته باستخدام المحلول المائي للقرفة او الينسون على مستوى الدهون و وظائف الكبد لإناث الجرذان. اجريت هذه الدراسة في معامل الكيمياء الحيوية بجامعة النيلين، لمدة ٦ اسابيع في بداية شهر اكنوبر ٢٠١٦.قُسِمت ١٨فأرة لست مجموعات: المجموعة الضابطة السالبة (اعطيت زيت عباد الشمس فقط)، المجموعة الضابطة الموجبة اعطيت جرعة سامة من فايتمين هـ (١٥٠٠ملج/ كلجم /الوزن) يوميا، و ٤ مجموعات تعطى نفس الجرعة السامة من فايتمين هـ يتبعها بعد ساعتين جرعة منخفضة وجرعة عالية من كلا محاليل القرفة والينسون. في نهاية التجربة تمت التضحية بالفئران لجمع عينات الدم وانسجة الكبد وتحليلها. أظهرت نتائج هذه التجربة أن الجرعة السامة من فايتمين هـ تسببت بزيادة ذات أهمية على كلا من مستوى الدهون الثلاثية متعادلة الكليسرايد وانزيم ال (اي ال تي )، بالمقابل تسببت بانخفاض في مستوى الكوليسترول والدهون البروتينية منخفضة الكثافة والدهون البروتينية عالية الكثافة وانزيم ال (اي اس تي). استطاع كلا من القرفة والينسون ان يخفضا الزيادة في مستوى الدهون الثلاثية متعادلة الكليسرايد وانزيم ال (اي ال تي ). تسببت الجرعة المنخفضة من القرفة في ارتفاع في مستوى الكوليسترول، والدهون البروتينية منخفضة الكثافة والدهون البروتينية عالية الكثافة ولكن لم تؤثر بصورة معبرة على انزيم ال (اي اس تي). تمكنت الجرعة المرتفعة من القرفة في تقليلمستوى الكوليسترول، والدهون البروتينية منخفضة الكثافة وكذلك انزيم ال (اي اس تي) ولم يكن لها تأثير واضح على الدهون البروتينية عالية الكثافة. تسببت كلا جرعات الينسون في زيادة ال اي اس تي ولم يكن لهما تأثير على الدهون البروتينية عالية الكثافة، وتمكنت جرعة الينسون المنخفضة فقط من تقليل مستوى الكوليسترول و،والدهون البروتينية منخفضة الكثافة. تسببت سميّة فايتمين هـ في تغير دهني حاد في انسجة الكبد، حيث استطاعت القرفة ان تغيره الى الطبيعي بالرغم من ان الجرعة المنخفضة تسببت في تنخر بسيط. بالمقابل تمكنت فقط الجرعة المنخفضة من اليانسون في تغييير السمية الى شبه الطبيعي. استنتج من هذه الدراسة ان الجرعة السامة من فايتمين هـ يمكنها ان تحدث إصابة في الكبد وارتفاع في انزيم ال اي ال تي وايضا ارتفاع في مستوى الدهون الثلاثية متعادلة الكليسرايد، اللاتي تمكن كلا من القرفة والينسون معالجتهما. بالاضافة الى ان القرفة كانت فعالة اكثر من الينسون في معالجة السمية، وان الجرعة المرتفعة من القرفة كانت اكثر فعالية من الجرعة المنخفضة والعكس صحيح بالنسبة للينسون. هذه الدراسة هي الخطوة الأولى تجاه استخدام القرفة والينسون في علاج التسمم بفايتمين هـ ، لذلك نوصي بمزيد من الدراسات في هذا الصدد.Item Hepatoprotective Effect of Blue Green AlgaeSpirulina on Paracetamol Induced Liver Toxicity in Wistar Rats(AL-Neelain University, 2017) Sarmad Sirag BashirAbstract Many antioxidants have been investigated as hepato-protectors against paracetamol induced hepatic injury. Blue green algae Spirulina appeared as a novel antioxidant agent. The present study was conducted on Wistar rats to evaluate the hepatoprotective effect of Spirulina algae against oxidative stress, tissue injury and alterations of lipid profile caused by paracetamol. The experiment was held within the premises of the faculty of science and technology, Alneelain University, Khartoum (2016-2017). The rats were allotted at random to four groups, each of 4 rats. The first group used as (-ve) control, 2nd and 3rd groups were treated with (paracetamol 1g/kg b.wt, Spirulina 800 mg/kg b.wt) respectively for three weeks. The 4th group (paracetamol+ Spirulina) treated with Spirulina daily for one week prior and along with oral administration of paracetamol. The results revealed that paracetamol exhibited significant increase in serum levels of Aspartate Aminotransferase (AST), Alanine Aminotransferase (ALT), alkaline phosphatase (ALP) and lipid profile parameters: total cholesterol (TC), triglycerides (TG) and inconsiderable increase in Low density lipoprotein (LDL) while High density lipoprotein cholesterol (HDL) was significantly decreased compared with control and Spirulina group. However, histopathological results of paracetamol treated group confirmed hepatic and renal damage. The rise in serum hepatic enzymes, cholesterol, triglycerides, LDL and histopathological changes were significantly attenuated by Spirulina, whereas respectable increase in HDL level was observed. In conclusion, Spirulina has significantly alleviated the hepatotoxicity induced by paracetamol and modified the lipid profile through its antioxidant properties. Nevertheless, further studies are required to throw more light on the expected effect of Spirulina on rats body weight. الخلاصة في هذه الدراسة اتضح ان عدد من مضادات الاكسدة اكتشفت كعوامل واقية للكبد ضد التاثيرات السمية للباراسيتامول.الطحالب الخضراء المزرقة سبايرولينا ظهرت كعامل غير مألوف مضاد للاكسدة. اجريت هذه الدراسة على فئران التجارب لتقييم الاثر الواقي على الكبد بواسطة طحالب الاسبايرولينا على مسببات الاكسدة،تلف الانسجة الكبدية بالاضافة الى التغييرات في مستويات الدهون الناتجة عن تاثير الباراسيتامول.اجريت التجربة بمباني كلية العلوم والتقانة ،جامعة النيلين،الخرطوم (2016-2017).تم تقسيم الفئران الى الى اربع مجموعات 4 فئران بكل مجموعة .المجموعه الاولى استخدمت ككنترول سلبي، المجموعتان الثانية والثالثة تمت معالجتهما ب(باراسيتامول 1جم/كجم/وزن الجسم ، سبايرولينا 800مجم/كجم/وزن الجسم) على التوالي لمدة ثلاثة اسابيع. المجموعة الرابعة (باراسيتامول+سبايرولينا) عولجت بالاسبايرولينا يوميا لمدة اسبوع قبل التجربه واستمرت مع استعمال الباراسيتامول عن طريق التجريع الفموي.اظهرت النتائج زيادة ملحوظه ناتجة عن الباراسيتامول في مستويات الانزيمات الكبدية ، الكوليسترول، الجليسريدات الثلاثية و زيادة غير ملحوظه في البروتينات الدهنية قليلة الكثافة بينما البروتينات الدهنية عالية الكثافة اظهرت نقصانا ملحوظا مقارنة بمجموعتي الكنترول والاسبايرولينا.على كل حال نتائج الانسجة المريضة دعمت الاضرار الللاحقة بالكبد والكلى. الارتفاع في مستويات الانزيمات الكبدية، الكوليسترول ، الجليسريدات الثلاثية ، البروتينات الدهنية قليلة الكثافة و تغيرات الانسجة المريضة اضعفت بصورة ملحوظة بفعل الاسبايرولينا، في حين ان زيادة مقدرة في مستويات البروتينات الدهنية عالية الكثافة قد لوحظت. في الختام،سبايرولينا قد اظهرت بصورة مقدرة تسكين للسمية الكبدية الناتجة عن تأثير الباراسيتمول وساهمت في تعديل مستويات الدهون من خلال خواصها المضادة للاكسدة. ليس فحسب بل مزيدا من الدراسات مطلوبة لتسليط مزيدا من الضوء على تأثير سبايرولينا على وزن فئران التجارب.Item Impact of Raw Cocoa and Chocolate on Lipid Profile and Liver Functions in Alcohol-induced Toxicity Wister Rats(AL-Neelain University, 2017-03) Alaa Abdel Ghaffar Ahmed SalehAbstract: The aim of study is to evaluate the impact of raw cocoa and processed cocoa (galaxy chocolate) in the treatment of alcoholic fatty liver compare to prednisolone drug as common medication to treat fatty liver. This study was carried in AL-Neelain university- faculty of science and technology at September 2016, eighteen female Wister rats were classified into six groups, negative and positive controls, cocoa with two doses (0.67 and 1.35 g/kg), chocolate ( 5.4 g/kg) and prednisolone (4.8 mg/kg) groups, the last five groups were received alcohol (0.5 ml/40%) for 60 days, then treatments were administrated for 60days, blood samples were collected after slaughter to obtain serum for liver enzymes (ALT, AST, GGT) and lipid profile (TG,LDL, HDL and cholesterol) measurement and the liver from each groups were collected and preserve in formalin for histopathology examination. The results show that the cocoa with low and high doses, chocolate and prednisolone significantly reduce the mean concentrations of liver enzymes (ALT, AST and GGT) (p=0.000, 0.000. 0.000) respectively, a significant decrease in the ALT level after administration of prednisolone drug when compared high cocoa dose group (p=0.017). Galaxy chocolate significantly reduce the mean concentration of AST compared to low dose cocoa treated group (p=0.006). Also there was a significant increase in HDL concentration and decrease in the mean concentrations of lipid profile (Total cholesterol, Triglycerol and LDL) in all treated groups compared to positive control (p=0.000). The ratio between Triglycerol: HDL and LDL: HDL show a significant reduction in group treated with chocolate compared to other treated groups (cocoa low dose, cocoa high dose and prednisolone (p=0.02, 0.046, 0.005) respectively. We concluded that, cocoa in both forms raw and processed are efficient in the treatment of alcoholic fatty liver in comparison with prednisolone drug. ملخص الدراسة : الهدف من هذه الدراسة هو تقييم تأثير الكاكاو الخام والكاكاو المجهزة (شوكولاته الجلاكسي) في علاج الكبد الدهني الكحولي مقارنة مع دواء بريدنيزولون؛ الدواء الشائع لعلاج الكبد الدهني. أجريت هذه الدراسة في جامعة النيلين -كلية العلوم والتكنولوجيا في سبتمبر ۲۰١٦، تم تصنيف ثمانية عشر الفئران ويستر الإناث إلى ست مجموعات، ضوابط السلبية والإيجابية، والكاكاو مع جرعتين (۰,٦٧ و ١.٣٥ جم / كجم)، والشوكولاته ( ٥.٤جم / كجم) وبريدنيزولون (٤.٨ملغ / كلغ) مجموعات، اعطيت المجموعات الخمس الاخيرة الكحول (٠.٥مل / 40٪) لمدة ٦٠ يوما، ثم تم اعطاء العلاجات ل ٦٠ يوما، وجمعت عينات الدم بعد الذبح للحصول على مصل لقياس انزيمات الكبد (ALT، AST، GGT) والدهون (الجلسريدات الثلاثية و البروتين الدهني منخفض الكثافة و البروتين الدهني عالي الكثافة و الكوليسترول). جمعت الكبد من كل الجماعات وحفظت في الفورمالين لفحص التشريح المرضي. أظهرت النتائج أن الكاكاو مع الجرعات المنخفضة والعالية، والشوكولاته وبريدنيزولون الحد بشكل كبير من متوسط التركيزات من انزيمات الكبد (ALT، AST وGGT) (الاحتمالية = ٠,٠٠٠، ٠,٠٠٠٠,٠,٠٠٠) على التوالي، و ان هناك انخفاضا كبيرا في مستوى ALT بعد إعطاء البريدنيزولون بالمقارنة مع مجموعة جرعة الكاكاو العالية (الاحتمالية =٠١٧ ,٠). شوكولاته الجلاكسي تقلل إلى حد كبير متوسط تركيز AST بالمقارنة مع المجموعة التي تلقت العلاج الكاكاو منخفض الجرعة (الاحتمالية = ٠,٠٠٦). تظهر النتائج أيضا أن زيادة كبيرة في تركيز البروتين الدهني عالي الكثافة وانخفاض في متوسط تركيزات من الدهون (الكولسترول الكلي، الجلسريدات الثلاثية و البروتين الدهني منخفض الكثافة) في جميع المجموعات المعالجة مقارنة مع المجموعة التي تتلقى الكحول (الاحتمالية = ٠,٠٠٠). النسبة بين الجلسريدات الثلاثية: البروتين الدهني عالي الكثافة و البروتين الدهني منخفض الكثافة : البروتين الدهني عالي الكثافة تظهر انخفاضا كبيرا في المجموعة التي تلقت العلاج مع الشوكولاته مقارنة بالفئات الأخرى المعالجة (جرعة الكاكاو المنخفضة، جرعة الكاكاو العالية وبريدنيزولون (الاحتمالية =٠٢, ٠، ٠,٠٤٦ ،,٠٠٥, ٠) على التوالي. استنتجنا أن الكاكاو في كل من الأشكال الخام والمصنعة لديهم كفاءة في علاج الكبد الدهني الكحولي في مقارنة مع بريدنيزولون.Item Nutnitional value and minerals content of five edible mushrooms(Al Neelain University, 2015) Enas Ahmed EisaProximate composition and mineral s content of five spe cies of edible mushrooms namely species Agaricus bisporus , Agaricus bisporus , Pleurotus eryngii , Lentinula edodes and Flammulina velutipes . Sample which obtain from UAE, it is Crude protein, total lipids, total carbohydrates, and dietary fiber content in mushrooms were found to be in the ranges of 28.55 - 58.05, 2.37 - 4.33, 52.9 - 78.24, 44.8 - 71.51 and 4.82 - 7.48 % of fresh edible portion (EP) respectively. Moisture and ash content were found to be in the ranges of 10.46 - 17.79 and 5.67 - 10.48 % of fresh EP respectively. The mineral content of calcium, magnesium, iron, sodium and potassium content in mushrooms were found to be in the ranges of 8.79 - 45.59, 35.92 - 81.40, 10.51 - 22.59, 19.62 - 340.99 and 189.63 - 201.56 % . It is shown that the investigate d mushrooms were rich sources of protein , f iber and carbohydrates and had low amounts of fat. Metal contents of the studied mushrooms were highly sodium, potassium and magnesium. The results make these wild edible mushrooms popular to consume as good food sources.Item Nutritive Value of Pigeon pea (Cajanus cajan) Supplemented with Yoghurt(2017-05) Nagla Ahmed Hassan OmerEnglish Abstract The study was conducted in the laboratory of Biochemistry, Department of Biochemistry and Molecular Biology, Faculty of Science and Technology, University of Al-Neelain in 2015. The objectives of study were to improvement the quality of pigeon pea seeds by adding improver, prepare three diets of pigeon pea by adding yoghurt by different concentrations ( 40, 80 and 100 gram), remove anti nutrition compound by boiling and dehulled the seeds, then study the chemical analysis of samples and measured the minerals as (sodium, magnesium, iron and manganese), sensory evaluation and protein digestibility for processing samples. The result showed that there was significant difference (P≤0.05) in pH, moisture, Ash, total solid, protein, carbohydrate, tannin content, sodium, magnesium and iron compared with control and the results showed no significant difference (P≥0.05) in crude fiber, fat content, protein digestibility and manganese compared with control and also showed significant difference (P≤0.05) in sensory evaluation for three processing samples compared with control. Finally concluded that the addition of yoghurt lead to improve the quality of pigeon pea seeds. ملخص الدراسه أجريت الدراسة في مختبر الكيمياء الحيويه بقسم الكيمياء الحيويه والبيولوجيا الجزيئيه بكلية العلوم والتكنولوجيا بجامعة النيلين عام 2015 وكانت أهداف الدراسة هي تحسين نوعية بذور حمص البازلاء باضافة محسن، واعداد ثلاث وجبات (40 و 80 و 100 غرام) وازالة المركب المضاد للتغذية عن طريق الغليان ثم ازالة البذور ثم دراسة التحليل الكيميائي للعينات وقياس المعادن (الصوديوم و المغنيسيوم والحديد والمنغنيز) وهضم البروتين لمعالجة العينات. وأظهرت النتائج وجود فرق معنوي في درجة الحموضه والرطوبه والرماد والصلب الكلي والبروتين والكربوهيدرات ومحتوى التانين والصوديوم و المغنيزيوم والحديد مقارنة مع الضابط ولم تظهر النتائج فرق معنوي في الألياف الخام، ومحتوى الدهون، وهضم البروتين والمنغنيز مقارنه مع الضابط واظهرت النتائج ايضا وجود فرق معنوي في الاختبارات الحسيه للثلاثه عينات التي تمت معالجتها مقارنه مع الضابط. ويستنتج اخيرا من ذلك ان إضافة الزبادي يؤدي لتحسين نوعية بذور حمص البازلاءItem Phytochemical Screening and Antibacterial Activity of Azadirachta indica (Neem) Leaf Extract on Salmonella typhi(جامعة النيلين, 2017) Nusiba Alhadi Abaker AdamAbstract There is immense need to develop and alternative antimicrobial source for the treatment of several infection disease and restrict it's vector, show the aim of the present study is to evaluate phytochemical components and antimicrobial activates of leaves extracts of Azadirachtaindica, popularly known as “neem” againstgram negative human pathogenic bacterial strains,salmonella typhi. Neem leaves were collected from Omdurman, stander test organisms used for antimicrobial study were obtained from National Center for Research, organic solvent of {Petroleum ether (pet. ether), chloroform (CHCL3) and Methanol (MeOH)}were used for the preparation of the extract for the study. The extract were analyzed for quantitative and qualitative phytochemical. Antimicrobial activity was determined by using disc diffusion method.The phytochemical analysis showed the presence of higher amount of alkaloid, sterol and tannin in Methanol extract. Higher amount of Saponins were found in chloroform extract. Moderate amount of Triterpenes were found in all three different extracts. Leaves extracts showed different inhibition zone against S. typhi, Petroleum ether extractwas showed highestactivities, the methanol extract showed intermediate activities, while chloroform extract showed lowest activities. The finding of this study showed that Petroleum ether andmethanol extracts of A. indicaleavescan be used as antimicrobial ofsalmonella typhi. ملخص البحث يوجد احتياج كبير لتطوير وايجاد بدائل لمصادر المضادات الحيوية التى تستخدم لمعالجة عدد من الامراض وتخفيف حدتها. لذلك هدفت هذه الدراسة لتقيم النشاط الكيميائي والحيوى لمستخلص اوراق نبات النيم على البكتريا المسببه للامراض السالبه لصبغه جرام (السالمونيلا تايفويد) . جمعت اوراق النيم فى يونيو 2016 من ام درمان. البكتريا القياسية المستخدمة احضرت بواسطة المركز القومي للبحوث قسم الاحياء الدقيقة واجريت التجارب بواسطة disc diffusion method. فى هذه الدراسة تم استخدام ثلاثه محاليل عضوية مختلفة (الميثانول الكلوروفورم والايثر البترولي)لاستخلاص الماده الفعاله لاوراق النيم ثم استخدمت المستخلصات لإجراء مسح كيميائي كمي ونوعي كما تم اجراء اختبار النشاط المضاد لبكتريا سالمونيلا تايفويد. أَكّدتْ النتائج على وجود عدد كبير من المجموعات الكيميائية مثل التربينات الثلاثية والاسترول في كل المستخلصات, تم العثور علي كمية عالية من الالكينات والاسترول والثانين فى مستخلص الميثانول, كما وجدت كميه عالية من الصابون في مستخلص الكلوروفورم, كمية متوسطه من التربينات الثلاثيه وجدت في جميع المستخلصات. أشارت نتائج فحص المضادات الميكروبية استجابات مختلفه تجاه المستخلصات المختلفه لاوراق نبات النيم. مستخلص الايثر البترولي اظهر اعلي فعالية تجاه سالمونيلا تايفويد و مستخلص الميثانول اظهر فعاليه متوسطه بينما اظهر مستخلص الكلوروفورم اقل فعاليه. نتائج هذه الدراسة تظهر الإمكانيات العلاجية لنبات النيم وفوائده الصحية خصوصا مستخلصى الايثر البترولى والميثانول اللذين اثبتا فعالية ضد السالمونيلا بكتريا المسببه لمرض (التايفويد) مع مراعاه ازاله المحاليل العضويه المستخدمه في الاستخلاص ازاله تامه.Item A study of Methylenetetrahydrofolate reductase (MTHFR) gene polymorphism (C677T) and its association with esophageal and gastric cancers in Sudanese Patients(Al Neelain University, 2015) Wala Mohamed Mahmoud SalihBackground: Esophageal and gastric cancers remain important health burden in Sudan with poor prognosis. MTHFR gene polymorphism was reported to be associated with different types of cancers including esophageal and gastric cancers. Aim: This study aimed to investigate the presence of MTHFR gene C677T polymorphism in Sudanese patients with esophageal and gastric cancers and to correlate the polymorphism with different histopathology results. Methods: A case control study was conducted. The study was done for 44 subjects: 30 patients with esophageal cancer and 14 patients with gastric cancers. Tumor tissues and ma tched adjacent normal tissues from the same patient were collected. Demographic data regarding age, gender, ethnicity and family history were obtained using pre - designed questionnaire after taking consent from subjects under study. DNA extraction from tis sue samples was performed using guanidine chloride method followed by RFLP - PCR for genotyping by using specific MTHFR primers and HinfI restriction enzyme. Agarose gel electrophoresis was used for determination of MTHFR different genotypes. Results obta ined were statisticaly analyzed using SPSS program. Results: From demographic data, the high incidence of both esophageal and gastric cancers were among the age group (50 - 60) years, female was more affected with esophageal cancer than male with ratio 1.5:1, whereas in gastric cancer patient male were slightly higher than female with ratio 1.3:1. Afro - Asiatic ethnic group was the most affected for both esop hageal and gastric cancer with a high incidence in central Sudan for both cancer type, in western Sudan for esophageal cancer was dominant. Squamous cell carcinoma (SCC) was predominated (83.3%) in esophageal cancer patient while adenocarcinoma (ADC) (75% ) in gastric cancer patients. Regarding cancer stages and grades, most of EC patients reside within stages 2 and 3 (50%); for tumor grades , grade 2 is the most comm on represented ( 50 %), While for GC patients most of patient s are stages 2 and stage 3 repre senting (42.9%) for each ; for GC tumor grades, grade 3 is the most common represented (50%). From molecular genotyping results when comparing the different genotype between control and tumor, although 11 EC sample should mutation in tumor tissue but when tested statistically it was not significant .The distribution of the MTHFR genotypes (CC), (CT), and (TT) among EC subjects tumor samples, was found to be (63.3%),(36.7%) and (0%) respectively ; and for control samples (86.7%), (13.3%) and (0%) respectivel y. Whereas gastric cancer tumor and control samples revealed just CC genotype in all control and tumor tissue (100%) . Conclusion: From the result of this study t here was no significant association between MTHFR C677T polymorphism (p) and Sudanese esophageal and gastric cancer