Frequency of G382D mutant variant of MYH gene in Sudanese patients with colorectal lesions

Abstract

ABSTRACT

Background: Colorectal cancer (CRC) is the third leading cancer worldwide in terms of incidence, and it is one of the most common malignancies in developed regions, it shows records of high incidence and late detection of the disease in Sudan, and it was found to affect young age groups. MYH gene mutation cause MYH associated polyposis which is an autosomal recessive disease characterized by the development of multiple adenomatous polyps and eventually colorectal cancer and the G382D mutation have been found accounting for more than 80% of all MYH variants. Objectives: This study aimed to detect the frequency of G382D mutant variant of MYH gene in Sudanese patients with different colorectal lesions. And it’s correlation with the previously tested p53 polymorphism and APC and Kras genes mutations in the same case group. Materials and methods: Seventy two Stored extracted DNA in the research lab of the faculty of medical laboratory sciences at AlNeelian university of previously collected samples from patients previously diagnosed as colorectal lesions were screened for G382D mutant variant of MYH gene by Tetra-primer amplification refractory mutation system PCR technique to amplify both wild-type and mutant alleles . Results: The age of patients ranged between 9 years and 86 years with mean of 47.4 years. The males were 44 (61%) while females were 28 (39%) 47.2 % of the sample showed inflammatory lesion, 13.9% were polyp and 38.9% were showed tumor endoscopic ally. Twenty-five samples from the seventy-two samples tested for G382D mutant variant of MYH gene gave 111 bp bands which indicate the wild type, and no sample showed mutation indicated by absence of the 159 bp bands. The statistical test showed significant relation between the diagnosis of endoscopic lesions and the geographic distribution of patients with p. value (.013) and with the anatomical location of the lesions showing p. value (.000) There was no statistically significant relation between the endoscopic lesions and the genetic mutation of the APC and Kras genes and with the polymorphism of P53 gene. Conclusion: We concluded that the G382D mutant variant of MYH gene is not common within the patients of colorectal cancer and the premalignant lesions within the Sudanese population. And the endoscopic tissue biopsies revealed that it is a good source for genomic DNA extraction which can reveal the early genetic changes in colorectal lesions.

المستخلص

الخلفية: هو ثالث سرطان رائد على مستوى العالم من حيث الاصابة ‘ وهو واحد من أكثر الأورام (CRC)سرطان القولون والمستقيم الخبيثة شيوعا في المناطق المتقدمة، وتظهرالتسجيلات ارتفاعا في حالات الاصابة والاكتشاف المتأخر للمرض في السودان ، وقد وجد أنه يصيب المجموعات العمرية الصغيرة . الطفرة في جين (MYH) تسبب داء السلائل المرتبطة ب MYHوهو مرض جسدي متنحي يتميز بتطور السلائل المتعددة وسرطان القولون والمستقيم في نهاية المطاف وتم اكتشاف ان الطفرة G382D تمثل أكثر من 80% من جميع متغيرات MYH. الاهداف : هدفت الدراسة لتحديد تردد المتغير الطفري G382D للجينMYH في المرضى السودانيين الذين يعانون من آفات القولون والمستقيم المختلفة ، وارتباطه مع تعدد اشكال P53 وطفرات الجينات APC و Kras التي تم اختبارها في نفس مجموعة الحالات . الطرق والوسائل : اثنان وسبعون عينة حمض نووي مستخلصة ومخزنة في مختبر الأبحاث بكلية علوم المختبرات الطبية بجامعة النيلين و التي تم جمعها مسبقا من مرضى سبق تشخيص اصابتهم بآفات القولون والمستقيم تم فحص المتغير الطفري G382D للجين MYH بواسطة نظام التضخيم الحراري الطفري رباعي البرايمر لتقنية تفاعل البلمرة المتسلسل . النتائج: أعمار المرضى كانت بين 9 سنوات و 86 سنة بمتوسط 47.4 سنة . كان عدد الذكور 44 (61%) بينما عدد الاناث كان 28 (39%) . 47.2% من العينات اظهرت اعتلال التهابي ، 13.9% كانت سلائل و 38.9% اظهرت ورم بالمنظار . خمسة وعشرون عينة من الاثنين وسبعون عينة تم اختبارها من اجل المتغير الطفري G382D للجين MYH اعطت حزمةBp 111 الذي يشير الى(WILD)، ولم تظهر اي عينة الطفرة تم الاستدلال على ذلك بغياب حزمةBp 159 . أظهر الاختبار الإحصائي علاقة مهمة بين تشخيص الآفات بالمنظار والتوزيع الجغرافي للمرضى بقيمة احتمالية (013.) ومع الموقع التشريحي للآفات بقيمة احتمالية (000.) . لم تكن هناك علاقة ذات دلالة احصائية بين الآفات المنظارية والطفرات الجينية للجينات APC و Kras والتعدد الشكلي للجين P53. الخلاصة: خلصت الدراسة الى ان المتغير الطفري G382D للجين MYH ليس شائعا بين مرضى سرطان القولون والمستقيم والآفات السابقة للاورام الخبيثة في المرضى السودانيين. وكشفت خزعات الأنسجة بالمنظار أنه مصدر جيد لاستخراج الحمض النووي الجيني الذي يمكن أن يكشف عن التغيرات الجينية المبكرة في آفات القولون والمستقيم.