PHD theses : Medical Laboratory Science
Permanent URI for this collectionhttps://repository.neelain.edu.sd/handle/123456789/496
Browse
43 results
Search Results
Item P.falciparum Immune Evasion Mechanisms: Possible Roles For Allelic Polymorphism and Antigenic Variation In Sudanese Isolates.(ALNEELAIN UNIVERSITY, 2011-07) Habab Merghani Yassin BabikerAbstract Genetic diversity within P. falciparum and the continuous variability of the parasite antigens, makes malaria an important global threat and it the reason behind failure to produce an effective vaccine against malaria. Objectives: This study aimed to determine and characterize Plasmodium falciparum genotypic variations and to detect probable genetic diversity of genotypically identical Pfalciparum isolates in Sudan and to determine whether there is any association between the presence of specific MSP-1 antibodies and the carriage of multiple P. falcinarum infections. Study design: It was cross-sectional, hospital-based and experimental study that was carried out in four localities, Kasab Rural hospital, Eddouiem, Gazira and Khartoum. One hundred and eighty six P. fulciparum infected patients were enrolled in the study. Methods: Nested polymerase chain reaction was carried out to genotyped study isolates using P. falciparum merozoite surface protein (PIMSP-1) gene specific primers. Genetic diversity of all isolates was characterized by random amplified polymorphic DNA (RAPD) analysis using thirteen arbitrary oligonucleotide primers. RAPD was also used to study the polymorphism of different isolates before and after in vitra cultures. ELISA test was performed to determine the prevalence of lgG antibodies against four rMSP-1 fragments (C-terminus, WELL, K1 DI & K1 Dll). Results: The |gG seroprevalence was 85.2, 23.8, 23.9 81 35.2 % to MSP-1,5, WELL, K1 DI & K1 Dll respectively. There was a gradual increase in overall antibody prevalence reaching a peak in adolescence and decrease thereafter. The difference was only age»specific for the C-terminal fragment. The three reported families of msp-Ialleles (K1, MADZO and R033) were observed among the studied isolates. The predominant allele was of Klvariant while R033 was less frequent. The majority of the patients had multiple parasite clones and multiplicity of infection (MOI) was found to be 1.82, this MOI was found to be higher in Kasab, Eddouiem and Khartoum and was significantly associated with age and having malaria symptoms, but not with parasitemia and fiequency of infections. Patients with multiple infections had higher prevalence of antibodies to all antigen fragments studied, compared to those with single infection, but this was only significant for MSP-119. RAPD primers recognized marked polymorphism and difierent profiles among isolates with a .laccard’s Similarity Coefficient ra.nged from 0.25 to 0.80. Different MSP-1 alleles showed different RAPD banding patterns, no certain genotype was found to be unique a certain banding pattem. Forty nine isolates were successfully in vitra cultured. RAPD analysis revealed that only 29 isolates showed different banding patterns before and after in vitro culture Conclusion: P. falciparum isolates fi'om different parts of Sudan were genetically diverse and most of the infections were mixed with a high level of multiplicity of infection (MOI). This MOI extend the duration of the infection and delay the acquisition of protective immunity, making it difiicult to produce effective vaccines against these parasites and this is in turn increase the burden of the disease and poverty. Further longitudinal large size studies, including protein analysis and mono-clonal antibodies to identify functional antibodies are needed to evaluate the impact of this polymorphism on the immune response and in tum help in developing effective vaccine against malariaItem ENDOCRINE AND METABOLIC CHANGES IN SUDANESE WOMEM WITH POLYCYSTIC OVARIAN SYNDROME(Al-Neelain University, 2019-12) Amel Abdulla Ahmed SayedPolycystic ovarian syndrome (PCOS) is the leading cause of infertility, affecting approximately six to eight percent of reproductive-age women, with a prevalence of up to 17.8% and is characterized by hyperandrogenism, irregular cycles, polycystic ovaries and obesity. In this case–control study, Sudanese women were recruited to participate, they were divided to 2 groups, one of PCOs patients set as case group and the other involved apparently healthy regular menstruating women, set as control, there were investigated for the impact of PCOs and obesity on the behavior of reproductive hormones and lipid profile among the two groups. , the two groups (case and control) divided into obese and non-obese subgroups. Hundred fifty eight samples were collected from Sudanese women, they divided in to four groups , 1st group contained 55 samples obese PCOs with age (20-45) year and body mass index BMI (27.7-37.6) kg/m2 , 2nd group contained 45 samples non obese PCOs with age (19-43) year and BMI (18.4-25.1) kg/m2 , 3rdgroup contained 28 samples obese healthy women with age (21-40) year and BMI (25.8 – 35.3) kg/m2 and the 4th group contained 30 samples of non-obese healthy women with age (20-40) year and BMI (18.9– 25) kg/m2. Measurement of fertility hormones, LH, FSH, testosterone and prolactin among all groups showed that significant increased levels of LH, testosterone and prolactin among obese PCOS more than obese control women, while decreased FSH level hormone among obese PCOS women less than levels of obese control didn’t showed significant difference. The data of non-obese PCOS group with non-obese control group, showed increased levels of LH, prolactin and testosterone levels in non-obese PCOS rather than non-obese control group women, with significant difference for each hormone, and decreased level of FSH (with no significant). Measurement of AMH level among all groups showed that levels of AMH were increased among obese PCOS and non-obese PCOS than control groups with significant for each comparison. AMH had negative correlation with age of obese PCOS women, and positive correlation with age of non-obese PCOS, Our study assessed for all groups adepokines; the level of leptin and Visfatin were increased among obese PCOS and non-obese PCOS more than control groups, but only leptin gave significant difference, and adeponectin level, which was decreased among both obese and non-obese PCOS rather than control groups showed high significant difference. Lipid profile in all groups and subgroups was identified. The lipids profile results showed significant difference in the average concentration of lipid profile parameters between obese and non-obese for the control and PCOS groups, as cholesterol, triglyceride and LDL were increased among obese PCOS and non-obese PCOS groups than obese control and non-obese control groups with significant defference, while HDL was decreased among obese PCOS and non-obese PCOS than obese and non-obese control groups. The present study revealed that leptin and vestaftin levels among obese –PCOS and non-obese PCOS were positively correlated with BMI and all lipid profile components, (cholesterol, triglyceride. LDL and HDL), while adeponectin level negatively correlated with BMI and lipid profile parameters. متلازمة تكيس المبايض هي المسبب الأساسي للعقم ,تصيب تقريبا 6- 8 % من النساء في سن الإنجاب , مع نسبة إنتشار تصل 17.8% وتتميز بزيادة في هرمون الذكورة , عدم انتظام الدورة الشهرية , تكيس المبايض و البدانة . تم توظيف نساء سودانيات للمشاركة في هذه الدراسة . تم تقسيمهن الى مجموعتين الأولى من مرضى تكيس المبايض كمجموعة تحت الدراسة و الأخرى شملت نساء أصحاء بدورة شهرية منتظمة كمجموعة ضابطة . تم إختبار مخاطر كل من تكيس المبايض و البدانة على سلوك الهرمونات التناسلية و مستويات الدهون في المجموعتين . المجموعتان (تحت الدراسة و الضابطة) قسمتا الى تحت مجموعتين نساء بدينات ونساء غير بدينات . تم جمع 185 عينة قسمت الى أربعة مجموعات المجموعة الأولى تتكون من 55 عينة لنساء بدينات مصابات بتكيس المبايض بعمر (20-45) سنة و كتلة جسم (27.7 – 37.6) كلجم/ م2 , المجموعة الثانية تتكون من 45 عينة لنساء غير بدينات مصابات بتكيس المبايض أعمارهم (19 – 43) سنة و كتلة جسم (18.4 – 25.1) كلجم / م2 , المجموعة الثالثة تتكون من 28 عينة لنساء بدينات أصحاء بعمر (21 – 40) سنة وكتلة جسم (25.8 – 35.3) كلجم /م2 و المجموعة الرابعة تتكون من 30 عينة لنساء غير بدينات أصحاء بعمر (20 – 40) سنة و كتلة جسم (18.9 – 25) كلجم / م2 . قياس هرمونات الخصوبة ؛ هرمون اللوتنة (LH), الهرمون المحفز للحويصلاتFSH) ), هرمون الذكورة ((Testosterone و هرمون اللبن (PRL) خلال كل المجموعات أظهرت إرتفاع معنوي في هرمون اللوتنة (LH) , الذكورة ((Testosterone و هرمون اللبن (PRL) في النساء البدينات المصابات بتكيس المبايض أكثر من النساء البدينات الأصحاء . بينما إنخفض مستوى الهرمون المحفز للحويصلات FSH)) انخفاضا غير معنوي في النساء البدينات المصابات بتكيس المبايض أقل من مستواه في النساء البدينات الأصحاء . بيانات مجموعة النساء غير البدينات المصابات بتكيس المبايض مع النساء غير البدينات الأصحاء أظهرت زيادة معنوية في مستويات هرمونات اللوتنة (LH) , اللبن (PRL) و الذكورة (Testosterone) و إنخفاض غير معنوي للهرمون المحفز للحويصلات FSH)) في النساء غير البدينات المصابات بتكيس المبايض أكثر من النساء غير البدينات الأصحاء. قياس مستوى الأنتي موليرين هورمون (AMH) Anti-Mullerian Hormone في كل المجموعات أظهر زيادة معنوية في مجموعتي النساء البدينات و غير البدينات المصابات بتكيس المبايض أكثر من مجموعتي النساء البدينات و غير البدينات الأصحاء. ال AMH له إرتباط سلبي مع العمر في النساء البدينات المصابات بتكيس المبايض و إرتباط إيجابي مع العمر في النساء غير البدينات المصابات بتكيس المبايض . في دراستنا تم قياس هرمونات الدهون في كل المجموعات ,مستوى اللبتين و الفيسفاتين إرتفع خلال النساء البدينات و غير البدينات المصابات بتكيس المبايض أكثر من المجموعات الضابطة, لكن اللبتين وحده أعطى فروقات معنوية , وإنخفض مستوى الأديبونكتين إنخفاضا معنويا كبيرا خلال النساء البدينات و غير البدينات المصابات بتكيس المبايض أكثر من مجموعتي النساء البدينات و غير البدينات الأصحاء. تم التعرف على مستويات الدهون في كل المجموعات , و أظهرت النتائج إختلافات معنوية في متوسط تركيز مستويات الدهون بين البدانة و غير البدانة في مجموعات المصابات و الأصحاء, إرتفع معنويا مستوى كل من الكوليستيرول (Cholesterol) , الدهون الثلاثية (TG) و البروتينات الدهنية منخفضة الكثافة(LDL) خلال مجموعتي النساء البدينات و غير البدينات المصابات بتكيس المبايض أكثر من مجموعتي النساء البدينات و غير البدينات الأصحاء , بينما إنخفض مستوى البروتينات الدهنية مرتفعة الكثافة(HDL) خلال النساء البدينات وغير البدينات المصابات بتكيس المبايض أكثر من البدينات وغير البدينات الأصحاء . وأظهرت النتائج أيضا إرتباط إيجابي لمستوى كل من اللبتين و الفسفاتين مع كتلة الجسم و كل مستويات الدهون (الكوليستيرول , الدهون الثلاثية , البروتينات الدهنية منخفضة الكثافة و البروتينات الدهنية مرتفعة الكثافة) بينما مستوى الأديبونكتين له إرتباط سلبي مع كتلة الجسم و مستويات الدهون .Item Biochemical Assessment of Malnutrition, Inflammation and Atherosclerosis Syndrome in Patients with Chronic Renal Failure on Maintenance Hemodialysis Therapy in Khartoum State(Al-Neelain University, 2018-11) MOHAMED SIDDIG MOHAMED AHMEDAbstract Background: MIA Syndrome in CKD is the most important factor in the genesis of several complications in renal disease, remains one of the major causes of morbidity and mortality characterized by changes in circulating levels of plasma proteins, cytokines and Athero-thrombogenic markers Materials and Methods: This was analytical case control study, Conducted at Ahmed Gasem Hospital, Omudrman Teaching Hospital, Khartoum Teaching Hospital and Ibn Sina Speacialized Hospital, from December 2014 to December, 2016. The study included one hundred CKD patients on regular hemodialysis maintenance therapy and one hundred age and sex matched healthy controls. Serum biochemical parameters measured spectrophotometrically by enzymatic methods using Mindray BS-200 Clinical Chemistry Analyser (China) and sandwich Enzyme-Linked Immunosorbent Assay using Stat Fax Micro-strip Reader (Awareness Technology, USA) while BMI calculated from a subject’s height and weight Results: the result of this study shows that hypertension was the most common cause of CKD (35.0% of respondents). Patient were age <40 years account 41% while age >40 years were 51%. 13% of our CKD patients were underweight followed by 58% normal weight, 23% overweight and 6% obese. Furthermore, 48% of the case group under dialysis treatment for <5years while 52% on Dialysis maintenance therapy for >5 years. Chi-square test analysis showed that, the frequency of serum hs-CRP was higher in CKD patients when compared with control group 60% of CKD patients were positive with hs-CRP, OR=6.0 (95% CI: 3.2-11.3, p-value<0,01).The mean serum level of IL-1β, TNF-α, IL-6, hs-CRP, Triglycerides, Fibrinogen, Lp(a) and Homocysteine were significantly increased in CKD (291+25.2, 283+22.2, 254+19.7, 16.6+3.83, 252+29.5, 499+56.5, 60.3+20.7 and 24.3+6.4) when compared with control group (155+ 36.3, 145+35.2, 104+32.0, 3.2+1.3, 121+51.3, 285+41.5, 7.57+ 5.6 and 7.49+ 3.1) with p-value (0.000, 0.000, 0.000, 0.000, 0.000, 0.000, 0.000 and 0.000) respectively. The mean serum level of Albumin, Pre-albumin, Transferrin, BMI, and HDL-Cholesterol were significantly decreased in CKD (3.12+0.69, 15.7+4.31, 308.7+20.8, 18.5+ 2.5 and 45.7+6.4) when compared with control group (4.70+ 0.4, 36.4+ 7.2, 320+ 24.3, 21.4+ 3.6 and 65.1+ 7.2) with p-value (0.000, 0.000, 0.000, 0.000 and 0.000) respectively. Our findings showed No significant difference between the Mean concentrations of study parameters of hemodialysis CKD patients and gender groups (Male, Female). In Pearson’s correlations test the BMI were Correlated positively with Serum Albumin and Prealbumin and correlated negatively with Serum IL-6, hs-CRP and duration of dialysis in CKD patient group, while the Age was correlated positively with IL-1 β and the Duration of Dialysis were correlated negatively with albumin, pralbumin and BMI and correlated positively with IL-6 and hs-CRP in CKD patient group. Serum hs-CRP was correlated negatively with Albumin, pralbumin and positively with IL-6. Conclusion: The study concluded that hypertension was the leading causes of CKD, CKD patients had higher levels of serum TNF-alpha, IL-1 Beta, IL-6, triglycerides, Lp(a), fibrinogen and homocysteine level, As well as decreased serum level albumin, pre-albumin, transferrin, BMI and HDL-Cholesterol. The hs-CRP suggested as highly sensitive and specific early predictor marker of cardiovascular risk event in CKD patients on maintenance haemodialysis therapy. الملخص نبذة تاريخية:متلازمة الميا في مرضى الفشل الكلوي المذمن تعتبر عامل مهم في تكوين العديد من التدهورات الخطيرة في أمراض الكلى. ولها دور أساسي وتظل من الأسباب الأساسية للمراضة والوفيات وتتميز بتغيرات في معدلات البروتينات والسايتوكينس وموسومات تصلب الشرايين والتجلط. الطرق والمواد:منھج الدراسة (ألإختبار-ألضبط)،أجريت الدراسة بمستشفى أحمد قاسم, أمدرمان التعليمي, الخرطوم التعليمي و بن سيناء التخصصي حيث بداءت الدراسة في ديسمبر 2014 وحتى ديسمبر 2016 وإشتملت الدراسة على 100 شخص من مرضى الفشل الكلوي المتعالجون بالدیال الدموي كمجموعة مرضیة و 100شخص من الأصحاء يتطابقون مع المجموعة الاولىمن حيث العمر والجنس كعینات ضابطة. تم قياس فحوصات الكيمياء الحيوية في المصل عن طريق الاسبكتروفوتوميترباستخدام جهاز مندراي بي اس 200 (الصين).والساندويش اليزا باستخدام جهاز ستات فاكس قارئ المايكروسترب من شركة اورنس تكنولوجي, امريكا. تم حساب مؤشر كتلة الجسم من أطوال وأوذان الاشخاص . النتائج:أظهرت النتائج أن إرتفاع ضغط الدم كان أكثرالامراض المسببة للفشل الكلوي المزمن (35%). المرضى زوي الاعمار أقل من 40 عاماً يمثلون 41% و المرضى زوي الاعمار أكثر من 40 عاماً يمثلون 51%.13% من المرضى يعانون من ضعف الوزن, 58% أوزان طبيعية, 23% زيادة في الوزن و6% يعانون من السمنة.كزلك 48% من مجموعة الإختبار يتعالجون بالديال الدموي أقل من 5 سنين و52% يتعالجون بالديال الدموي أكثر من 5 سنين. التحليل الإحصائي Chi-square أظهرأن تردد hs-CRP في المصل أعلى في مرضى الفشل الكلوي المزمن عند مقارنتهم بالمجموعة الضابطة و60% من مرضى الفشل الكلوي المزمن كانت نتائجهم أيجابية في إختبار hs-CRP, OR=6.0 (95% CI: 3.2-11.3, p-value<0,01). وأظهرت الدراسة أن متوسط نتائج IL-1β, TNF-α, IL-6, hs-CRP, Triglycerides, Fibrinogen, Lp(a) Homocysteine أعلى إحصائياً في مرضى الفشل الكلوي المزمن (291+25.2, 283+22.2, 254+19.7, 16.6+3.83, 252+29.5, 499+56.5, 60.3+20.7 and 24.3+6.4) عند مقارنتهم بالمجموعى الضابطة (155+ 36.3, 145+35.2, 104+32.0, 3.2+1.3, 121+51.3, 285+41.5, 7.57+ 5.6 and 7.49+ 3.1) وكانت قيمةالP تساوي 0.000 في جميع الإحصائيات. وكما أظهرت الدراسة أن متوسط نتائج Albumin, Pre-albumin, Transferrin, BMI, and HDL-Cholesterol أقل إحصائياً في مرضى الفشل الكلوي المزمن (3.12+0.69, 15.7+4.31, 308.7+20.8, 18.5+ 2.5 45.7+6.4) عند مقارنتهم بالمجموعى الضابطة (155+ 36.3, 145+35.2, 104+32.0, 3.2+1.3, 121+51.3, 285+41.5, 7.57+ 5.6 and 7.49+ 3.1))وكانت قيمةالP تساوي 0.000 في جميع الإحصائيات. وكذلك أظهرت نتائج الدراسة عدم وجود فروق معنوية بين النساء والرجال في الاختبارات التي أجريت على مرضى الفشل الكلوي المزمن. أظهرت نتائج إختبار الإرتباط Pearson’s بأن BMI إرتباط بعلاقة إيجابية مع Albumin,Prealbumin و علاقة سلبية مع IL-6, hs-CRP و duration of dialysisكما أن العمرإرتبط إيجابياً مع IL-1 β.وايضاً فترة المعالجة بالديال الدموي ارتبطة إيجابياً مع IL-6 and hs-CRP وسلبياً مع albumin, pralbumin and BMI وبالإضافة إرتبط hs-CRP إيجابياً مع IL-6 وسلبياً مع Albumin, pralbumin. ألخلاصة: خلصت ألدراسة الي أن إرتفاع ضغط الدم هو ألمسبب الرئيسي لمرض الفشل الكلوي المذمن, وأن مرضى الفشل الكلوي المزمن لديهم إرتفاع معدلات TNF-alpha, IL-1 Beta, IL-6, triglycerides, Lp(a), fibrinogen homocysteine وكذلك إنخفاض معدلاتalbumin, pre-albumin, transferrin, BMI and HDL-Cholesterol في مصل الدم. كما أوضحت نتائج الدراسة بأن إختبار hs-CRP حساس ومتخصص وذو قيمة تنبوٌية مبكرة لخطر اللإصابة بامراض القلب والأوعية الدموية عند مرضى الفشل الكلوي المزمن المتعالجون بالديال الدموي.Item HEPATITIS B VIRUS INFECTION AND VIRUS GENOTYPES AMONG PREGNANT WOMEN IN AL FASHIR TOWN - NORTH DARFUR STATE(Al-Neelain University, 2019) Ragaa Mohamed Abo El Gasim AhmedAbstract Background: Sudan is a highly endemic country for hepatitis B virus (HBV). Pregnant women with HBV represent a major reservoir of the virus in the community. Of the epidemiological studies carried in different regions of Sudan few are available regarding pregnant women. In Darfur region such data is absent. The study aimed to evaluate prevalence of HBV, risk factors and genotypes circulating among pregnant women attending antenatal care in Al Fashir town. Methods: This descriptive cross sectional hospital based study conducted during the period from June 2013 to July 2016. A total of 900 pregnant women were enrolled. Most of the studied women age range were 15 to 50(86%), mostly were housewives (87%) and 90% of low class income. Socio-demographic, obstetrics and medical data were collected using structured questionnaires. Blood samples were collected; plasma separated and tested for the HBV markers (HBcAb, HBsAg, HBeAg, HBeAb) using ELISA. DNA was extracted and genotypes were identified by multiplex˗ nested PCR. Results: HBcAb was detected in 46% with higher exposure in those of the age range 15 – 25 years. 162 (18%) were HBsAg positive. HBeAg and HBeAb were found in 2.6% and 37.7% respectively. There was significant association between residence, occupation, income, bloodletting and ear piercing with HBV infection (P ˂ 0.05). Of the 162 HBsAg positive pregnant women, 148(91%) samples were further studied for genotypes characterization. Genotype specific bands were detected in 97 (65.5%) samples while the remaining 51(34.5%) samples remained untypable. 31 samples (31.9%) were classified as genotype D, 30(30.9%) as genotype E and 3(3.1%) as genotype A. Mixed genotypes were detected in 33(34.0%) samples as {A+D; 17(17.5%), D+E; 13(13.4%), A+D+E; 3(3.1%)}. Conclusion: The results of the study suggest that HBsAg has higher prevalence among the pregnant women in Al Fashir town, North Darfur State. So, to minimize the burden of the disease antenatal women must be routinely screened for HBV. A high percentage of the pregnant women infected with mixed HBV genotypes, therefore, it is an important consideration for the clinician to adopt better strategies for prevention and cure of HBV infection. الخلاصة الخلفية : السودان قطر اكثر استيطانا بفيروس التهاب الكبد الوبائي البائي . وتعتبر النساء الحوامل الحاملات للفيروس مصدر لانتشاره في المجتمع. من بين الدراسات الوبائية التي اجريت للمصابين بهذا الفيروس في مناطق مختلفة من السودان , قليل منها اجريت في الحوامل, ونسبة لعدم توفر الدراسات في منطقة دارفور اجري هذا البحث لتقييم مدى انتشار هذا الفيروس, عوامل الاختطار ذات الصلة والنوع الجيني وسط النساء الحوامل بمراكز الرعاية الصحية بمدينة الفاشر, ولاية شمال دارفور. طريقة البحث:هذه الدراسة وصفية اجريت في الفترة ما بين 2013June – 2016July , شملت تسعمائة (900) امراة حامل, حيث تراوحت اغلب اعمارهن ما بين 15 – 35(86%) , اغلبهن ربات منازل (87%) و90% منهن من ذوي الدخل البسيط . تم جمع المعلومات الديموغرافية و الطبية من النساء بتقديم استبيانات. بعد جمع العينات تم فصل بلازما الدم وحفظها تحت التجميد لحين اجراء الفحوصات السيرولوجية. استخدم فحص الاليزا (ELISA) لتحديد الايجابية السيرولوجية لعدوى الالتهاب الكبدي الوبائي البائي والكشف عن علامات الاصابة بالفيروس (HBcAb, HBsAg, HBeAg, HBeAb). للتعرف علي الانواع الجينية استخدمت طريقة ال Multiplex-Nested PCR بعد استخلاص المادة الجينية من بلازما الدم. النتائج : اظهرت الدراسة ان 46% من النساء قد تعرضن للاصابة بالفيروس و18% منهن كن موجبي المستضد (s) , من بينهن 2.6% كن موجبي المستضد (e)و37.7% كن موجبي الضد e)). كما وجد ان هناك ارتباط ذو دلالة احصائية بين الاصابة بالفيروس وكل من السكن, المهنة, مستوى الدخل,الحجامة وفتحة القرط (قيمة P˂ 0.05 ). تم اجراء التحليل الجيني على148(91%( من العينات موجبي المستضد (s). اظهرت 97 ( 65.5%) منها الاحزمة الجينية بينما بقيت 34.5% (51) منها بدون تمييز. اظهرت نتيجة التحليل الجيني ان الانواع المنتشرة وسط مجموعة الدراسة تشمل النوع الجيني D)) (31.9%) , النوع الجيني E)) (30.9%) , النوع الجيني (A) (3.1%) كما تم تصنيف خليط من الجينات الثلاثة في 33 عينة (34.0%){A+D; 17(17.5%), D+E; 13(13.4%)} A+D+E; 3(3.1%)}. الاستنتاج :الدراسة تعكس مدى اصابة النساء الحوامل بمرض التهاب الكبد الوبائي البائي مع التنوع الجيني للفيروس بمدينة الفاشر, حيث ان نسبة النساء الحوامل اللائي يحملن الفيروس كانت كبيرة , لذا يجب تفعيل الفحص الدوري لتقليل نسبة المصابات بالفيروس. كما ان النتائج تشير الى ان الوضع يحتاج الى المزيد من الجهود ووضع الاستراتيجيات المناسبة للوقاية والعلاج من المرض.Item Molucular Detection of Mycoplasma genitalium and Chlamydia Trachomatis in Urine Samples of Strile Pyuria Patients Attending Urology Clinics in Khartoum State(Al-Neelain University, 2019) Eshraga Sir Elkhatim Alhaj SaeedAbstract Sterile pyuria is a condition in which WBC are present in the urine (≥ 10/HPF)) without bacterial growth in a standard culture which it associated with a number of infective agents including viruses, fungi and a typical or fastidious organism such as Mycoplasmas, Ureaplasmas and Chlamydialssp. The aim of this study was to determine the occurrence of C.trachomatis and M.genitalium, in patients with sterile pyuria. Three hundred patients withUTI symptoms were enrolled in this study (150 males and 150females) aged ranged beteewn 20 to 50 years attending the urology clinic in Khartoum state. Urine samples were collected during the period from June 2015 to December 2015 and tested by real time polymerase chain reaction (R.T.PCR) for the presence of C. trachomatis, M. genitalium, insterile pyuria samples, using specific primers for each species. Urine sampleswhich resulted no growth after cultured on blood, CLED, sabouroud and mackoncy agar and show presence of (≥ 10/HPF) were (275)out of (300) samples, soReal time PCR amplified DNA from(275) in whichC. trachomatis was detected in, 15 (5%) on other handM. genitalium was not detected (0%),most of study population (53.3%) belonged to (31-40)age group, which it was 8 out of 15 positive cases then high prevalence of C. trachomatis was observe damong this age group when compared with other age group. The difference in occurrence of C. trachomatis was statistically significant between males and females in female detected 12 (8%) out of 155sterile pyuria, and in male detected 3(2.5%) samples out of 120 sterile pyuria. Real time PCR testing of sterile pyuria showed numbers of C.trachomatis infections. Consequently real time PCR is recommended for the detection of those microorganisms in the urine samples of sterile pyuria patients which it is difficult to be isolated by ordinary conventioal methods, also real time PCR assay provide a rapid and effective measure to detect those fastidious organisms in sterile pyuria. الخلاصة عينات البول القيحيه سالبه المزرعه الكتيريه هى عينات يكون فيه عدد كريات الدم البيضاء اكثر من10فى الحقل الواحد وتعطى نتيجه سلبيه عند تزريعها فى الاوساط الغذائيه الخاصه بهاوهى ايضا مرتبطة بعددا من المسببات الاخرى وتضم الفيروسات والفطريات و الكائنات واشباه الكائنات التى تحتاج لبيئه خاصه للنمو مثل انواع المايكوبلازما واليوروبلازما والكلاميديا . هدفت هذه الدراسه الى التعرف على نسبه تواجد بكتيريا المايكوبلازما جانتاليوم اوالمفطوره التناسليه وبكتيريا الكلاميديا تراكومومتس او المتخثره فى عينات البول القيحيه سالبه المزرعه البكتيريا التى اخذت من اشخاص يعانون من اعراض مرضيه فى المسالك البوليه والتناسليه حيث جمعت العينات فى الفتره من بدايه يونيو2015 الى ديسمبر 2015من المرضى اللذين يترددون على عيادات المسالك البوليه والتناسليه بمستشفى الخرطوم وشملت الدراسه 300 مريض (150 ذكرو150انثى ) اعمارهم فوق العشرين وتم فحص 275 سالبه المزرعه البكتيريه من مجموع 300 عينه والتى تم تزريعها فى ثلاثه اوساط غذائيه مختلفه ثم تم استخدام تقنيه سلسله تفاعلات البلمره ذات الوقت الحقيقى باستخدام بادى للبلمبره لكل نوع . خلال هذه الدراسه حصلنا 15(%5) عينه موجبه لبكتيريا الكلاميديا تراكومومتس او المتخثرة بينما لم توجد المايكوبلازما جانتاليوم (%0) بواسطه فحص سلسله تفاعلات البلمره ذات الوقت الحقيقى من مجموع 275 عينه قيحيه سالبه المزرعه البكتيريا. وقد اظهرت النتائج فروقات ذات دلاله احصائيه بين نسبه اصابه الذكور والاناث بالكلاميديا حيث كانت سجلت الاناث اعلى نسبه بالاصابه 12 (%8) من مجموع 155والذكور 3 (2.5%) من مجموع 120امابالنسبه للاعمار فكانت الفئه العمريه بين 31الى 40 هى اكثر الاعمار اعلى نسبه اصابه8 (%35) . نستخلص من هذا البحث ان استخدام تقنيه سلسه تفاعلات البلمره ذات الوقت الحقيقى اثبت ان هنالك وجود لهذا النوع من البكتريا فى عينات البول سالبه المزرعه البكتيرياهوان هذه التقنيه ضروريه فى تشخيص هذه النوع من البكتريا التى يصعب تشخيصها با لطرق التقليديه لذالك توصى الدراسه باستخدام هذه التقنيه فى مراكز الخدمات الصحيه لدقه وسرعه النتائج التى يتم الحصول عليها ممايؤدى الى سرعه التشخيص واختيارالعلاج المناسب.Item Telomere Length, human Telomerase Reverse Transcriptase (hTERT) Level, CD38, and ZAP-70 in relation to Clinical and Hematological Parameters in Sudanese Patients with Chronic Lymphocytic Leukemia(Neelain University, 2019) Ameen Abdulaziz Mohammed OmerBasbaeenAbstract Background: As the clinical course of Chronic Lymphocytic Leukemia patients is very heterogeneous, the search for reliable prognostic markers that could predict disease progression and clinical outcome at an early stage of the disease is of great importance.Human Telomerase Reverse Transcriptase protein is the rate limits of telomerase enzyme. Many studies showed a correlation between hTERT mRNA expression with clinical aggressiveness, also used as a prognostic indicator in CLL. This study aimed to determine Telomere Length, human Telomerase Reverse Transcriptase (hTERT) Level, CD38, and ZAP-70 in relation to Clinical and Hematological Parameters in Sudanese Patients with Chronic Lymphocytic Leukemia. Material and methods: A cross-sectional descriptive study was conducted in Khartoum state, Sudan, involved 110 CLL patients and 50 healthy volunteers who selected for molecular analysis as a control group. Physical examination, Complete Blood Count and Immunophenotype were performed in all patients to confirm the diagnosis. Clinical staging such as Rai and Binet were studied. CD38 and ZAP70 were performed by Flow Cytometry. human Telomerase Reverse Transcriptase(hTERT) protein level was assessed by Flow Cytometry (EPICS XL Beckman Coulter Flow Cytometer, Miami, FL, USA) and using primary polyclonal antibody (BioVision-USA). Genomic DNA was extracted from all blood samples by using Blood DNA Extraction Kit (ANALYTIKJENA-Germany), telomere length was assessed byquantitative real-time PCR (qRT-PCR) (Sacace Biotechnologies, Como, Italy). Results: In this study, 79(71.8%) were male and 31(28.2%) were female (M/F ratio, 2.55), and the mean age at the time of diagnosis was 62.97 years. Lymphadenopathy, Splenomegaly, Hepatomegaly, Leukocytosis, thrombocytopenia, and anemia were seen in 78(71%), 54(49%), 14(13%), 67(60.9%), 43(39%) and 38(34.5%) of patients respectively. About 90% of patients displayed an advanced Rai risk stage (41.8% were Intermediate-Risk and 49.1% were high risk) and 70% were at Binet stage B or C. On the other hand, CD38 and ZAP-70 were expressed in 41(37.3%) and 36(32.7%) of patients respectively.Combined expressions of both ZAP-70 and CD38 occurred in 20(18.2%)patients, 53(48.2%)patients wereexpressed ZAP-70-/CD38- and 37(33.6%)patientshad either ZAP-70+ or CD38+.hTERT expression was determined in a total of 110 CLL samples, the overall mean expression level was 77.29±30.57 (range 0.1%-99.5%), whereas, hTERT Mean Fluorescence Intensity (MFI) expression a mean of 3.75±2.14 with a range of (0.78-10.20). There was a significant and positive correlation between TERT percentage and MFI. hTERT was expressed in 97(88.2%) of patients showed a high level of hTERT protein above the cut off value. The mean age of the patients was significantly higher among hTERT-positive patients than hTERT-negative. A significant association was found between hTERT percentage expression and the advanced B/C Binet stage as well as older age.The Telomere length was significantly shorter in CLL patients than in healthy controls. Furthermore, there was a significant and negative correlation between hTERT protein level expression and TL. Regarding median Telomere length, the WBCs and ALC were significantly high in patients with short telomere length. Telomere length was significantly shorter in cases with a CD38 positive. Significantly associations were encountered between high hTERT/short telomere and advance B/C Binet stage, high WBC counts, high ALC, and high B lymphocyte counts. Conclusion: hTERT protein levels tend to be higher in the advancedBinet stage as well as an older age. Telomeres were significantly shorter in CLL patients compared to healthy control. The shortening of TL was associated with high hTERT protein level expression. Demographic characteristics influences have no effect on TL in CLL patients. TL was correlated with activation/proliferation marker such as CD38 expression in CLL cells. المستخلص مقدمة: نظرًا لأن الدورة السريرية لمرضىسرطان الدم الليمفاوي المزمنCLL غير متجانسة للغاية، فإن البحث عن علامات نذير موثوقة يمكن أن تتنبأ بتطور المرض والنتائج السريرية في مرحلة مبكرة من المرض له أهمية كبيرة. بروتبن التيلوميراز العكسي البشري هو المحدد الاساسي لفعالية أنزيم التيلوميراز. هناك عدة دراسات لاحظت وجود علاقة بين تعبير التيلوميراز العكسي البشري معا العدوانية السريرية، وأيضا يستخدم كامؤشر نذير عند مرض سرطان الدم اللمفاوي المزمن.هدفت هذه الدراسة تحديد طول التيلومير ومستوى التيلوميراز العكسي البشري و CD38 وكذلك ZAP70 وعلاقتهم بالمؤشرات السريرية والدموية في المرضى السودانيين المصابين بسرطان الدم الليمفاوي المزمن. المواد والطرق :أجريتهذةالدراسة الوصفية المستعرضة في ولاية الخرطوم،جمهورية السودان، وشملت عينة الدراسة 110 من مرضى.CLL وتم إجراء الفحص السريري وتعداد الدم الكامل ونمط المناعة في جميع أفراد العينة لتأكيد التشخيص. بعد ذلك صُنف المرضى حسب تصنيفRai وBinet. ثم قياس مؤشرات النذير CD38 و ZAP70 بواسطة التدفق الخلوي. وعلاوة على ذلك أجري تقييم مستوى بروتين hTERTباستخدام الأجسام المضادة الأولية (BioVision-USA) بواسطة التدفق الخلوي.(Flow Cytometry) ولقياس طول Telomere تم أخذ عينات الدم من مرضى CLL 110 وفي المقابل أخذت 50 حالة لاشخاص سليمين كعينة مراقبة وأستخلص الحمضالنووي الريبي منقوص الأكسجينباستخدام (Blood DNA Extraction Kit-(ANALYTIKJENA-Germany، وتم قياس طول Telomere بواسطة تفاعل البلمرة المتسلسل الكمي .(qRT-PCR) النتائج :أظهرتنتائج أن عدد الذكور 79 بنسبة (71.8٪)، بينما الإناث 31 بنسبة (28.2٪)، وترواح معدل الذكور الى الإناث 2.55. وكان متوسط العمر لجميع العينات 62.79 عاما.وأوضحت نتائج التشخيص الأولي أن عدد78 مريض كان لديهم تضخم في العقد اللمفاوية بنسبة (71 ٪)، وأن 54 مريض كان لديهم تضخم في الطحال بنسبة (49 ٪)، وأن 14 مريض كان لديهم تضخم في الكبد بنسبة (13 ٪)، وأن 67 مريض كان لديهم زيادة في عدد كرات الدم البيضاء بنسبة (60.9 ٪)، وأن43 مريض كان لديهم نقص في الصفائح الدموية بنسبة (39 ٪)، وأن 38مريض كان لديهم فقر دم بنسبة (34.5 ٪). وفيما يخص تصنيف المرضى اعتمادا على تصنيف Rai أظهرت النتائج أن 90٪ من المرضى كانوا في مراحل متقدمة (41.8٪ كانوا في مرحلة متوسطة من الخطورة و 49.1٪ في مرحلة متقدمة من الخطورة). أما التقسيم حسب تصنيف Binet فكان 70٪ من المرضى في المراحل B وC . ومن ناحية أخرى أظهر 41 (37.3 ٪) و 36 (32.7 ٪) من المرضى مستوى عالي منCD38 و ZAP-70على التوالي. وبينت نتائج التعابير المجمعة ل CD38 وZAP-70وجود ثلاث مجموعات (ZAP-70+/CD38+، ZAP-70-/CD38-، إما ZAP-70+ أو CD38+) بنسب (18.2٪، 48.2٪، 33.61٪) على التوالي. وتم قياس بروتين hTERT في جميع مرضىCLL ، وكان متوسط مستوى بروتين hTERT 77.29٪ (المدى 0.7 ٪ - 99.5 ٪.(بينما كان متوسطhTERT MFI 3.75 (المدى 0.78-10.20).وظهر ارتباط إيجابي بين نسبةhTERT وقيمة.MFI وأظهر 97مريضمانسبتة (88.2٪) مستوى عال من بروتينhTERT أعلى من قيمة القطع.كان متوسط عمر المرضى أعلى بكثير بين مرضى hTERT الإيجابي مقارنة بسلبية.hTERTووجد أن هناك علاقة ذات دلالة إحصائية بين نسبة وجود بروتين hTERT وتصنيف BinetB وC وكذلك العمر. أيضالوحظ أن طول Telomere أقصر بكثير في مرضى CLL مقارنة بالعينة المراقبة وكان الفارق ذو دلالة احصائية. وعلاوة على ذلك كان هناك ارتباطاً عكسياً ذو دلالة احصائية بين تعبير مستوى بروتين hTERT وطول.Telomereكانت خلايا الدم البيضاء الكلية وعدد الخلايا اللمفاوية المطلقة عاليةً بشكل ملحوظ في المرضى الذين كان لديهم قُصرفي طول الTelomere. حيث كان طول Telomere أقصر بكثير في الحالات التي كانت فيها CD38 إيجابية. إذ لا توجد علاقة ذات دلالة إحصائية بين طول Telomere ووجودZAP-70وكذلك التعبيرات المدمجة لكلا المؤشرين ZAP-70/CD38.تمت ملاحظة ارتباطات كبيرة بين High HTERT/short telomere والمراحل المتقدمة من تصنيف Binet وزيادة عدد كرات الدم البيضاء وكذلك ارتفاع عدد الخلايا اللمفاوية المطلق، وعدد الخلايا اللمفاوية B. خاتمة :تشير هذه البيانات إلى أن مستوى بروتينhTERT قد يلعب دورًا مهمًا في بيولوجياCLL ، ويميل مستوى البروتينhTERT . إلى أن يكون أعلى في مرحلةBinetالمتقدمة بالإضافة إلى تقدم السن ويعد قصرTelomere أحد الخصائص الشائعة لسرطان الدم اللمفاوي المزمن.وهناك ارتباط بين طول Telomereوزيادة بروتين.hTERT كذلك لا تؤثر الخصائص الديموغرافية على طول Telomere لدى مرضى .CLLوهناك ارتباط وثيق بين طول Telomere وعلامات زيادة التحفيز والتكاثر مثل مؤشر النذير CD38في خلاياCLL.Item Assessment of Serum Soluble Klotho Protein Level among Sudanese Relatives of Chronic Kidney Disease Patients(Neelain University, 2019-11) Abozaid Mohammed Hamid ElemamABSTRACT Background: Chronic kidney disease (CKD) and end stage renal disease are becoming major health problems throughout the world with increase prevalence. It was recommended to discover it earlier, especially at high risk individuals by using ordinary renal biomarkers or new suggested biomarkers such as soluble klotho protein which was found to be decreased among CKD individuals. Objective: To assess serum soluble alpha- klotho protein level in relation to renal function parameters among Sudanese first degree relatives (FDRs) of patients with chronic kidney disease. Materials & Methods: This is analytical, case control study conducted at Khartoum state during May 2015 to May 2019, targeting 135 Sudanese first degree relatives of end stage renal disease (ESRD) patients on hemodialysis and 161 apparently healthy individuals served as control group. Their serum was prepared and analyzed for soluble klotho protein, creatinine, uric acid, calcium and phosphate. Also spot random urine sample was collected and analyzed for creatinine and micro albumin from which albumin to creatinine ratio (ACR) was calculated. The plasma parameters were analyzed by Mendray BS 200 auto analyzer, while urine parameters were analyzed by using Cobas auto analyzer. Results: First degree relatives were found to had higher significant prevalence (19.3 %) of CKD than control group (6.8%), the p. value was 0.001 and significantly lower mean level of serum soluble klotho than control (mean ± SD): (856.2 ± 477.6 ng/ml) vs. (1068 ± 590.7 ng/ml), (p-value = 0.001). Meanwhile the mean levels of urine micro albumin, urine creatinine, ACR and GFR-EPI showed significant differences between FDRs and control group, with means ± SD: ( 123.1 ± 68.2 mg/L), (153.3 ± 115.3 mg/dl), (10 ± 4.4 mg/gm), and ( 93.1 ± 25.6 ml/min/1.73m2) for FDRs versus (14.9 ± 2.05 mg/L), (190.3 ± 108.8 mg/dl), (0.92 ± 0.1 mg/gm ) and (99.4 ± 22.5 ml/min/1.73 m2) for control group, and the P were : 0.001, 0.005, 0.024 and 0.027 respectively. The mean level of serum soluble klotho protein was significantly decreased in FDRs with age group more than 40 years and in those with eGFR less than 60 ml/min/1.73m2 (mean ± SD : 750.3 ± 443.9 ng/ml & 576.2 ± 270.5 ng/ml and the P: 0.013 and 0.045 ) . Finally the serum soluble klotho protein was positively correlated with ACR (r: 0.180, P: 0.037) eGFR (r: 0.240, P: 0.005), serum phosphate (r: 0.240, P: 0.004) and creatinine clearance (r: 0.174, P: 0.044) and negatively correlated with age (r: - 0.218, P: 0.011) and serum creatinine (r: - 0.188, P: 0.029). Conclusion: Immediate family members of ESRD patients had higher frequency of CKD, reduced serum klotho level and e-GFR whereas ACR is increased among them, therefore they are at higher risk for developing CKD. Serum klotho protein is decreased among FDRs with older age and reduced eGFR. There is positive correlation of serum klotho protein with ACR, e-GFR and creatinine clearance, and negative correlation with serum creatinine and age so serum klotho protein is strongly associated with renal function parameters. مستخلص البحث تمهيد: مرض الكلى المزمن (CKD) والفشل الكلوى النهائى (ESRD) من المشكلات الصحية الشائعة في جميع أنحاء العالم مع زيادة مطردة فى معدل الانتشار. وقد أوصى باكتشافه في وقت مبكر ، خاصةً عند الأفراد الاكثر عرضة للاصابة عن طريق استخدام الموسمات الحيوية الكلوية العادية أو موسمات حيوية جديدة مقترحة مثل البروتين كلوثو الذائب والذي وجد أنه ينخفض لدى الأفراد الذين لديهم CKD. الهدف من الدراسة: تقييم مستوى البروتين كلوثو الذائب في الدم وعلاقته بالموسمات الحيوية لوظائف الكلى لدى الأقارب من الدرجة الأولى (FDRs) السودانيين للمرضى الذين يعانون من مرض الكلى المزمن النهائى . المواد والطرق: هذه دراسة مقارنة حالة تحليلية أجريت في ولاية الخرطوم خلال الفترة من مايو 2015 إلى مايو 2019 ، استهدفت 135 شخصا من اقارب الدرجة الاولى لمرضى الفشل الكلوى من نهاية المرحلة (ESRD) و 161 شخص من الأفراد الأصحاء استخدموا كمجموعة ضابطة. تم تحضير مصل الدم منهم لقياس مستويات تركيز البروتين كلوثو ، الكرياتينين ،حمض البول ،الكالسيوم و الفوسفات. كما تم جمع عينة البول العشوائية الموضعية وتحليلها من أجل الكرياتينين والألبومين الدقيق الذي تم منه حساب نسبة الألبومين إلى الكرياتينين (ACR). تم تحليل موسمات البلازما بواسطة محلل Mendray BS 200 الاتوماتيكى ، بينما تم تحليل موسمات البول باستخدام محلل كوباس الاتوماتيكى. النتائج: اظهرت الدراسة ان معدل إنتشار امراض الكلى المزمنة لدى الاقارب هو 19.3 % مقابل 6.8 % لدى المجموعة الضابطة عند مستوى معنوية 0.001. كما ان مقارنة المتوسطات اظهرت فروقات ذات دلالة معنوية في متوسطات مستوى البروتين كلوثو، البروتين الدقيق في البول، الكرياتنين في البول، نسبة الالبومين الى الكرياتينين(ACR) ومعدل الفلترة الكبيبية (GFR) بين الاقارب من الدرجة الأولى والمجموعة الضابطة حيث كانت مستويات ( المتوسط + الإنحراف المعياري) كالأتي: (856.2 ± 477.6)، (123.1 ± 68.2)، 115.3) ± 153.3)، (4.4 ± 10.0)، (25.6 ± 93.1) عند الاقارب. مقابل ( 590.7±1067.8 ) ، (2.05 ± 14.9)، 108.8) ± 190.3)، (00.1 ± 0.92)، 5).22 ± 99.4) لدى مجموعة التحكم على التوالى،وكانت مستويات القيم المعنوية كما يلي: 0.001 ، 0.001 ، 0.005 ، 0.024 و 0.027 بالتتابع. كما وجد ان مستوى البروتين كلوثو ينقص نقصاناً ذو دلالة معنوية عند الاقارب الذين اعمارهم اكثر من 40 سنه وايضا الذين لديهم معدل فلترة كبيبية (GFR) اقل من 60 وحدة. وايضاً وجد ان مستوى البروتين كلوثو يتناسب طردياً مع نسبة الالبومين الى الكرياتينين (ACR) ، معدل الفلترة الكبيبية (GFR)، الفوسفات، معدل تصفية الكريتنين ( creatinine clearance)، ويتناسب عكسياً مع العمر والكرياتينين ولكن ليس لديه ارتباط مع الكالسيوم ،حمض البول و BMI. الخلاصة: هذه الدراسة اظهرت نسبه عالية لانتشار امراض الكلى عند اقارب مرضى الفشل الكلوي، كما ان لديهم انخفاض معتبر في مستوى البروتين كلوثو بالدم كما ان لديهم زيادة معتبرة في نسبة الالبومين الي الكرياتنين (ACR) ونقصان معتبر في مستوى الفلترة الكبيبية(GFR) مما يجعلهم اكثر عرضة للإصابة بامراض الكلى المزمنة لذلك لابد من حملهم للكشف المبكر عنها. مستوى البروتين كلوثو ينقص عند الاقارب ذوي الاعمارالكبيرة و الذين لديهم انخفاض في معدل الفلترة الكبيبية.ايضا الكلوثو بروتين يتناسب طردياً مع GFR ، creatinine clearance وعكسياً مع العمر والكرياتينين،هذة النتائج تفيد بان الكلوثو بروتين لديه ارتباط بوظائف الكلى.Item Successful isolation, culturing, proliferation and transdifferentiation of stem cells obtained from Umbilical Cord blood and Wharton jelly(Al-Neelain University, 2011) Hiba BadrEldin Khalil Ahmed Khalilntroduction Mesenchymal stem cells (MSCs) and Haemopoietic stem cell (CD34) could be isolated from human umbilical cord blood. In addition to that MSCs like, could also be isolated from Wharton jelly which represent a rich source of primitive cells, with the same properties of cord blood and bone marrow MSCs. Mesenchymal stem cells and haemopoietic stem cells have the capacity of self-renewal, proliferation and in viva or ex vivo differentiation. This study was conducted to compare stem cells from umbilical cord blood and Wharton jelly, focusing on isolation techniques, identification and proliferation using various medium, (MesenCult and DMEM), and differentiation in vivo (albino rats) and ex viva (MethoCult medium), transdifferentiation into hepatocyte like cells and expression of CD34,CD45 and CD10. Materials and Methods Thirty female albino-rats age 5-6 week-old; weight 40-60 g, 20 were used for ‘human cells engraftment, whereas the remaining l0 served as negative controls. Twenty to fourty ml of 25 cord blood samples and length of 12 cm of 25 umbilical cords for Whaiton jelly samples were obtained from 25 newborns delivered after full tenn following ethical consent. The cord blood samples were grouped according to the time of collection after birth into three groups. Group one (G1) include samples processed after 5 - 7 hours, group (G2) after 3 - 9 hours and 9-13 hours for group three (G3), whereas Wharton jelly samples were grouped as G1 which include samples processed afier 56 - 93 hours, G2 afier 19 - 24 hours and 42 - 48 hours for G3 and time of trypsin digestion was 45 minutes for G1 and 30 minutes for G2 &G3.Ficoll Paque was used to obtain the mononuclear cells from cord blood samples while trypsin enzymatic treatment was used for Wharton jelly samples. Purification of CD34 was done using RosetteSep and EasyScp techniques. The expression and count of CD34, CD45 and CD10 was detected by desired monoclonal antibodies and analyzed using tlowcytometric. The ex viva proliferation of MSCs was performed in DMEM at day 7 for G2 and day 14 for G1, whereas for MesenCult media it was performed at day 14 for G3. The differentiation process was done by CFU-F fibroblast assay and hepatocyte growth factor protocol, and checked by monitored microscopic, immunocytochemistry and micro albumin assay. CD34 positive cells were cultured for 16 days in MethoCu]t media afier which viable cells count, colonies count assays, and calculation of fold expansion and plating efficiency were done. In vivo engrattment and cell proliferation was tested using CD34 positive cells in experimental irradiated albino rats (n=l0) and CD34 improved by human MSCs (n=l0) infused by intravenous and intraperitoneal modality. Statistical methods The data was analyzed using SPSS 13, p.value considered statistically significant below 0.05. Descriptive statistics (mean and standard deviation) obtained for numerical variables while frequency distribution and percent for categorical variables. Mean differences were tested by t-test or ANOVA. Results The results showed no significant differences in the count of mononuclear cells isolated from cord blood and Wharton jelly samples based on mother age, weeks of gestation, length of umbilical cord and time of processing. The results also showed that the MesenCult media gave the best MSCs viable cells count and fold expansion compared with DMEM. According to the incubation time, DMEM produced the best viable cells count and fold expansion in 7 days in contrast to the 14 days incubation. A statistical significant difference (p-value = 0.04) was observed when compared the MSCs viable cells count and fold expansion of cord blood group 1 and Wharton jelly group 2 in DMEM. The results also showed that the plating efficiency and colonies count of MSCs to form CFU-fibroblast from Wharton jelly samples was higher with no significant statistical difference (p-value % 0.2) than MSCs from cord blood samples. The activation of hepatocyte cell like obtained from the Wharton jelly samples was higher compared with MSCs obtained from umbilical cord blood. However, the difference turned to be statistically insignificant. Although CD10 was expressed by MSCs, we observed no significant difference between cord blood and Wharton jelly samples. Although EasySep technique gave the best purification count of CD34 and haemopoietic colonies count (CPU-E, BFU-E and CPU-GM) in ex vivo methoCult media, R0setteSep gave the best self renewal, proliferation into CD45 and engrafiment in albino rats. In addition the combination of CD34 and MSCs gave the best engraftment and the best site for administration was the intravenous one. Conclusions According to the results, Wharton jelly was the best source of MSCs when as compared to cord blood. Regarding CD10 expression, the cord blood was the best compared to Wharton jelly. The best media for stem cell research was the MesenCult obtained from Stem Cell Technologies Company. The best technique for CD34 isolation was the positive selection conceming EasySep technique, although the best in vivo engrafiment can be obtained by R0setteSep technique. MSCs look to have the same properties of bone marrow stroma, when it is combined with the haemopoietic stem cell (CD34) in case of in vivo engraftment.Item Intentions for Out Migration among Sudanese Graduated And Post-Graduated Medical Students(Neelain University, 2016) Tomador Mohamed Osman Said AhmedAbstract Introduction: Out-migration of health care providers affects the quality of the health care services provided in the source countries. The scale of Sudanese doctors out migration is growing particularly in last years. This study investigated the graduated and post-graduated medical students’ intentions to migration as Sudan will loosen the skilled and competent medical doctors who will work in the health system. Objectives: To explore the intentions of out-migration among Sudanese graduated and postgraduate medical students Methodology: This was a descriptive cross-sectional institutional based study design conducted to identify the intention among 398 Sudanese graduates and post graduates medical students. after define the sample frame the study population was divided in to 2 subgroups based on the educational level using stratified random sampling technique and the simple random sampling technique was used to select subjects from each stratum .The study was conducted in two setting: the Human resources Development Directorate [HRD], House officers office: and the Sudan Medical specialization Board [SMSB], registrar office,. Data collection tools were questionnaires, Data was analyzed by SPSS version 16. Results: The profile of intended medical students was females (72%), young age (50.9% were 20-29 yrs.), single (57.4%), and resident in Khartoum state (65.8%) and had only Sudanese nationality (94%). High intention among investigated students (93%) to migrate mainly after 1-2 years from now (40.1%). They attracted by markets in Arab countries (53.8%) mainly Kingdom of Saudi Arabia (KSA). Poor financial reward was the first pushing factor (81.1%). The main pulling factors were both higher salaries(78.8%) and the good professional development career in short time in the recipient countries (78.8%). The majority of students planned to return back (74.1%). Conclusion: High intentions for out migration among Sudanese graduates and post graduates medical students (93%) pushing by poor financial reward and pulling by both high salaries and developing themselves, which need urgent policies and plans to manage this phenomena and its effect on health system. Recommendations: develop and implement comprehensive retention strategies and policies to reduce health workers out migration implication on the health system like: improve the salary packages and the working environment in public health facilities, improving the incentives and revise contract, improve and expand the in-service and continuous professional development (CPD) activities and training Conflict of interest: no Conflict of interest Keyword: intention, international, migration, medical students, graduated, postgraduate الخلاصة : مقدمة: لهجرة الاطر الصحية أثر بالغ على جودة خدمات الرعاية الصحية المقدمة في دول المصدر. يعتبر حجم هجرة الأطباء السودانيين الي خارج البلاد في تزايد خاصة في الاعوام الماضية. هذه الدراسة تبحث في مقصد الطلاب الى الهجرة لان السودان سوف يفقد وجود الاطباء المهرة والمتخصصين في النظام الصحي الأهداف:استكشاف مقصد الهجرة لخارج البلاد بين خريجي طلاب الطب وطلاب الدراسات العليا في السودان المنهجية: أجريت دراسة مقطعية ذات تصميم كمي لتحديد المقصد بين خريجي كلية الطب و طلاب الدراسات العليا لعدد 398 مشارك واجريت الدراسة في الادارة العامة للموارد البشرية مكتب الامتياز حيث يأتي الطلاب الخريجين لاكمال إجراءات التدريب كاطباء امتياز والمجلس القومي للتخصصات الطبية حيث يقوم طلاب الدراسات العليا بإجراءات التسجيل والدفع لرسوم الامتحان ويقوم الناجحين بإستخراج شهاداتهم .تم جمع البيانات بالاستبيانات كما تم تحليلها بواسطة برنامج spss النسخة 16 النتائج: احتوت البيانات الشخصية للطلاب الذين تمت دراستهم بأن اغلبهم من الإناث(72٪(، صغار السن (50.9%)كانت اعمارهم (20-29 عاما ( عزاب 57.4)٪(، مقيمين في ولاية الخرطوم) ٪ (65.8من لديهم فقط الجنسية السودانية( 94 ٪.) . كان مقصد الهجرة عالي بين هؤلاء الطلاب(93٪) علي ان يهاجروا بعد 1-2 سنوات من الآن(40.1٪) تجذبهم الأسواق في البلدان العربية (53.8٪) بشكل عام المملكة العربية السعودية. كما ان ضعف العائد المالي أول عامل لدفعهم للهجرة 81.1٪) . اما العوامل التي تجذبهم بالدول الاخري هي: العائد المادي المجزي وكما يمكنهم تطوير أنفسهم مهنيا في وقت قصير( 78.8٪( .خطط اغلب الطلاب للعودة الي السودان (74.1%) الخلاصة: توجد مقاصد عالية للهجرة والعمل خارج البلاد بين خريجي طلاب الطب وطلبة الدراسات العليا و التي بدورها تحتاج إلى خطط عاجلة لإدارة هذه الظاهرة وتأثيرها على النظام الصحي. التوصيات: وضع وتطبيق سياسة وخطة لاستبقاء الاطر الصحية للحد من اثر ظاهرة الهجرة علي النظام الصحي وذلك عبر تحسين المرتبات وتحسين بيئة العمل والحوافز وكذلك تحسين والتوسع في مجال التدريب القصير العقبات: لاتوجد عقبات كلمات مفتاحية : مقصد ,الهجرة ,الطلاب الخريجين ,الطب,الدراسات العلياItem The Association and the Role of BCL11A Genetic Polymorphisms on the Severity of Sickle Cell Anaemia among Sudanese Patients(Neelain University, 2019) Shireen Zuhdi Nimer IbrahimResults This study showed that, the mean of Hb-F level was (11.3±7.5%). The mean age of patients was 7 years and a negative correlation was found between Hb-F level (decreased) and age (increased) )r = −0.312, P.value = 0.008). Hb-F level also has a significant association with the complications of SCA patients (P.value=0.000). A total of 7 genetic polymorphisms were detected in intron 2 on BCL11A gene distributed randomly among all 69 SCA patients (97.2 % showed positivity of the SNPs) and 2 patients did not showed (2.8%). A significant association was found between Hb-F level and these polymorphisms (rs11886868, rs766432, rs144866206, rs766431, rs7607173, rs6706648 and a novel mutation in position 60104 transversion of C to A was discovered also. Moreover, the most strong associations were found in rs11886868 (P.value=0.000), rs766432 (P.value=0.042), rs7607173 (P.value =0.01) and rs 6706648 (P.value= 0.001). On the other hand, the mutant homozygous genotypes (AA, GG, TT and CC) were showed significant decreased effect in Hb-F level and increased the severity of the complications. Conclusions The BCL11A gene mutant polymorphisms; rs11886868, rs766432, rs7606173 and rs6706648 had significant reduction effect on Hb F level (decreased) among patients with obviously resulting as complications. Patients who did not showed mutation were showed high Hb F level and less complications appearance. A novel mutation was found also and should be register. مستخلص الدراسه المقدمه فقر الدم المنجلي هو اضطراب وراثي شائع في الهيموجلوبين , وفي السودان هو اعتلال الهيموجلوبين الأكثر شيوعًا المرتبط بفقر الدم .يؤثر مستوى الهيموجلوبين الجنيني على شده فقر الدم المنجلي ، نظرًا لقدرته على تثبيط بلمرة هيموجلوبين اس . يعد مستوى الهيموجلوبين الجنيني هو المحسن الوراثي الرئيسي للخصائص الدمويه والسريريه لفقر الدم المنجلي . في الآونة الأخيرة ، اقترح الجين BCL11A كمنظم لمستوى الهيموجلوبين الجنيني . تهدف هذه الدراسه الى التحقق في تعدد الأشكال الجينيه في الجين BCL11A مع مستوى الهيموجلوبين الجنيني في المرضى السودانيين المصابين بفقر الدم المنجلي( اس /اس) ودور هذه الأشكال الجينيه في مضاعفات المرض . الطرق شملت هذه الدراسه 71 مريضا سودانيا يعانون من فقر الدم المنجلي) اس / اس ) تم استبعاد المرضى الذين يتناولون ال هيدروكسي يوريا والذين لديهم تاريخ نقل دم خلال ثلاثة أشهر على الأقل . تم اجراء تعداد الدم الكامل والهيموجلوبين الكهربائي بالانابيب الشعريه الأوتوماتيكه . تم تحديد التنميط الجيني لتعدد الأشكال الجينيه في انترون 2 على الجين BCL11A باستخدام تفاعل البوليمرايز المتسلسل ثم استخدام تقنيه تسلسل الحمض النووي . النتائج ظهرت هذه الدراسة أن متوسط مستوى الهيموجلوبين الجنيني كان ( 11.3 ± 7.5 (% . كان متوسط عمر المرضى 7 سنوات وتم العثور على علاقه سلبيه بين انخفاض مستوى الهيموجلوبين الجنيني وزياده العمر) r = −0.312) ( P.value = 0.008) . يوجد ايضا ارتباط بين مستوى الهيموجلوبين الجنيني و مضاعفات مرضى الانيميا المنجليه P.value =0.00) ) . تم الكشف عن 7 من الانماط الجينيه في انترون 2 على الجين BCL11A موزعة عشوائيا على جميع مرضى الانيميا المنجليه وظهرت على 69 (97.2%) من المرضى ولم يظهر في 2 من المرضى (2.8 ٪) .