Association of FOK1 gene mutation (Exon2,codon 38) with breast cancer in Sudanese female patients

Abstract

Abstract Introduction: Breast cancer is the major cancer affecting Sudanese female. VitaminD receptor (VDR) gene plays a central role in cell cycle control, initiation of apoptosis and regulation of genes involved in cellular growth, differentiation, invasion and metastasis of tumour cells . Mutation in VDR-FOK1 gene at Codon 38 exon 2 was reported to be associated with many types of diseases including cancer. Aim: This study aimed to investigate the possible association between VDR-FOK1 polymorphism at Codon 38 exon 2 and the susceptibility to breast cancer among Sudanese female patients. Methodology: A hospital based case control study was conducted. A total of 30 female patients with breast cancer were enrolled in this study. Demographic data and other data regarding age, ethnic and family history were obtained using pre-designed questionnaire. Tumor and normal tissue samples were collected from each patient for DNA extraction. DNA extraction was performed using guanidine chloride method followed by PCR for genotyping. The VDR- FOK1 exon 2 Codon 38 genotypes were determined by (PCR-RFLP) analysis. The PCR products were digested with FOK1 restriction enzyme and the DNA fragments were then detected by electrophoresis in 2% agarose gel. Results obtained were statistically analyzed using SPSS and Excel program. Result: From demographic data, the highest incidence of breast cancer was among the age group (30-40) years representing 27% with a mean age 40 years, 41% of patient subjects from canteral and 64% had family history and 77% diagnosed as invasive ductal carcinoma, 57% in grade II and 50% in stage III. The most common genotype in tumor tissue is heterozygous mutant c\t 79.3%, followed by 20.7% wild type and 0.0% homozygous mutant. While in control tissue the most common genotypes wild type 66.7% followed by 33.% heterozygous mutant. With significant association between mutation in VDR-FOK1 gene exon 2 codon 38 in tumor and control (P<. 0. 000) .No association was found between VDR-FOK1mutation at codon38cc was at different tumor stage (P<. 0.17) and grade (P<. 0.73) . Conclusion: Heterozygous mutation in VDR-FOK genotype occurred in tumor tissue more than in control tissue taken from same patient and this results indicate that mutation in VDR-FOK gene at codon3 8 cc is one of the factor that contribute to the development of breast carcinogenesis in Sudanese female.

مستخلص البحث مقدمة: سرطان الثدي هو السرطان الرئيسي الذي يصيب الإناث السودانيات. مستقبلات فيتامين د VDR)) تلعب دورا عاما في السيطرة على دورة الخلية، والشروع في موت الخلايا المبرمج.وتمايز الخلايا وهجرة الخلايا السرطانيه اثبتت الدراسات ان الطفرات في الجين VDR-FOK1 بها علاقة بالاصابة بالامراض المختلفة والبسرطان. الهدف من البحث: هدفت هذه الدراسة إلى التحقق من إمكانية وجود إرتباط بين تعدد الأشكال في تسلسل معلومات النظام الجيني (VDR-FOK1) في( exon 2 ,codon 38 والقابلية للإصابة بسرطان الثدي بين المريضات السودانيات. المنهجية: أجريت هذه الدراسة على 30 مريضة مصابة بسرطان الثدي من مستشفى الشريف. وقد تم الحصول على البيانات الديموغرافية وبيانات أخرى تتعلق بالعمر والتاريخ العرقي والعائلي بإستخدام إستبيان صمم لهذه الدراسة. تم جمع عينات من أنسجة المرضى (عينة سليمة وعينة من الورم من كل مريض) لإستخلاص الحمض النووي. تم إستخلاص الحمض النووي بإستخدام طريقة كلوريد الغوانيدين ومن ثم تم تحديد معلومات النظام الجيني لمورثات (VDR-FOK1) فيexon 2codon38 بواسطة تفاعل البلمرة التسلسلي –ثم قطعها بواسطة انزيمات قطع متخصصه (FOK1) اعتمادا على طول الموروثه والتعدد الجيني بها ثم تحليلها. و تم الكشف عنها بواسطة جهاز الرحلان الكهربي في 2% هلام. تم تحليل النتائج بإستخدام برامج SPSS الإحصائية و Excel . النتائج: أوضحت البيانات الديموغرافية ان اعمار المرضى تراوحت بين بمتوسط عمري 50 عاما و ان إرتفاع معدلات الإصابة بسرطان الثدي بين الفئة العمرية )30-40) سنة التي تمثل.23% من المرضى . 41% من المرضى من وسط السودان . سرطان القنوات المتفشية هو النوع الاكثر شيوعا لاورام الثدي (77% ). أوضحت النتائج أن معظم المرضى تم تشخيصهم في مراحل متقدمة للمرض 50% في المرحلة التانيه و الثالثة و 57% في الطور الثانى . أوضحت النتائج التحليل الجيني أن النمط الجيني الأكثر شيوعا في أنسجة الورم هو النوع T C\بنسبة 79.3%واقل انتشارا في النمط الجيني C\Cبنسبة20.7% . أما بالنسبة للأنسجة السليمة كان النوع الأكثر شيوعا في النوع C\Cبنسبة 66.7%, يليه في النوعC\Tبنسبة33.3% . أوضح تحليل النتائج وجود علاقة معنوية بين الطفرة في