Masters theses : Medical Laboratory Science

Permanent URI for this collectionhttps://repository.neelain.edu.sd/handle/123456789/495

Browse

Start date: 2020Subject: search.filters.subject.Histopathology

Search Results

Now showing 1 - 5 of 5
  • Thumbnail Image
    Item
    Assessment of Serum Copper Level among Sudanese Cataract Patients
    (Al-Neelain University, 2021-03) GamilaGamal Ahmed Mohammed
    Abstract Background:A cataract a common pathological abnormality of the lens, is a cloudy or opaque area in the normally clear lens of the eye leading to a decrease in vision. Trace elements such as copper and zinc are associated with this disease. Objective: assessment of serumcopper levelin cataract patients. Materials and Methods :This study was performed at Mecca Eye Complex in Khartoum state during the period from January to February 2021. Eighty subjects was enrolled in the study then classified into 40 cataract patient age ranged between 30to70 years old, and 40 apparently health as control match group.The serum was diluted with de ionized water in the tube, and the copper standard was prepared by diluted the stock standard solution with 5 %( v/v) glycerol, then the analysis was performed against standard by 210/211 VGP atomic absorption spectrophotometer. Results:The study revealed that the mean level of copper was significantly lower in cataract patients group (0.21± 0.066) when compared to control group. In correlation analysis, copper show no significant correlation with age (r= -.039, p= .734) and gender(r= -.014, p= .902). Conclusion: The study showed that there were significant lower of copper in case group compare with control groupand therewas no significant correlation with study variables. الخلاصة الخلفية:إعتام عدسة العين هو خلل مرضى شائع في العدسة ’ وهو منطقه ضبابيه او معتمة في عدسة العين الشفافة بشكل طبيعي مما يؤدي إلي انخفاض في الرؤية. ترتبط العناصرالنزرة مثل النحاس والزنك بهذا المرض. الهدف:تقييم مستوى النحاس في الدم لدى مرضى إعتام عدسة العين. المواد و الطرق:أجريت هذه الدراسة بولاية الخرطوم بمجمع مكة للعيون خلال الفترة من يناير إلي فبراير2021 تم تسجيل 80 عينة في الدراسةتراوحت أعمارهم من 30الي 70 سنة ثم تم تصنيفهم الى 40 مرضى إعتام عدسة العين,و40متطوعا أصحاء كمجموعات ضابطة . تم تخفيف المصل بالماء المؤوين في الأنبوب ,وتم تحضير المعيارالنحاسي بتخفيف المحلول المعياري للمخزون بنسبة 5% ( حجم/حجم) من الجلسرين,ثم تم أجراء التحليل بالمقياس الطيفي للامتصاص الذري. النتائج:أوضحت هذه الدراسة أن متوسط مستوى النحاس انخفض معنويا في مجموعة مرضىإعتام عدسة العين (0.21=0.06 )بالمقارنة مع المجموعة الضابطة.ومع ذلك,لم يكن هناك فرق كبير في متوسط العمر بين المجموعتين (قيمةالاحتمال0.5 ). في تحليل الارتباط ,لا يظهر النحاس أي ارتباط معنوي بالمتغيرات. الخلاصة:أوضحت الدراسة وجود انخفاض معنوي في متوسط النحاس لدى مجموعة مرضى إعتام عدسة العين مقارنة مع المجموعة الضابطة ولم يكن هناكارتباط معنوي بالمتغيرات.
  • Thumbnail Image
    Item
    Evaluation of expression Alpha-methylacyl-CoA racemase in renal cell carcinoma among Sudanese patients
    (Al-Neelain University, 2020) Muhammad Almansor Ahmed Omer Ataher
    Abstract Background: Renal cancer is one of the most common cancers theworld it is estimated that 14,770 deaths (9,820 men and 4,950 women) from this disease will occur this year. Between 2007 and 2016, deaths from kidney cancer Aims: The study aimed to evaluate the expression AMACR immunohistochemical expression for renal tumors among Sudanese patient. Material and Methods: This is a retrospective case- control study that included randomly selected archived tissue blocks of 40 paraffin block samples was collected from patients previously diagnosed with renal cancer to represent cancer. All study samples were retrieved from police Teaching Hospital. Results: Forty paraffin blocks were collected from patients samples previously diagnosed as renal tumors, 40(100%) samples were malignant. The histopathological diagnosis of study renal tumors includes: clear cell 22(55%) papillary 11(27.5%) chromophobe 4(10%), sacrmoid 2 (5%) collecting duct 1(2,5%) This study revealed that most of the patient were 30-48(8)50-79(31) and 88-90(1)Diagnostic of patients with kidney tumor clear cell22 (55%) papillary11 (27,5%) chromophobe 4(10%) sacrmoid 2(5%)and collecting duct 1(2,5%) The study showed that the AMACR was positive in 23s and negative 17s. Conclusion: This result showed insignificant association (P.value 0.881) as indicated المستخلص حدوث 14.770 وفاة (9.820 رجل و 4950 امرأة) بسبب هذا المرض. بين عامي 2007 و 2016 ، الوفيات الناجمة عن سرطان الكلى الأهداف: تهدف الدراسة إلى تقييم التعبير المناعي (امكار) للأورام الكلوية بين المرضى السودانين المواد والطرق: كانت هذه دراسة الحالات والشواهد بأثر رجعي التي شملت عشوائيا كتل الأنسجة المؤرشفة من 40 عينات كتلة البارافين تم جمعها من المرضى الذين تم تشخيصهم سابقا بسرطان الكلى لتمثيل السرطان. تم استرداد جميع عينات الدراسة من مستشفى الشرطة التعليمي. النتائج: تم جمع أربعين كتلة من البارافين من عينات من المرضى الذين تم تشخيصهم سابقًا كأورام كلوية ، 40 عينة (100٪) كانت خبيثة. يشمل التشخيص الهستوباثولوجي لدراسة أورام الكلي خلية واضحة 22 (55 ٪) حليمي 11 (27.5 ٪) كروموفوب 4 (10 ٪ ، sacrmoid 2 (5 ٪) جمع القناة 1 (2،5 ٪) كشفت هذه الدراسة أن معظم كان المرضى بين 30-48 (8) 50-79 (31) و 88-90 (1) تشخيص المرضى الذين يعانون من الورم الكلوي خلية واضحة 22 (55 ٪) حليمي 11 (27،5 ٪) كروموفوب 4 (10 ٪)) sacrmoid 2 (5 ٪) وجمع القناة 1 (2،5 ٪) أظهرت الدراسة أن(امكار) كان إيجابيا في 17 وسلبي فى 23. الخلاصة: أظهرت هذه النتيجة ارتباطًا ضئيلاً كما هو موضح (0.88
  • Thumbnail Image
    Item
    Immunohistochemical Expression of Cyclin D1 in Sudanese Patients diagnosed with Prostatic adenocarcinoma
    (Al-Neelain University, 2020) Namarig Mohammad Farah Al- Taybe
    Abstract: Introduction: Cyclin D1 is a protein that is expressed in the G1 phase of the cell cycle and that has an important role in regulating the cell cycle and cancer progression. Its over-expression is believed to play an important role in both the tumor-genesis and grading of many cancers, including prostatic carcinoma. The aim of this study was to evaluate the expression of cyclin D1 in prostate cancer and its possible correlation with patients Gleason score. Material and method: This was a case control study which included 50 adenocarcinomas and 50 benign prostate hyperplasia. The expression of CyclinD1 was detected using immunohistochemistry technique. Immunohistochemistry prepared with tissue microarray has been also used with success in large scale efforts to create a map of protein expression on a more global scale. The histopathological diagnosis including tumor grades and diagnosis of control groups were all uploaded in an excel sheet. Data analysis was performed using SPSS statistical program. Result: The mean age was 66.7 for the case group and 60 for the control group. Cyclin D1 was expressed in cases group, the expression intensifies towards the advanced grades of cancer. And there was no expression for cyclin D1 in the majority of control group samples. Discussion: The mean age of the patients was within the common age of diagnosis of prostate cancer worldwide. Contradicting and agreeing with different international study; this study showed association between CyclinD1 expression and prostate cancer. And the significant association with the cancer grade indicates that Cyclin D1 plays an important role in the pathogenesis and evolution of prostate cancer. الملخص: المقدمة: Cyclin D1 هو بروتين يعبر عنه في المرحلة G1 من دورة الخلية وله دور مهم في تنظيم دورة الخلية وتطور السرطان. يُعتقد أن الإفراط في التعبير يلعب دورًا مهمًا في كل من نشأة الورم وتصنيف العديد من أنواع السرطان ، بما في ذلك سرطان البروستاتا. كان الهدف من هذه الدراسة هو تقييم التعبير عن cyclin D1 في سرطان البروستاتا وارتباطه المحتمل مع درجة Gleason للمرضى. الوسائل والطرق: شملت هذه دراسة 50 عينة سرطان بروستاتا و 50 عينة تضخم البروستاتا الحميد كمجموعة مستخدمة للمقارنة . تم الكشف عن تعبير CyclinD1 باستخدام كيمياء الأنسجة المناعية. تم إدخال جميع بيانات المريض ، بما في ذلك درجات الورم وكذلك تشخيص المجموعة المستخدمة للمقارنة في ورقة إكسل. تم إجراء تحليل البيانات باستخدام برنامج SPSS الإحصائي. النتائج: كان متوسط العمر 66.7 لمجموعة الحالة و 60 للمجموعة المستخدمة للمقارنة, أظهرت الدراسة أن تعبير Cyclin D1 في مجموعة الحالات كان موجب الظهور ويكثف التعبير نحو الدرجات المتقدمة من السرطان.بينما في المجموعة المستخدمة للمقارنة كان تعبير Cyclin D1 سالب الظهور في أغلب العينات . المناقشة: كان متوسط عمر المرضى ضمن العمر المشترك لتشخيص سرطان البروستاتا في جميع أنحاء العالم. يتعارض ويوافق مع دراسة دولية مختلفة ؛ أظهرت هذه الدراسة وجود ارتباط بين التعبير CyclinD1 وسرطان البروستاتا حيث أنه يزيد تعبير البروتين مع زيادة درجة السرطان . وعليه فإن تعبير بروتينCyclinD1 يمكن الإعتماد عليه في تشخيص سرطان البروستاتا والتفريق بينه وبين تضخم البروستاتا الحميد. CHAPTER I 1.1 Introduction: Prostate cancer is the most common malignancy among men in the United States and also ranks as the second most common cause of cancer death in males. It is estimated to be diagnosed in over 200,000 men in 2012, with over 28,000 deaths attributed to this cancer. In Sudan prostate cancer is a leading cause of death. An estimated 12.7 million new cancer cases occurred in 2008, of which about 715,000 new cancer cases resulted in 542,000 deaths. These numbers are projected to nearly double to 1.28 million new cancer cases and 970,000 cancer deaths by the year 2030 (Elamin et al., 2015). Prostatic disease is responsible for significant morbidity and mortality in men throughout the world. Prostatic carcinoma is a common and growing health problem. It is the third most common male cancer after malignancies of lung and stomach (Saeed et al., 2014). Prostate adenocarcinoma depends on androgen for growth and survival, and treatment for metastatic disease capitalises on this dependence, androgen elicit its biologic effects through activation of the androgen receptor AR (Gao et al.,2005). Cyclins are involved in the regulation of cell cycle progression. Previous studies revealed that overexpression of Cyclin D1 is known to shorten the G1-S transition and thus, it promotes cell progression and differentiation (Chen et al.,2004) reported that overexpression of Cyclin D1 increases cell growth and tumorgenecity in human prostate cancer cells. Few studies have addressed Cyclin D1 expression or localization in primary prostatic adenocarcinomas and the criteria used to establish positive Cyclin D1 staining have been divergent (Chang et al.2004). The diagnostic role of Cyclin D1 in prostate cancer has been studied in few researches. In this study we examined whether the expression of Cyclin D1 correlate with the diagnosis of prostatic carcinoma through studying the correlation and significance of association between Cyclin D1 expression and clinicopathological factors as Gleason grade of prostate cancer. Cyclin D1 is an amino acid that is expressed in the G1 phase of the cell cycle and that has an important role in regulating the cell cycle and cancer progression. Its over-expression is believed to play an important role in both the tumorigenesis and grading of many cancers, including prostatic carcinoma. 1.1.1 Cyclin D1: 1.1.1.1 gene expression: The CCND1 gene encodes the cyclin D1 protein. The human CCND1 gene is located on the long arm of chromosome 11 (band 11q13). It is 13,388 base pairs long, and translates into 295 amino acids. cyclin D1 is expressed in all adult human tissues with the exception of cells derived from bone marrow stem cell lines (both lymphoid and myeloid) (He et al.2007). 1.1.1.2 Function: The protein encoded by this gene belongs to the highly conserved cyclin family, whose members are characterized by a dramatic periodicity in protein abundance throughout the cell cycle. Cyclins function as regulators of CDKs (cyclin-dependent kinase). Different cyclins exhibit distinct expression and degradation patterns which contribute to the temporal coordination of each mitotic event (He et al.2007).
  • Thumbnail Image
    Item
    Frequency of G382D mutant variant of MYH gene in Sudanese patients with colorectal lesions
    (Al-Neelain University, 2020) Muram Kamil Haj nour
    ABSTRACT Background: Colorectal cancer (CRC) is the third leading cancer worldwide in terms of incidence, and it is one of the most common malignancies in developed regions, it shows records of high incidence and late detection of the disease in Sudan, and it was found to affect young age groups. MYH gene mutation cause MYH associated polyposis which is an autosomal recessive disease characterized by the development of multiple adenomatous polyps and eventually colorectal cancer and the G382D mutation have been found accounting for more than 80% of all MYH variants. Objectives: This study aimed to detect the frequency of G382D mutant variant of MYH gene in Sudanese patients with different colorectal lesions. And it’s correlation with the previously tested p53 polymorphism and APC and Kras genes mutations in the same case group. Materials and methods: Seventy two Stored extracted DNA in the research lab of the faculty of medical laboratory sciences at AlNeelian university of previously collected samples from patients previously diagnosed as colorectal lesions were screened for G382D mutant variant of MYH gene by Tetra-primer amplification refractory mutation system PCR technique to amplify both wild-type and mutant alleles . Results: The age of patients ranged between 9 years and 86 years with mean of 47.4 years. The males were 44 (61%) while females were 28 (39%) 47.2 % of the sample showed inflammatory lesion, 13.9% were polyp and 38.9% were showed tumor endoscopic ally. Twenty-five samples from the seventy-two samples tested for G382D mutant variant of MYH gene gave 111 bp bands which indicate the wild type, and no sample showed mutation indicated by absence of the 159 bp bands. The statistical test showed significant relation between the diagnosis of endoscopic lesions and the geographic distribution of patients with p. value (.013) and with the anatomical location of the lesions showing p. value (.000) There was no statistically significant relation between the endoscopic lesions and the genetic mutation of the APC and Kras genes and with the polymorphism of P53 gene. Conclusion: We concluded that the G382D mutant variant of MYH gene is not common within the patients of colorectal cancer and the premalignant lesions within the Sudanese population. And the endoscopic tissue biopsies revealed that it is a good source for genomic DNA extraction which can reveal the early genetic changes in colorectal lesions. المستخلص الخلفية: هو ثالث سرطان رائد على مستوى العالم من حيث الاصابة ‘ وهو واحد من أكثر الأورام (CRC)سرطان القولون والمستقيم الخبيثة شيوعا في المناطق المتقدمة، وتظهرالتسجيلات ارتفاعا في حالات الاصابة والاكتشاف المتأخر للمرض في السودان ، وقد وجد أنه يصيب المجموعات العمرية الصغيرة . الطفرة في جين (MYH) تسبب داء السلائل المرتبطة ب MYHوهو مرض جسدي متنحي يتميز بتطور السلائل المتعددة وسرطان القولون والمستقيم في نهاية المطاف وتم اكتشاف ان الطفرة G382D تمثل أكثر من 80% من جميع متغيرات MYH. الاهداف : هدفت الدراسة لتحديد تردد المتغير الطفري G382D للجينMYH في المرضى السودانيين الذين يعانون من آفات القولون والمستقيم المختلفة ، وارتباطه مع تعدد اشكال P53 وطفرات الجينات APC و Kras التي تم اختبارها في نفس مجموعة الحالات .  الطرق والوسائل : اثنان وسبعون عينة حمض نووي مستخلصة ومخزنة في مختبر الأبحاث بكلية علوم المختبرات الطبية بجامعة النيلين و التي تم جمعها مسبقا من مرضى سبق تشخيص اصابتهم بآفات القولون والمستقيم تم فحص المتغير الطفري G382D للجين MYH بواسطة نظام التضخيم الحراري الطفري رباعي البرايمر لتقنية تفاعل البلمرة المتسلسل .   النتائج: أعمار المرضى كانت بين 9 سنوات و 86 سنة بمتوسط 47.4 سنة . كان عدد الذكور 44 (61%) بينما عدد الاناث كان 28 (39%) . 47.2% من العينات اظهرت اعتلال التهابي ، 13.9% كانت سلائل و 38.9% اظهرت ورم بالمنظار . خمسة وعشرون عينة من الاثنين وسبعون عينة تم اختبارها من اجل المتغير الطفري G382D للجين MYH اعطت حزمةBp 111 الذي يشير الى(WILD)، ولم تظهر اي عينة الطفرة تم الاستدلال على ذلك بغياب حزمةBp 159 .   أظهر الاختبار الإحصائي علاقة مهمة بين تشخيص الآفات بالمنظار والتوزيع الجغرافي للمرضى بقيمة احتمالية (013.) ومع الموقع التشريحي للآفات بقيمة احتمالية (000.) . لم تكن هناك علاقة ذات دلالة احصائية بين الآفات المنظارية والطفرات الجينية للجينات APC و Kras والتعدد الشكلي للجين P53.  الخلاصة: خلصت الدراسة الى ان المتغير الطفري G382D للجين MYH ليس شائعا بين مرضى سرطان القولون والمستقيم والآفات السابقة للاورام الخبيثة في المرضى السودانيين. وكشفت خزعات الأنسجة بالمنظار أنه مصدر جيد لاستخراج الحمض النووي الجيني الذي يمكن أن يكشف عن التغيرات الجينية المبكرة في آفات القولون والمستقيم.
  • Thumbnail Image
    Item
    Immunohistochemical expression of Kras and Bcl 2 markers in colorectalcancer among Sudanese patients
    (Neelain University, 2020) Tagwa Altayeb Mustafa
    Abstract Background: This is a retrospective, analytical, study which was conducted at Ibn Sina hospital and Omdurman teaching hospital in Khartoum Aim: the aim of this study was to determine the immunohistochemical expression of Kras and Bcl2 tumor markers in colorectal cancer by using Tissue Microarray technique among Sudanese patients also correlate this expression with histopathology diagnosis, grade, age , gender and tumor type. Materials and methods: 75 blocks were collected from patients previsoly diagnosed with colorectal cancer by immunohistochemistry expression to detect Kras and Bcl2 protein. Results: Among the 75 cases subjected to Kras immunostaining, (64%) cases were positive compared with Bcl 2 is (12%) cases were positive, also expression of Kras protein cases was found more in (73%) non metastasize malignant tumor and (37%) metastasize one. The distribution of gender in the study population revealed that 43(57.3%) males and 32(42.7%) females, and no relation between gender and Kras or Bcl 2 expression(P. value 0.789)the study clarified that the disease occurred at a significantly high frequency above 50 years old .Most of malignant tumors ,moderately differentiated and well differentiated 38(50.7%) and only 23(30.7%) poorly differentiated tumors. Immunohistochemical expression of Kras and Bcl2 was not correlated with tumor grade, histopathology diagnosis and gender. Conclusion Immunohistochemical expression of Kras and Bcl2 was exclusively detected in colorectal cancer patients providing a useful marker for the carcinogenesis of colorectal tumors, also Kras is important for treatment follow-up specially among patient resistant to treatment with anti-EGFR therapy, and we recommend the application of tissue microarray technique for research and diagnosis as it shows a useful cost effective tool. المستخلص الخلفية: تمت هذه الدراسة التحليلية في مستشفى أمدرمان التعليمي وابن سيناء في ولاية الخرطوم واعتمدت على العينات النسيجية والبيانات والنتائج لحالات سرطان القولون والمستقيم في الأرشيف داخل هذه المستشفيات الأهداف: الكشف عن تعبير الخلايا والأنسجة المصابة بسرطان القولون والمستقيم لبروتين ال k ras و بروتين Bcl 2 باستخدام التقنية النسيجية الكيميائية المناعية (IHC ) الطريقة: تم جمع 75 قالب شمعي من حالات مشخصة مسبقا بسرطان القولون والمستقيم اعتمادا علي البيانات والنتائج السابقة التي تمت أرشفتها داخل المستشفى للكشف عن تعبير وظهور بروتين kras و بروتين Bcl2 في الخلايا النتائج: أظهرت نتائج الدراسة نسبة الاناث المصابة بسرطان القولون والمستقيم تعادل حوالي 57 % وهي أعلي من نسبة الذكور التي تعادل 43 % وكذلك أظهرت نسبة الفئات العمرية اكثر من 50 سنة تعادل 65 % من الحالات تحت الدراسة وهي أعلي من الفئات العمرية أقل من 50 سنة التي تعادل 35 % ووجدنا نتائج الدراسة علاقة وطيدة بين العمر والاصابة بسرطان القولون والمستقيم و أظهرت كذلك وجود علاقة بين العمر وتعبير خلايا وأنسجة القولون المصابة بالسرطان لبروتين kras و بروتين Bcl2 وكان تعبير وظهور بروتين ال k ras في الحالات تحت الدراسة عموما (64%) وهي نسبة كبيرة مقارنة مع ظهور بروتين ال Bcl 2 بنسبة (12%) وظهور بروتين ال k ras في حالات السرطان غير المنتشرNon-metastasized أكثر (73%) من حالات السرطان المنتشرMetastasized بنسبة (37%) وهذا يعني أن الخلايا تظهر بروتين k ras حتي قبل ان تصبح منتشرة الخلاصة:أهمية الكشف عن البروتينات في الخلايا والانسجة المصابة بالأورام كعلامة و أشاره لتشخيص مراحل ودرجة الأورام و كذلك لمتابعة كفاءة وتأثير العلاج لذلك نوصي باستخدام مجموعة من البروتينات لمعلومات أكثر عن تشخيص وعلاج الأورام و كذلك بدراسة تعبير بروتين ال k ras في الحالات و المرضي الذين يتعاطون علاج ( Anti-EGFR ) لدراسة كفاءة العلاج لسرطان القولون والمستقيم ونوصي باستخدام تقنية المصفوفات النسيجية ( TMA) لغرض البحوث او للتدريب فهي سريعة لإعداد العينات وتقلل التكلفة بصورة كبيرة وسهلة الاستخدام