Masters theses : Medical Laboratory Science
Permanent URI for this collectionhttps://repository.neelain.edu.sd/handle/123456789/495
Browse
15 results
Search Results
Item Assessment of serum Magnesium and Glucose Levels among Sudanese Polycystic Ovarian Syndrome Patients(Al-Neelain University, 2019-07) Sahar Altyeb KhalidAbstract Background: Polycystic ovarian syndrome (PCOS) is the most common endocrinopathy in the women of reproductive age with prevalence of approximately 7-10% worldwide.PCOS is characterized by increased ovarian and adrenal androgen secretion, hyper androgenic metabolic syndrome symptoms such as hirsuitism, acne, menstrual irregularity. Women with PCOS are known to be at increased risk for insulin resistance. There is more circulating glucose in the blood waiting to be absorbed into the cells resulting in glucose tolerance. Magnesium plays the role of a second messenger for insulin action. Low magnesium concentrations are associated with impaired glucose tolerance and increased risk for type II diabetes mellitus. Objective: The aim of this study was toassess of plasma levels of fasting blood glucose and Magnesium in Sudanese PCOS. Materials and Methods: This is a case control hospital based study conducted inAl-Kamellab, Khartoum state. Sixty subjects,thirty patients with PCOs as case and thirty healthy individuals as control group were included in this study and their age ranged between (21-36) years with mean age 26 years. Plasma level of FBS and Mg measured by colorimetric methods. Results:This studyshowed that the mean of FBG in cases (96.23±14.03) and in controls (82.10±2.37) with (p=0.000) mean of plasma Mg in cases (1.87±0.12) and in controls (2.23±0.19) with(p=0.000) mean of BMI in cases (33.54±3.52) and in controls (21.15±1.48). The result showed significant difference between cases and control in FBG and Mg. Conclusion: PCOs had higher blood of glucose level and low level of Magnesium and had increased risk to develop type2 diabetes multiuse المستخلص الخلفية: متلازمة المبيض المتعدد الكيسات (PCOS) هي اعتلال الغدد الصماء الأكثر شيوعا في النساء في سن الإنجاب مع انتشار ما يقرب من 7-10 ٪ في جميع أنحاء العالم. متلازمة تكيس المبايض تتميز بزيادة إفراز الأندروجين في المبيض والغدة الكظرية ، أعراض متلازمة التمثيل الغذائي المفرط الأندروجينية مثل الشعرانية ، حب الشباب ، عدم انتظام الدورة الشهرية. من المعروف أن النساء المصابات بمتلازمة تكيس المبايض معرضات لخطر متزايد لمقاومة الأنسولين. هناك المزيد من الجلوكوز المنتشر في الدم في انتظار امتصاصه في الخلايا مما يؤدي إلى تحمل الجلوكوز. المغنيسيوم يلعب دور رسول ثان لعمل الانسولين. وترتبط تركيزات المغنيسيوم المنخفضة مع ضعف تحمل الجلوكوز وزيادة خطر الإصابة بمرض السكري من النوع الثاني. الهدف: كان الهدف من هذه الدراسة هو تقييم مستويات مصل الدم (صيام نسبة الجلوكوز في الدم والماغنسيوم) في مرضى تكيس المبايض السودانيين. المواد والطرق: هذه دراسة تستند إلى مستشفى لمراقبة الحالات أجريت في مختبر الكامل بولاية الخرطوم. أدرجت هذه الدراسة ستين شخصا ، ثلاثين مريضا يعانون من متلازمة تكيس المبايض كحالة وثلاثين الأفراد الأصحاء كمجموعة ضابطة وتراوحت أعمارهم ( 21-36 ) مع متوسط العمر 26 سنة. مستوى مصل السكر صيام و الماغنسيوم يقاس بطريقة اللونية. النتائج: أظهرت هذه الدراسة أن متوسط السكر صيام في الحالات (96.23 ± 14.03) وفي الضوابط (82.10 ± 2.37) مع (p = 0.000) متوسط مصل المغنيسيوم في الحالات (1.87 ± 0.12) وفي الضوابط (2.23 ± 0.19) مع (p= 0.000) متوسط مؤشر كتلة الجسم في الحالات (33.54 ± 3.52) وفي عناصر التحكم (21.15 ± 1.48). تظهر النتيجة اختلافًا كبيرًا بين الحالات والتحكم في السكر صيام و الماغنسيوم. الخلاصة:مرضى تكيس المبايض لديها مستوى أعلى من الجلوكوز ومستوى منخفض من المغنيسيوم وزيادة خطر لتطوير مرض السكري من النوع 2.Item Assessment of Inflammatory Biomarkers (C- Reactive Protein- Tumor Necrosis Factor Alpha, Interleukin 6 and Cystatin-C) among Type 2 DM Patients-Khartoum(Al-Neelain University, 2019-08) Maha Ali Omer MussmarAbstract Background: Type 2 diabetes mellitus is worldwide and in increasing rate to affect more population, due lifestyle, obesity, presence of mutation and other causes, it characterized mainly by it is insulin-independent. It has been bound to other disorders as complications of having increased level of glucose. Controlling DM through diet, medication and personal hygiene. Monitoring levels of fasting blood glucose beside glycated hemoglobin give indicators of monitoring program. Also evaluation other functions in order to predict complications and deal with them. So this study aimed to evaluate biomarkers related to inflammation among T2DM in order of assessment of health status of patients beside renal function tests, to see if elevated inflammatory biomarkers can be bind to deviation of urea and creatinine levels from normality. Type 2 diabetes mellitus (T2D) is associated with higher increase in inflammatory parameters. The aim of this study was to determine the association of inflammatory biomarkers with Type 2 diabetes mellitus. Aim:- This study aimed to assess inflammatory biomarkers and renal function test among type 2 diabetes mellitus and compare with healthy individuals. Materials and Methods: Two hundred (200) subjects were enrolled in this study, 100 of them were patients with T2DM set as case group and 100 were healthy individuals were set as control group. Blood samples were collected from both groups in order to assess renal function tests urea, creatinine and fasting blood glucose by spectrophotometer based method, while Sodium and Potassium by easylyte device and reagent and inflammatory biomarkers CRP, IL6, cystatin C and TNF-alpha by ELISA technique while HbA1c assessed by ichroma device. Result: A cross-sectional study of case group was increase parameters when compared with control performed except Sodium which was decreased All parameters when correlated with HbA1c reported positive correlation except the Sodium .Inflammatory biomarkers ( IL-6 , CRP , Cystatin C and TNF-alpha) levels in diabetic subjects were significantly higher than control group. Serum creatinine and urea were higher in type 2 diabetes patients than normal subjects (p=0.001). Pearson’s correlation of serum creatinine and urea with inflammatory biomarkers brought different positive correlation with all parameters.HbA1c has positive correlation with inflammatory biomarkers TNF-α. (R= 0.812** P=0.00), CRP(R= 0.527** P=0.00), IL6, (R= 0.778** P=0.00) and Cystatin C (R= 0.884** P=0.00) respectively. Conclusion: There is increasing evidence that signs of inflammation (IL-6, CRP, Cystatin C and TNF-alpha) were played a significant role in the development of type 2 diabetes. This study aims to assess the high levels of inflammatory biomarkers (interleukin-6 (IL-6) and reactive protein C (CRP)) with an increased risk of developing type 2 diabetes, so it is necessary to improve blood sugar control to reduce Risk of complications of diabetes. الملخص الخلفية: النوع الثاني من داء السكري منتشر في جميع أنحاء العالم بصورة متزايدة ومؤثر على عدد كبير من السكان، وذلك للتغيير الذي حدث في نمط الحياة مما أدى الى ارتفاع معدلات السمنة بين السكان، بالإضافة إلى الطفرات الوراثية، ويُدعى سابقًا بداء السكري غير المعتمد على الأنسولين أو سكري البالغين. كما يؤدي الي مضاعفات اخري تنتج من خلل في النظام الغذائي وتناول الأدوية وعدم النظافة الشخصية. ويمكن السيطرة عليه بواسطة مراقبة سكر دم الصائم بجانب الهيموغلوبين المحتوي على الجلكوز كمؤشرات لبرامج العلاج، وكذلك تقييم الوظائف الأخرى من أجل التنبؤ بالمضاعفات والتعامل معها. ولهذا السبب تهدف الدراسة إلى تقييم المؤشرات الحيوية المتعلقة بالالتهاب ومرضى السكري من النوع الثاني من أجل تقييم الحالة الصحية للمرضى إلى جانب اختبارات وظائف الكلى، لمعرفة ما إذا كانت المؤشرات الحيوية الالتهابية المرتفعة يمكن ربطها بانحراف مستويات اليوريا والكرياتينين عن الحالة الطبيعية. حيث لوحظ خلال هذه الدراسة التي اجريت ان داء السكري من النوع الثاني يرتبط بزيادة أكبر في العوامل الالتهابية. لذلك كان الهدف من هذه الدراسة هو تحديد ارتباط المؤشرات الحيوية الالتهابية مع داء السكري من النوع الثاني. الهدف : تهدف هذه الدراسة إلى تقييم المؤشرات الحيوية الالتهابية واختبار وظائف الكلى بين داء السكري من النوع 2 ومقارنتها مع الأشخاص الأصحاء. المواد والاساليب: تم إجراء دراسة مستعرضة لـ 100 شخص شاركوا في هذه الدراسة وهم من مرضي سكري النوع الثاني و 100 شخص أصحاء كمجموعة مراقبة، تم تحليل عامل نخر الورم البروتيني التفاعلي ألفا - إنترلوكين 6 وسيستاتين سي) ، ووظائف الكلي وشوارد الدم (الصوديوم والبوتاسيوم) وايضاً تم قياسهم في المجموعتين. كل ما قيس وجد بمعدلات مرتفعة لدي مرضي السكري من النوع الثاني اكثر من مجموعة المراقبة عدا الصوديوم. النتيجة: هناك أدلة متزايدة على أن علامات الالتهابات (IL-6 ، CRP ، Cystatin C و TNF-alpha) قامت بدور كبير في تطور مرض السكري من النوع الثاني. حيث تهدف هذه الدراسة إلى تقييم المستويات المرتفعة من المؤشرات الحيوية الالتهابية (انترلوكين -6 (IL-6) وبروتين سي التفاعلي (CRP)) مع زيادة خطر الإصابة بمرض السكري من النوع الثاني ، لذلك لابد من تحسين السيطرة على نسبة السكر في الدم للتقليل من خطر الاصابة بمضاعفات مرض السكري .Item Molecular Detection of Selected Virulent Genes of Klebsiella pneumoniae Clinical Isolates from Khartoum state hospitals(جامعة النيلين, 2019-11) Altahra Abdelwahab Ahmed HassanABSTRAC: Background:Klebsiella pneumoniae is one of the organisms that cause pneumonia, urinary tract infections, wound infections and bacteremia. The definition of hypervirulent Klebsiella pneumoniae (hvKp) regarded to produce virulence factors . So this study aimed to detect selected virulence genes (iroBCD, iucABCD, rmpA2) of K. pneumoniae isolated from different specimens from patients in Khartoum state using Multiplex PCR . Mothods: Clinical samples were collected, which yielded K. pneumoniae isolates from different hospitals, re-identified as K. pneumonia was done by using phenotyping methods include Grams stain and selected biochemical tests. DNA was extracted by boiling method and PCR was done using specific primers to detect the virulence genes and visualized by gel documentation . Results :In the present study out of 100 samples include 58% (58/100) were from females and 42% (42/100) from males. PCR Results showed RmpA2 (20/100) 20%, iroBCD (8/100) 8%,RmpA2 and iroBCD (5/100) 5% , RmpA2 and iucABCD (3/100) 3%,IroBCD and iucABCD(2/100) 2%,RmpA2 and iroBCD and iucABCD (1/100)1%. There was significant association between genes and type of samples (P Value 0.002). Conclusions: Our present study concluded that the RmpA2 had the highest frequency 30% (30/100). المستخلص: الكليبسيلا الرئوية هي احدى الكائنات المسببة للإلتهاب الرئوي , إلتهاب المسالك البولية, إلتهابات الجروح و إلتهاب الدم البكتيري.يتم التعرف على الكلبيسيلا الرئوية الاكثر ضراوة بانها تنتج عوامل تزيد من ضراوتها كان الهدف من الدراسة هو الكشف الجزيئي وتوصيف جينات الضراوة المختارة(rmpA, IroBCD ,iucABCD) للكليبسيلا الرئوية المعزولة من عينات سريرية مختلفه من مرضى في ولاية الخرطوم . الطرق:في الفترة من يناير الى ابريل 2019. تم جمع عدد 100عينة بكتيريا معزولة تم التعرف عليها مسبقا انها كليبسيلا رئوية من مستشفيات مختلفة, تم اعادة التعرف عليها أنها كليبسيلا رئويه.بصبغة غرام وبعض التفاعلات البيوكيميائيه المختارة تم إستخلاص الحمض النووي الرايبوزي منقوص الأوكسجين عن طريق الغليان و تم إجراء تفاعل البلمرة المتسلسل المتعدد باستخدام بادئات متخصصة لبعض جينات الضراوةrmpa2 iucABCD iro BCD) (.تم تاكيدها وتوثيقها بمادة الجل النتيجة: تم عزل58%(58/100) من اناث و 42%(42/100) من ذكور. واظهر تفاعل البلمرة المتسلسل المتعدد ان RmpA2 20%(20/100)و iroBCD بنسبه 8% (8/100) وRmpA2 and iroBCD بنسبة 5 %(5/100) و RmpA2 and iucABCD بنسبة 3%(3/100) و 2%(2/100)IroBCD and iucABCD و RmpA and iroBCD and iucABCD بنسبه 1%(1/100). ووجد ايضا ان هناك ارتباط ذو اهميه بين انواع وجينات الضراوة .تم استنتاج ان الجين RmpA2 هو الاكثر انتشارا بنسبه 30%(30/100).Item Molecular Detection of bla OXA-48 Gene Encoding Carbapenem Resistance Pseudomonas aeruginosa Clinical Isolates from Khartoum State hospitals(Al-Neelain University, 2019-11) Doha Omer Ali MohammedABSTRACT Background: Carbapenem resistance in P.aeruginosa is particularly worrisome because this class of β-lactam represents the last therapeutic resource for control of bacterial infection. Aim: This study aimed to detect the frequency of bla OXA-48 resistance gene among Pseudomonas aeruginosa clinical isolates during the period from November 2018 to November 2019. Methods: Hundred Pseudomonas aeruginosa clinical isolates represented 81 carbapenems ( imipenem and meropenem) resistant and 19 carbapenems sensitive isolates were collected from different specimens from Omdurman Teaching Hospital, Fedail Hospital and Soba Teaching Hospital for this study in Khartoum State-Sudan. All isolates were re-identified using conventional bacteriological techniques and their susceptibility to carbapenems were tested using Kirby-Bauer method for confirmation. All isolates were investigated for the presence of the bla OXA-48 gene using conventional PCR technique. Results: Based on PCR assays, 60 (60.0%) out of 100 Pseudomonas aeruginosa clinical isolates were positive for blaOXA-48 gene .Out of 81 carbapenem resistant isolates 54 (66.7%) were positive for bla OXA-48 gene, while among the (19) carbapenem sensitive isolates 6 (31.6%) were positive for blaOXA-48 gene. There was statistically significant association between carbapenem resistant isolates and the presence of blaOXA-48 gene (P-value = 0.006). Wound swabs were the predominant clinical samples detected harboring bla OXA-48 gene both among the sensitive 5 (83.3%) and carbapenem resistant isolates 29 (53.7)(P.value> 0.05). Conclusion: Our findings revealed high frequency ofbla OXA-48 among carbapenem resistant isolates whereas it was detected in low percentage among the sensitive isolates, so identification of bla OXA-48 producing strains and taking efforts to reduce the rate of transferring these gene between the different strains is essential for optimization of therapy and improves of patients outcomes. ملخص الدراسة خلفية الدراسة: تعد مقاومـــة الكاربابينيم في االزائفه الزنجاريه مثيرة للقلق بشكــل خاص لأن هذه الفئة من بيتا لاكتام تمثل آخر مورد علاجي للسيطرة على العدوى البكتيرية. الهدف: هدفت هذه الدراسة إلى الكشف عن مدى شيوع جين المقاومة-48 bla OXA بينالعــــــزلات السريريه للزائفة الزنجاريه خلال الفتره من نوفمبر 2018 إلي نوفمبر 2019 الطرق: تضمنت هذه الدراسه عدد 100 عزله سريريه للزائفه الزنجاريه وهى عباره عن 81 عزله مقاومه للكاربابينيمات (ميروبينيم وايميبينيم) وعدد 19عزله حساسه لهذه الكـــاربابينيمات, لقد تم جمعها من عينات مختلفه من مستشفى ام درمان التعليـمي , مستشفى فضيل و مستشفي سوبا التعليمي لغرض هذه الدراسة . لقد تم إعاده التعرف لجميع العزلات بإستخدام التقنيــات البكترولوجيه التقليديه, وتم إختبار قابليتها للتعرض للكاربابينيمات بإستخدام طريقه كيربي باور للتأكد. تم فحص جميع العزلات لوجود جين 48-blaOXAبإستخدام تقنية تفاعل البلمـــرة المتسلسل التقليديه . النتائج : استنادا إلى اختبارات نتائج تفاعلات البلمرة كانت 60 (60%)من اصل 100 عزله سريريه للزائفه الزنجاريه ايجابيه بالنسبه لجينblaOXA-48وقد اظهر عدد54 (66.7%) من ضمن 81 من العزلات المقاومه للكاربابينمات نتيجه ايجابيه لجين 48- blaOXA ، بينما من ضمن 19 عزله حساسه للكاربابينمات كانت فقط 6 (31.6%) ايجابيه لهذا الجين. لقد وجد ان هنالك ارتباط ذو دلالة إحصائية بين العزلات المقاومة للكاربابيننيم ووجود جين 48-blaOXA (القيمة ب 0.006). لقد وجد ان مسحات الجرح هي العيناتالسريرية السائدة التي تحتوي علي جين blaOXA-48 بين كل من العزلات الحساسه 48(83.3%) والعزلات المقاومـــــه للكاربابيننيم 29(53.7%) (القيمة ب > 0.05). الخاتمه : لذلك فإن التعرف على سلالات blaOXA-48 المنتجة وبذل الجهود لتقليل معدل نقل هذه الجينات بين السلالات المختلفة أمر ضروري لتحسين العلاج وتحسين نتائج المرضى .Item Assessment of Serum Zinc Levels among Sudanese PsoriaticPatients(Neelain University, 2019-09) Yasmin AbdAlrahman Awadallah TajerAbstract Background:Psoriasis is a chronic inflammatory skin disease characterized by a marked increase in keratinocyte proliferation and abnormal differentiation, prominent alterations in dermal capillary vasculature and the presence of dermal and epidermal mononuclear leukocytes and neutrophils.Zinc and copper are essential metals for biochemical processes in the body. Many researchers have main interest in these two metals because it was established that they are involved in immunological and inflammatory reactions. Objective:the aim of this study was to assessserumzinc levels in psoriatic patients. Material and Methods: The was case control hospital based study conducted in dermatological hospital, Khartoum state. Hundred subjects were involved. Fifty psoriatic patients (33 males &17 females) the age ranged between (12 and 60 years)with their mean 31.5 years and control group was comprised of 50healthy individual (31 males & 19 females) the age ranged between(16 and 60 years)with their mean 32.0 years. .Serum level of zinc measured by colorimetric method. Results:The serum zinc in psoriatic patients and control group respectively were (85.66±16.46μg/dl,91.86±13.19μg/d). There significantly (p value <0.04) decreased of serum zinc in case compared with the control group .There was significant correlation study parameters (serum zinc) and variables (severity of disease p value = 0.012, duration of disease p value = 0.006) among psoriatic patientsbutinsignificant correlation study parameters (serum zinc) and variables (Gender p value=0.55, age p value= 0.25) Conclusion: Psoriatic patients had alow significantly decrease of serum zinc. The study observed that the severity of disease associated mild and moderate. المستخلص تقييم نسبة الزنك فى الدم فى مرض الصدفية خلفية : تعتمد سلامة الجلد الطبيعى إلى حد كبير على نوعية وكمية الغذاء الكافى والمتوازن وإذا حدث نقص سواء أكان نقصا عاما أو زيادة أحد العناصر على بعضھا فإن ذلك يؤدى إلى ا ضطراب التوازن ومن بين ھذه العناصر الغذائية الھامة لبناء الجسم الزنك والنحاس حيث تمثل ھذه العناصر أھمية كبيرة وجزءا وظيفيا فى بناء مجموعات متعددة من الإنزيمات ويشترك كلا من الزنك والنحاس فى عدد من الأنشطة الايضية للخلية وقد ثبت علميا وتجريبيا إن كلا من الزن ك والنحاس يلعبان دورا مھما فى عملية تقرن الجلد فى الحيوانات وإذا علمنا إن الصدفية مرض جلدي يتصف ببقع حمراء على الجلد مغطاة بقشور بيضاء فضية .ويحدث غالبا فى منطقة المرفقين والركبتين وفرو ألراس والصرة وأسفل البطن ھذا وتعتبر الصدفية من الإمراض المزمنة والتي تصيب ما يقرب من % 4 من الناس وقد لوحظ انخفاض نسبه الزنك فى مرضى الصدفية عن غيرھم ممن لا يعانون من ھذا المرض مما أدى إلى وجود علاقة بين حده ھذا المرض ونسبة ھذا العنصربالدم . الهدف : ھذه الدراسة لتقييم مستوى الزنك فى مرضى الصدفية المواد والطريقة : تم اختيارمائة عينة منهم خمسين مريضا يعانون من الصدفية فى عيادات الإمراض الجلدية بمستشفى الجلديه بالخرطوم (33 ذكر و17 أنثي تتراوح أعمارهم بين 12 الي 60 سنة )مقارنة بحمسين آخرين أصحاء(31 ذكر و19 أنثي تتراوح أعمارهم بين 16 الي 60 سنة). هذا وتمت قياس نسبة الزنك لكل الحالات بواسطة جهاز الكلوروميتر. وتم عمل فحص طبي عام وفحص جلدي يشمل تقييم وتوزيع المرض فى الجسم وحساب مؤشر مدى حده الصدفية بالجسم،وقياس نسبة الزنك فى المرضى والأصحاء وحساب النسبة بينھما. النتائج: اظھرت النتائج نقص مستوى الزنك فى الدم لمرضى الصدفية مقارنة بالأصحاء كما اظھرت وجود علاقة بين مستوى الزنك و بين شدة المرض وكما أظهرت عدم وجود علاقة بي مستوي الزنك والعمر والجنس. الخلاصة: تبين من الدراسة إنخفاض نسبة الزنك في مرضى الصدفية ووجود علاقة بين نسبة الزنك ودرجة الإمراضية .Item Comparison of Plasmodium Falciparum Densities using Assumed WHO Reference Value and Actual White blood cells Count in Gadarif state(Al-Neelain University, 2018-03) Yousif Mohamed Yousif SalihAbstract Estimating malaria parasite density (number of parasites per μl of blood) is necessary for disease management, clinical trials and drug efficacy studies. This is a descriptive cross sectional study to assess the agreement between the parasite density values obtained with the assumed value of 8,000 cells/μl, of white blood cells (WBCs) count which was set by WHO, and the actual (WBCs) count in P.falciparum patients in Gadarif state. Moreover, the most suitable assumed values of WBCs for that population was estimated. The effect of age, gander, fever, severity of malaria and other diseases on the white blood cells was analyzed. This study included 243 patients with uncomplicated P.falciparum malaria of both sex in the age group (1-71) years, they were interviewed according to a specially designed questionnaire form and venous blood samples were collected from each after verbal consent. Blood samples were collected in K 3 EDTA container, automated hematology analyzer (Mindray BC- 3000Plus) was used for WBCs count, and ideal thick blood film was prepared for estimating parasite densities after staining by using Giemsa stain. Parasite densities (parasite/μl of whole blood) was calculated using assumed value of 8,000 cells/μl, of (WBCs) count and the actual (WBCs) count of patients. Result were analyzed using computerize statistical package for social science (SPSS, version16). It was found that WBC counts were not significantly different between patients of different gender and body temperature (P.value >0.05), whereas they were significantly different between age groups of patients and other diseases groups (P.value =0.0001). The median parasite densities calculated with the actual WBC counts (7,825/μl) and the assumed WBC count of 8,000/μl (11,520/μl) were significantly different as (P.value <0.001) a result using of assumed WBC count of 8000 cells/μl to estimate parasite densities of P. falciparum malaria in Gadarif state lead to an overestimation. More realistic assumed WBC count for P.falciparum density was then estimated to be 5,500/μl for best estimated parasite densities. This study provides more realistic assumed WBC counts for estimating parasite densities in P.falciparum patients from other areas of Gadarif state.اItem PCR Detection of Plasmodium Falciparum in Human Urine and Blood Samples(Al-Neelain University, 2017) Abdel Rahim Musa OmerAbstract Background: Current detection or screening for malaria infection necessitates drawing blood by finger prick or vein puncture, which poses risks and limitations for repeated measurement. Therefore this study aimed to present PCR detection of plasmodium Falciparum in human urine and blood and illustrates this potential application in genotyping malaria infection. Material and Methods: Urine and blood “ vein puncture sample “ were obtained from “20” thick film positive and “5”negative individuals immediately after examination of thick blood film “finger blood “ with positive malaria seen – each spogles .Plasmodium Falciparum DNA was extracted from blood and urine in separate groups. Results: Malaria infections exhibited primarily low-grade parasite densities, with a geometric mean of asexual parasites/μl. Regularly matching polymorphic MSP2 genotypes were found between the corresponding urine, and peripheral blood amplicons of each individual, with different inter-individual polymorphic genotypes. Amplicon yields were significantly dependent on DNA extraction method, parasite density and primer set (p < 0.001). A Qiagen kit extraction had more than 2× higher amplicon yield than the guanidine chloride method, for both urine Amplicon yields were 1.6 fold higher from urine. For each unit increase in log parasite density, the probability of amplicon enhanced 1.8 fold. Highest amplicon yields were obtained from the primer set with the shortest PCR product. الخـلاصـة الخلفية: الكشف الحالي أو الكشف عن عدوى الملاريا يستلزم رسم الدم عن طريق وخز الأصبع أو ثقب الوريد، مما يشكل مخاطر وحد للقياس المتكرر. ولذلك هدفت هذه الدراسة إلى تقديم كشف PCR من بلاسموديوم فالسيباروم في البول والدم البشري ويوضح هذا التطبيق المحتمل في عدوى ملاريا التنميط الجيني. المواد والطرق: تم الحصول على البول والدم من "عينة ثقب الوريد" من "20" فيلم سميك إيجابي و "5" أفراد السلبي مباشرة بعد فحص فيلم الدم السميك "دم الاصبع" مع وجود الملاريا - لكل سبوجلز (spogles). الحمض النووي لبلاسموديوم فالسيباروم المستخرجة من الدم والبول في مجموعات منفصلة. النتائج: أظهرت حالات العدوى بالملاريا في المقام الأول كثافة في طفيليات منخفضة المستوى، مع متوسط هندسي للطفيليات الجنسية / ميكرولتر. وجدت بانتظام مطابقة للوراثية متعددة الأشكال MSP2 بين البول، وأمبليكونس (amplicon) الدم المحيطي لكل فرد، مع مختلف الأنواع الوراثية متعددة الأشكال الفردية. وكان ناتج أمبليكون amplicon تعتمد بشكل كبير على طريقة استخراج الحمض النووي، وكثافة الطفيليات والمجموعة الأولية (ع <0.001). وكان استخراج كيتاغين أكثر من 2 × أعلى أمبليكون ناتج من طريقة كلوريد غوانيدين، لكلا البول. وكان ناتج أمبليكون amplicon 1.6 أضعاف من البول. لكل وحدة زيادة في كثافة الطفيليات، واحتمال تعزيز amplicon الى 1.8 أضعاف. تم الحصول على أعلى ناتج أمبليكون من مجموعة الأولية مع قصور في منتج PCR.Item Expression of survivin In B cell non Hodgkin Lymphoma(Al-Neelain University, 2019) Sharifa Zeiada FageirAbstract Background: lymphoma is a common cancer in sudan , it is classified into two types , Hodgkin lymphoma and non Hodgkin lymphoma . Worldwide non Hodgkin lymphoma Comprise 85% of all cancer of lymphomas. Aim: To investigate the expression of survivin marker in B cell non Hodgkin lymphoma using immunohistochemistry technique. Material and Method: this is hospital based analytical retrospective case control study was conducted at Omdurman hospital and AlNeelain University college of medical laboratory science, during the period from May2018 to October 2018. Fourty (40) paraffin blocks was collected from patients previously diagnosed with B cell non Hodgkin lymphoma and twenty (20) samples with reactive hyperplasia as benign samples. The paraffin blocks were cut by rotary microtome, 3micrometer thickness , and then stained by immunohistochemistry technique(indirect streptoavidin- biotin immune peroxidase technique ). The data obtained were analyzed using SPSS program version 21(Frequencies, mean and Chi –square test values) were calculated. Results: The age of patients ranged between (4 – 72) years with mean age of 46.5 years. The study revealed that most patients were more than 40 years representing 29 (72.5%) and the remaining 11(27.5%) were less than 40 years. Most patients were males 27(67.5%) and remaining females found in 13(32.5%) . Histological grade of tumor samples include low grade in 23(57.5%) samples intermediate grade in 14(35.00%) samples and high grade in 3(7.5%) samples. Positive Expression of survivin was found in 26/40(65%) samples, while negative expression showed in 14/40(35%) in B cell non Hodgkin.while the expression of survivin found positive in 5/20(25%) in reactive hyperplasia and negative in 15/20(75%) (p.value 0.003) . The expression of survivin show positive in 18(69.2%) males and negative in 9(34.3%). While it found positive in 8(30.8%) females and negative in 5(35.7%) females. P. value (0.003) The grade of B cell NHL include low grade it show positive survivin expression in 19(73.1%) samples and negative in 4(28.6%) samples and intermediate grade it found positive in 5(19.2%) samples and negative in 9(64.3%) samples , while high grade showed positive in 2(7.7%) samples and negative in 1(7.1%) samples. Conclusion: This result show significant association between expression of survivin and B cell non Hodgkin lymphoma . المستخلص المقدمة: سرطان الغدد الليمفاوية من اكثر الامراض شيوعا في السودان وتنقسم الي نوعين : سرطان الغدد الليمفاوية الهودجكينيه و اللاهودجكينيه والتي تمثل 85% من سرطان الغدد الليمفاوية . الطرق والوسائل: اجريت هذه الدراسة الحالة والحالة الضابطة في مستشفى امدرمان التعليمي وجامعة النيلين-كلية علوم المختبرات الطبية قسم الانسجة المريضة والخلايا في الفترة من مايو2018 الى اكتوبر 2018 . الدراسه تهدف الي التحقيق عن وجود علاقه بين السيرفيفين و سرطان الغدد الليمفاويه اللاهودجكينيه باستخدام كيمياء الأنسجة المناعية . تم جمع اربعون قالب شمعي من عينات مرضي مشخصين مسبقا علي انهم مصابين بسرطان الغدد الليمفاويه اللاهودجكينيه و20 عينه لأورام حميدة تضمنت فرط النسيج التفاعلي . قطعت المقاطع بسمك 3 مايكروميتر من كل قالب شمعي باستخدام المشراح الدوار وصبغت بواسطة كيمياء الانسجه المناعية واستخدم برنامج الحزم الاحصائية للعلوم الاجتماعية النسخه 21 لتحليل البيانات . النتائج: ترواحت اعمار المرضي بين 4الي 72 سنه مع متوسط العمر 46.5سنه وكشفت الدراسه ان معظم المرضي كانوا فوق40عاما يمثلون 29(72.5%)والباقي 11(27.5%)اقل من 40 عاما . واظهرت درجة الاوارم (الخلايا الغدية )النوع الاولI (المنخفضه)في 23عينه (%57.50)’النوع الثاني II(المتوسطه) في 14 عينه(%35.00)’والنوع الثالث III|(العاليه) في 3عينه (%7.50). اغلب المرضى كانوا من الرجال ومثلوا 27(67.50%) والبقية من النساء بنسبة 13(32.50%) . اظهرت الدراسه ان افراز السيرفيفين كان موجب الظهور في 40/26 عينة من العينات الخبيثة و 20/5 من العينات الحميدة وكان سالب الظهور في 40/14 من العينات الخبيثة و 20/15 . درجه الاورام الغديه تضمنت الدرجه المنخفضه وكان السيرفيفين موجب الظهور في 19(73.1%) منها وسالب الظهور في 4(28.6%) منها . في الدرجه المتوسطه كان السيرفيفين موجب الظهور في5(19.2%) منها وسالب الظهور في 9(64.3%) . واما الدرجه العاليه وكان السيرفيفين موجب الظهور في 2(7.7%) وسالب الظهور في 1(7.1%) منها . اظهرت الدراسه انه توجد علاقه ذات دلاله احصائيه بين السرفيفين وسرطان الغدد الليمفاويه اللاهودجكينيه .Item The Prevalence of Toxoplasmosis among pregnant Women in Alazazi area, Gezera State(Al-Neelain University, 2019-03) Zain Elabdein Abdallah Zain Elabdein AbdelrahimAbstract This cross sectional study was conducted in Alazazi area in Gezera state on 100 individuals to determine the prevalence rate of Toxoplasma gondii infection among pregnant women by using latex agglutination test. The study was carried out during the period between October 2018 and February 2019. Blood samples were taken from the subjects. The study showed that the overall prevalence rate of infection was 16% all positive cases (16) out of 100 were detected by using latex agglutination test. The highest prevalence rate (23.1%) was reported among the 26-35 years age group, while the lowest prevalence rate (10%) was reported among the 15-25 years age groups. The study showed that among 16 positive cases, 16 (18.2%) of the positive cases had direct contact with animals, while there was no reported positive case among pregnant women who had no contact with animals. Also the study showed that among 16 positive cases, 10 (43.5%) of the positive cases had previous history of abortion and 6 (7.8%) had no previous history of abortion. The study showed that among 16 positive cases, 9 (25%) of the positive cases had consumed undercooked meat and 7 (10.9%) did not consume undercooked meat. The results showed no association between Toxoplasma gondii infectivity and drinking unpasteurized milk. الخلاصة اجريت دراسة عرضية المقطع في منطقة العزازي- ولاية الجزيرة على 100 امراة حامل لتحديد معدل انتشار داء القطط عن طريق اختبار تراص اللاتكس. الدراسة اجريت في الفترة ما بين اكتوبر 2018 و فبراير 2019. عينات الدم اخذت من الاشخاص موضوع الدراسة. اظهرت الدراسة ان معدل الانتشار الكلي لداء القطط هو 16%. كل الحالات الموجبة 16 من اصل 100 تم تشخيصها عن طريق اختبار تراص اللاتكس. اعلى معدل انتشار (23.1%) سجل في الفئة العمرية 26-35 سنة بينما اقل معدل انتشار (10%) سجل في الفئة 15-25 سنة. وكذلك اظهرت الدراسة ان خلال 16 حالة موجبة كان معدل الانتشار 16 (18.2%) بالنساء الحوامل اللائي لهن اتصال بالحيوانات بينما لم تسجل اصابة في النساء اللائي ليس لهن اتصال بالحيوانات. اظهرت الدراسة ان خلال 16 حالة موجبة كان معدل الانتشار 10 (43.5%) في النساء الحوامل اللائي لهن حالات اجهاض سابقة بينما كان معدل 6 (7.8%) للنساء الحوامل اللائي ليس لهن حالة اجهاض سابقة. ايضا اظهرت الدراسة ان خلال 16 حالة موجبة كان معدل الانتشار 9 (25%) في النساء الحوامل اللائي تناولن لحوم نية بينما كان معدل 7 (10.9%) في النساء الحوامل اللائي لم يتناولن لحوم نية. اوضحت النتائج عدم وجود علاقة بين الاصابة بداء القطط وشرب اللبن غير المبستر(p =0.778)Item Assessment of Serum levels of Calcium, Phosphorous and Zinc Levels Amange Sudanese Cigarette Smokers in Gazira State(Al-Neelain University, 2019-06) Alawad Alwasila Ahmad AliAbstract Background: Across sectional study conducted in Khartoum state from October 2018 to May 2019. Aim to evaluate the effect of cigarette smoking on calcium, phosphorous and zinc level in Sudanese smokers. Materials and Methods: This study 100 subject were chosen for determination of plasma calcium, phosphorous and zinc level,50 were smokers and 50 apparently healthy non smoker servers as control group for compression. The plasma calcium and phosphorous were estimated by spectrophotometer while zinc was estimated by atomic absorption. Results: Analysis showed that three is significantly decrease in mean value of serum calcium in smokers when compared with control group with p value 0.000. There was significantly negative correlation between calcium level and smoking duration with ( P value 0.028 R value -0.310). Also the study showed phosphorous result was normal in smoker when compared with non smokers group with (p value0.992). Also the study showed significantly decrease on serum zinc level in smoker when compared to nonsmoker group with (p value 0.000) there was significantly negative correlation between zinc level on smokers and duration with (p value 0.000, R value -0.322) Conclusion: According to the result of this study the serum calcium and zinc were significantly decrease on cigarette smoker when compared to nonsmoker while serum phosphorous was insignificantly change on cigarette smoker when compared to nonsmokers. viالسودانيين. المدخنين مثل في والزنك والفسفور الكالسيوم مستوى عمى التدخين لمتحكم. قياسية كمجموعة اصحاء 00 و المدخنين من 00 عشوائيا فرد 200 اختيار تم الدراسة ىذه في قياسو تم الزنك عنصر واما وئي الض جيازالمطياف بواسطة قياسو تم الفسفور و الكالسيوم عنصر قياس تم المضغوط المجتمعي االحصائي العممي التحميل برنامج بواسطة النتائج تحميل وتم االمتصاصي. الذري المطياف بواسطة SPSS كانت و القياسية المجموعة مع قورنوا عندما ) المدخنين عند الكالسيوم مستوى في ىام نقصان التحاليل اظيرت النتائج المعنوية القيمة p.value0.000 القيم كانت و التدخين وفترة الكالسيوم مستوى بين ىام سمبي ارتباط ىناك ان الدراسة اظيرت pvalueالمعنوية )0.028 )(rvalue0.310 نوية المع القيمة كانت و القياسية المجموعة مع قورنوا عندما المدخنين عند تتغير لم الفسفور مستوى نتائج ان الدراسة اظيرت (p )value0.992 كانت و القياسية المجموعة مع قورنوا عندما المخنين عند الزنك عنصر مستوى في ىام انخفاض ىناك ان الدراسة اظيرت المعنوية pالقيمة value 0.000 وكانت التدخين مدة و الزنك عنصر مستوى بين ىام سمبي ارتباط ىناك ان الدراسة اظيرت المعنوية القيم p value 0.000 R value 0.322 المجموعة مع قورنوا عندما المدخنين عند الزنك و الكالسيوم عنصر مستوى في ىام انخفاض ىناك ان الدراسة ىذه خمصت مدخنين. الغير نتائج مع نتائجو قورنت عندما يتاثرالفسفور لم بينما القياسية