كلية علوم المختبرات الطبية
Permanent URI for this communityhttps://repository.neelain.edu.sd/handle/123456789/488
Browse
20 results
Search Results
Item Immunohistochemical Expression of Estrogen Receptors in Urinary Bladder Transitional Cell Carcinoma Among Sudanese Patients(Al-Neelain University, 2017) Amna Ahmed Mustafa SalimAbstract This is case study conducted at Elrahma Medical lab in Khartoum, during the period from January 2014 to January 2017. The study aimed to detect Estrogen Receptors expression in urinary bladder Transitional cell carcinoma among Sudanese patients using Immunohistochemical method. Fifty samples of paraffin embedded blocks previously diagnosed as Urinary bladder Transitional cell carcinoma were collected. Material and Method: Two section of three microns thickness were cut from each block one stained by hematoxylin and eosin and the other stained by immunohistochemical method for detection of ER expression. The data was collected from patient’s files and the obtained results were analyzed by using SPSS computer program version 21. Result: The patient’s ages among the study population ranged between 32 to 92 years with mean of age 60 years. Patients less than 60 years were 20 (40%) ,while patients older than 60 years were 30 (60%). The distribution of gender among the study population was 37 (74%) of patients was males, while 13 (26%) of patients were females. The grading of malignant tumor among the study population was 42(84%) low grade ,while 8 (16%) of malignant tumor with high grade. The correlation between ER expression and ages was 2 (4%) of patients less than sixty years show positive expression of ER, while 18 (36%) of patients less than 60 years didn’t show any expression of ER. In patient more than 60 years 2(4%) of patients samples show positive expression of ER ,while 28 (64%) of patients samples more than 60 years didn’t show any expression of ER with insignificant correlation between ER expression and age (P value 0.094). The association between ER expression and gender among the study was 3 (6%) of males show positive expression ,while 34 (68%) didn’t show any expression of ER. In female 1 (2%) show positive expression of ER, while 12 (24%) didn’t show any expression of ER with insignificant correlation between ER expression and gender (P value 0.725). The correlation between ER expression and grading of malignant tumors was four(8%) of the low grade tumor show positive expression of ER ,while 38 (76%) of low grade samples didn’t show any expression of ER . In high grade tumors no expression of ER observed with significant correlation between ER expression and grading of malignant tumors (P value 0.0030). Discussion: The mean age is 60 years, common cases and most of patient with bladder cancer over 60 years. Another study with larger sample size and more advanced technique should be performed to detect expression of ER in transitional carcinoma of the bladder. Conclusion: ER expression in urinary bladder transitional cell carcinoma not associated with age and gender. ER expression in urinary bladder transitional cell carcinoma is associated with tumors grade. المستخلص أجريت هذه الدراسة دراسة الحالة في مختبر الرحمة الطبي في ولاية الخرطوم خلال الفترة من يناير 2014إلى يناير 2017م حيث هدفت هذه الدراسة للكشف عن مستقبلات الاستروجين في سرطان الخلايا الانتقالية بالمثانة لدى المرضي السودانيين باستخدام تقنيه الكشف النسيجي الكيميائي المناعي . تم جمع خمسون قالب شمعي مطمور في شمع البراقين كانت مشخصة مسبقا كسرطان المثانة الانتقالي. المواد والطريقة: قطع من كل قالب شمعي شريحتين بسمك ثلاثة مايكرون وصبغت العينات باستخدام تقنية الكشف النسيجي بالهيماتوكسيلين والايوسين والأخرى بتقنية الكشف النسيجي الكيميائي المناعي ،وجمعت المعلومات من ملفات المرضى والنتائج التي تم الحصول عليها حللت باستخدام برنامج الحزمة الإحصائية للعلوم الاجتماعية الإصدار 21 . النتيجة: تراوحت أعمار المرضىفي الدراسة ما بين 32 إلى 92 ومتوسط العمر 60 سنة.أعمار المرضي اقل من 60 سنة كانت 20( 40%)، بينما أعمار المرضي اكبر من 60 سنة كانت 30(60%). توزيع النوع خلال الدراسة كان 37(74%) من المرضي كانوا رجال، بينما 13 (26%) من المرضي كانوا نساء. مراحل الورم في الدراسة كانت 42 (84%) بالمراحل الأولى،بينما 8 (16%) كانت في المراحل المتأخرة. العلاقة بين التعبير عن مستقبلات الاستروجين والعمر كان 2(4%) من عينات المرضي اقل من 60 سنة أظهرت تعبير ايجابي لمستقبلات الاستروجين ،بينما 18(36%) من المرضي أعمارهم اقل من 60 سنة لم تظهر أي تعبير لمستقبلات الاستروجين. في المرضي اكبر من 60 سنة كانت 2 (4%) من العينات أظهرت تعبير ايجابي لمستقبلات الاستروجين، بينما 28 (64%) من عينات المرضى أكثر من 60 سنة لم تظهر أي تعبير لمستقبلات الاستروجين مع عدم وجود علاقة بين التعبير عن مستقبلات الاستروجين والعمر(القيمةالاحتمالية تساوي 0.094). العلاقة بين التعبير عن مستقبلات الاستروجين والنوع في الدراسة كانت 3 (6%) من عينات الرجال أظهرت تعبير ايجابي لمستقبلات الاستروجين ،بينما34(68%) من عينات الرجال لم تظهر أي تعبير ايجابي لمستقبلات الاستروجين . في النساء 1 (2%) من العينات أظهرت تعبير ايجابي لمستقبلات الاستروجين، بينما 12 (24%) من عينات النساء لم تظهر أي تعبير ايجابي لمستقبلات الاستروجين مع عدم وجودعلاقة بين التعبير عن مستقبلات الاستروجين والنوع (القيمةالاحتمالية تساوي 0.725). العلاقة بين مراحل الاورام والتعبير عن مستقبلات الاستروجين كانت 4 (8%) من المراحل الأولي للورم أظهرت تعبير ايجابي لمستقبلات الاستروجين ،بينما 38(76%) من عينات المراحل الأولى لم تظهر أي تعبير ايجابي لمستقبلات الاستروجين،وفي المراحل الأخيره للورم لم تظهر أي تعبير ايجابي لمستقبلات الاستروجين مع وجود علاقة بين مراحل الأورام والتعبير عن مستقبلات الاستروجين (القيمة الاحتمالية تساوي 0.003). المناقشة: معظم الحالات الشائعة وأغلبيةمرضى سرطان المثانة أعمارهم فوق 60 سنة. يجب إنشاءدراسةأخريبعدد عينات أكثر وتقنيات متطورةأكثر للكشف عن مستقبلات الاستروجين في سرطان المثانة. الاستنتاجات: التعبير عن مستقبلات الاستروجين بسرطان الخلايا الانتقالي بالمثانة ليس له علاقة بالعمر أو النوع. التعبير عن مستقبلات الاستروجين بسرطان الخلايا الانتقالي بالمثانة له علاقة بمراحل الورم.Item Evaluation Of CD10 Expression In Ovarian Tumors by using Immunohistochemical Technique Among Sudanese Females(Al-Neelain University, 2019) Hanim Nader Mohmmadi MohammedABSTRACT Background: Ovarian cancer (OC) is one of the most common gynecologic cancers that have the highest mortality rate. It is one of the most common cancers in Sudan and has often diagnosed at late stages. Difficulty in detecting ovarian cancer at an early stage is a major factor contributing to poor clinical outcomes. Rational: The few studies demonstrated the rate of expression ofCD10 to becorrelated with progression and prognosis of ovarian cancer but in Sudan no study was done ,we wished to investigate whether CD10 expression is associated with progression of ovarian cancer and can be used as a prognostic marker for ovarian cancer patient. Aim: The aim of the study was to detect CD10 expression in ovarian tumors by using immunohistochemicallytechnique among Sudanese females Material and Methods: This was a descriptive case- control study todetect CD10 expression by using immuhistochemical technique that included randomly selected archived tissue blocks of 40 paraffin block samples were collected from patients previously diagnosed with ovarian cancer to represent cancer cases and 40 tissue blocks from patients diagnosed with benign ovarian tumors to represent control cases. All study samples were retrieved from National Public Health from 2016-2018. Results: The study includeEighty ovarian paraffin embedded tissue blocks were recruited for this study, Forty samples diagnosed with different types of ovarian cancer and forty samples diagnosed with benign tumors. The mean age of the malignant was 45 years and their age ranged between 30-60 years. and the mean of the benign was 31 years and their age ranged between 15-80 years . The histopathological diagnosis of study benign ovarian tumors includes: 23(57.5%) serous cystadenoma, 7(17.5%) mucinous cystadenoma, 6(15) mature cystic teratoma , 4(10%) cystadenofibroma.The histopathologicaldiagnosis of malignant ovarian tumors includes: 25(64%) epithelial ovarian cancer, 2(17%) malignant germ cell tumors, 13 (19%) granulosa cell tumor. The percentage expression of CD 10 is 2 positive (66.7%) 38 negative (49.4%) in malignant and 1 positive (33.3%) and 39 negative (50.6%) in the benign this result show in significant.(p value 0.556). the correlation of expression of cd10 according to the grade of malignantTumors show grade 1 is (24), 1(4.1%) positive and 23(95.8%) negative, grade 2 is (14),1(7.1%)positive and 13(92.8%)negative, grade 3 is (2), no positive and 2(100%) is negative. this result show in significant (p value 0.871). Conclusion: This study concluded thatCD10 could not differentiatebetweenbenign and malignant ovarian tumors. So further study with a large sample size is recommended. المستخلص المقدمة: سرطانات المبيض هي من اكثر السرطانات شيوعا ما بين النساء و التي لديها أعلى معدل وفيات بين النساء ليس فقط في السودان بل ايضا في العالم. تعد صعوبة اكتشاف سرطان المبيض في مرحلة مبكرة من العوامل الرئيسية التي تسهم في ضعف النتائج السريرية و بالتالي ارتفاع معدل الوفيات بهذا النوع من السرطانات. في السودان لم يتم اجراء دراسة, وكان الهدف من ابحاثنا هو تحليل مستويات التعبير في اورام المبيض ومراحل مختلفة باستخدام تقنيه التعبير المناعي. الهدف : كان الهدف من الدراسة الكشف عن التعبير المناعي ل CD10 بالنسبة لأورام المبيض بين الاناث السودانيات الطرق والوسائل : هذ الدراسة وصفيه مرجعيه للكشف عن ال CD10 في سرطان المبيض بتقنية التعبير المناعي. استخدمت في هذ الدراسة نوعين من العينات، الاولى هي عينات من سرطان المبيض و الاخرى لأورام مبيض حميدة و ذلك للمقارنة. تضمنت الدراسة 80 عينة عشوائية من الانسجة المحفوظة في شمع البارفين. 40 من هذه العينات لسرطانات المبيض و 40 أخرى من اورام المبيض الحميدة. أخذت العينات من علم الامراض بالمعمل القومي للصحة العامة في الفترة من 2016-2018 . النتائج: شملت الدراسة ثمانين كتلة من البارافين من عينات المرضى الذين شخصوا سابقا كأورام المبيض، وكانت 40 (50٪) عينات خبيثة و 40 (50٪) عينات حميدة. تراوحت أعمار المرضى في الفئة الحميدة ما بين 15 و 80 عامًا مع متوسط العمر 31 عامًا ، وفي الفئة الخبيثة بين 30 و 60 عامًا مع متوسط العمر 45 التشخيص المرضي لأورام المبيض الحميدة تشمل : 23(57.5%) ورم غدي صليبي مصلي , 7(17.5%) غدي ملتحمي مخاطيي ,6(15%) ورم مسخي كيسي ناضج و, 4(10%) ورم غدي عرقي .التشخيص المرضي لأورام المبيض الخبيثة تشمل :26(64%) سرطان المبيض الظهاري , 2(17%)لورم الخلية الجنسية الخبيث و13(19%) لورم الخلايا الحبيبية. النسبة المئوية للتعبير عن 10CD هي 2 موجبة (66.7%)38 سلبي( %49.4) في الاورام الخبيثة، و1 ايجابي (33.3) ,39 سلبي( %50.6) في الاورام الحميدة هذه النتيجة تظهر عدم وجود علاقه (القيمة الاحتمالية 0.556). العلاقة بين التعبير من cd10 وفقا لدرجة الأورام الخبيثة تظهر الصف 1 (24) ، 1 (4.1 ٪) ايجابي 23 (95.8٪) سلبي ، الصف 2 (14) ، 1 (7.1٪) إيجابي و 13 (92.8٪) سلبي ، الصف 3 (2) ، لا موجب و 2 (010%) سلبيه هذه نتيجة تظهر في (القيمة الاحتمالية0.871). الخلاصة: خلصت هذه الدراسة الي ان تعبير ال CD10 ليس له قيمه كبيره للتمييز بين أورام المبيض الحميدة والخبيثة ننصح بإجراء دراسات اخرى تشمل عدد اكبر منItem Cytological Assessment of Reactive and Atypical changes in Patients With pulmonary Tuberculosis in Khartoum State -Sudan(Al-Neelain University, 2019) Sara Adam Mohammed AdamAbstract Introduction: The development of TB in an exposed individual is a two-stage process following infection. In most infected persons, infection is contained by the immune system and bacteria become tubercles. In about 5% of infected cases, rapid progression to tuberculosis will occur within the first two years after infection. About 10% of people with latent infection will reactivate, half within the first year, the remainder over their lifetime. The multiplication of tubercle bacilli at any site causes a specific type of inflammation, with formation of the characteristic granuloma. Material and method: Cytological materials “sputum” were collected to form eighty (80) sputum smears from patients with signs, symptoms and radiological findings highly suggestive of tuberculosis but yet to be diagnosed by microbiological tests and microscopy was included. Healthy subjects’ sputum samples were collected from 22 individuals, set as control group. The microbiological tests were then done by Abu-ANAGE hospital lab and according to their results the study samples divided into two groups; case group who’s positive to present of Mycobacterium and control group who’s negative to present of Mycobacterium. Result: cytological finding in sputum smears of case group; the cellularity was low in 38 (47.5%) smears and high in 42 (52.5%) smears. Plasma cell was seen in 62 (77.5%) smears while 18 (22.5%) smears not contained any lymphocytes. Degenerative changes were absent in 2 (2.5%) smears, normal in 20 (25%) smears, mild in 32 (40%) smears, marked in 19 (23.75%) smears and sever in 7 (8.75%) smears. Reactive changes were absent in only one smear (1.25%), mild in 47 (58.75%) smears, marked in 29 (36.25%) smears and sever in 3 (3.75%) smears. الخلاصة المقدمة: ان تطور مرض السل لدى الأفراد المعرضين هو عمليه من مرحلتين بعد الاصابه في معظم الأشخاص المصابين ، يتم احتواء العدوى عن طريق جهاز المناعه وتصبح البكتيريا درنات في حوالي 5% من الحالات المصابة ، سيحدث تقدم سريع الي مرض السل خلال أول عامين بعد الاصابه. حوالي 10% من المصابين بعدوى كامنه سيعيدون تنشيط نضفهم خلال السنه الأولى ، والباقي على مدى حياتهم يؤدي تكاثر عصيات البكتيريا في اي موقع إلى نوع من التكاثر ، مع تكوين الورم الحبيبي المميز . المادة والطريقه : تم جمع المواد الخلوية (البلغم) لتشكيل (80) مسحه من البغلم من المرضى الذين ظهرت عليهم علامات واعراض ونتائج اشعاعيه توخي بشدة مرض السل ولكن لم يتم تشخيصها بعد عن طريق الاختبارات المايكروبيولوجية والفحص المجهري . تم جمع عينات البلغم من ال|أشخاص الاصحاء من 22 فردا ، تم تعيينهم كمجموعه تحكم . ثم تم اجراء الفحوصات المايكروبيولوجية من قبل معمل مستشفى أبوعنجه وفقا لنتائجها قسمت عينات الدراسه إلى مجموعتين، مجموعه الحالات التي أظهرت ايجابيه الاصابه، والمجموعه الضابطه الذين يعانون من وجود البكتيريا . النتيجة: الاكتشاف الخلوي في مسحات البلغم لمجموعه الحاله كانت الخلوية منخفضه في 38 (47.5%) مسحه مرتفعه في 42 (53.5%) مسحه شوهدت خلايا بلازما في 62 مسحه (77.5%) بينما 18 (22.5%) مسحه لا تحتوي على أي خلايا ليمفاويه، كانت التغيرات التنكسيه غائبه في مسحتين (2.5%) ، طبيعيه في 20 (25%) مسحه ، خفيفه في 32 (42%) مسحه ،ملحوظة في 19 (23.75%) مسحه ومقطعه في 7 (8.75) مسحات، كانت التغيرات التفاعليه غائبة في مسحه واحدة فقط (1.25%)، خفيفه في 47 (58.75) مسحه ، تم وضع علامه عليها في 29 (36.25%) مسحه ومقطعه في 3 مسحات .Item Detection of Expression CD 10 Biomarker in Renal Cell Carcinoma by Using Immunohistochemical Technique(Al-Neelain University, 2019) NjlaAbdulgaderAbuzaidWadeediAbstract Background: Renal cell carcinoma is a kidney cancer that originates in the lining of the proximal convoluted tubule, a part of the very small tubes in the kidney that transport primary urine. RCC is responsible for approximately 90–95% of cases. Renal cell carcinoma is the third most common cancer of the genitourinary tract globaly and accounts for approximately 2-3% of all cancer deaths. Aim: The aim of this study was to detect the diagnostic value of CD10 in renal cell carcinoma by using immunohistochemical technique among Sudanese patients in Elrahma hospital. Material and Methods: This was case controlhospital based study, conducted in Elrahmahospital, Khartoum state. Eighty subjects including forty cases previously diagnosed with renal cell carcinoma and forty with benign renal lesion. The data were analyzed using statistical package for social program sciences (SPSS-21.0) Results:20 (50.0%) of patients with renal cell carcinoma were positive for CD10 and 20 (50.0%) with negativefor CD10 while 34 (85.0%) of patients with benign renal lesionwith positivefor CD10 and 6 (15.0%) with negative for CD10 and there are significant relation between CD10 expression and renal cell carcinoma (p value 0.001). Conclusion: This study concluded CD10 is associated with renal cell carcinoma, however there is not associated with renal cell carcinoma or histological types. مستخلص الكشف عن CD10 في سرطان الخلايا الكلويه باستخدام التقنيات الكيميائيه المناعيه بين مرضي السودانين مقدمه:سرطان خلايا الكلى هو سرطان الكلى الذي ينشأ في بطانة الأنبوبة الملتوية القريبة ، وهي جزء من الأنابيب الصغيرة جدًا في الكلية التي تنقل بشكل أساسي البول. هو النوع الأكثر شيوعًا من سرطان الكلى لدى البالغين ، وهو مسؤول تقريبًا عن 90-95 ٪ من الحالات. سرطان خلايا الكلى هو ثالث أكثر أنواع السرطان شيوعًا في الجهاز البولي التناسلي وحسابات ما يقرب من 2-3 ٪ من جميع وفيات السرطان. الهدف:الهدف من هذه الدراسة هو اكتشاف القيمة التشخيصيةسي دي 10 في سرطان الخلية الكلوية باستخدام تقنية المناعيه لدى المرضى السودانيين في الخرطوم. الطرق والمواد : هذه دراسة حاله و تحكم مسنده إلى دراسة أجريت في مختبر الرحمة ، ولاية الخرطوم. ثمانون فردا بما في ذلك أربعون حالة تم تشخيصها سابقًا بسرطان الخلايا الكلوية وأربعون مع آفة حميدة كلوية كمجموعة تحكم. ثلاثة وعشرون من المرضى الذين يعانون من سرطان الخلايا الكلوية من الذكور وسبعة عشر من الإناث. اثنا عشر من المرضى الذين يعانون من سرطان الخلية كلوية كانوا أقل من 50 سنة وثمانية وعشرين كانو أكثر من 50 سنة. النتائج ::23 (57.5 ٪) كانوا من الذكور و 17 (42.5 ٪) من الإناث. أربعون من مرضى الورم الكلويالحميدي. 20 (50.0 ٪) من المرضى الذين يعانون من سرطان الخلايا الكلوية كانت إيجابية و 20 (50.0 ٪) كانوا السلبي بينما كان 34 (85.0 ٪) من المرضى الذين يعانون من الأنسجة الحميدة الكلوية إيجابية و 6 (15.0 ٪)كانت سلبية لـ CD10وهناك علاقة معنوية بين تعبير CD10وسرطان خلايا الكلى (ص=0.001). الخلاصه:خلصت هذه الدراسة إلى أن 50 ٪ من حالات سرطان الخلايا الكلوية إيجابية ل10CD المناعية. تعبير CD10 ليس له قيمة كبيرة في التمييز بين أنواع مختلفة من سرطان الخلايا الكلوية ودرجات مختلفةItem Possible association of ZNF804A gene polymorphism (rs1344706) among Sudanese patients diagnosed with schizophrenia(Al-Neelain University, 2018) Sarah Alhadi Mukhtarالملخص المقدمة: تمكن العلماء مؤخرا من التوصل الى ان جين ZNF804A (zinc-finger protein 804A)هو الجين الاوثق صلة بالفصام (الشيزوفرانيا) وذلك عبر دراسة مجموعات سكانية متعدده و خاصة الاوربيه و الاسيويه. كما إن تعدد أشكال النوكليوتيدات المفردة rs1344706 الذى يوجد فى ذلك الجين هو أقوى أشكال النيوكليتيد علاقة بالفصام. و هذه العلاقة توصل اليها العلماء عبر دراسات على مستوى الجينوم (GWAS). الهدف من هذه الدراسة هو التحقق من ارتباط احادى النيكليوتيد rs1344706 بمرض الفصام فى في مجموعة من السودانيين الذين تم تشخيصهم بالفصام و مقارنتها بمجموعة سليمة لمعرفة ما اذا كان rs1344706 يلعب دورا في الفصام عند السودانيين و عليه يمكن استخدامه كمؤشر حيوي فى الكشف المبكر عن المرض. الطرق و الوسائل: أحتوت الدراسة على 100 عينة دم منها 50 من مرضى مصابين بالفصام و 50 آخرون سليمين و لا يعانوا من اى مرض نفسى. جمعت عينات المرضى من مستشفى التجانى الماحى و ملئ الاستبيان طبيب مختص. جمعت عينات المشاركين السليمين من مستشفى السلاح الطبى و ملئ الاستبيان الخاص من قبلهم. تطابقت عينات المرضى و السليمين فى الجنس و العمر. أجيزة الدراسة من قبل لجنة أخلاقيات البحث العلمى بجامعة النيلين كما ان جميع المشاركين فى الدراسة قاموا بامضاء استمارات المشاركة فى البحث. تم تحليل العينات مخبريا باستخدام تقنيةٌRFLP و تحليل البيانات و نتائج الاختبار تم تحليلها أحصائيا باستخدام برنامج SPSS-21.0. النتائج: كان مجموع العينات يتكون من 54% انثى و 46% ذكر تتراوح أعمارهم ما بين 14- عام70 و متوسط اعمارهم 33.7 عام. ظهر عليه المرض اول مرة فى مرحلتى الطفولة و المراهقه. اغلب المرضى كانوا من سكان مدينة الخرطوم. و شكلت قبيلة الفور العرقية الاكبر ما بين المرضى. اوضح التاريخ العائلى للفصام علاقة قوية بالقابلية للاصابة بالفصام. ربات البيوت شكلوا المجموعة الاكبر من بين المصابين بالفصام. كان النمط الجينى GG الاكثر شيوعا بين مجموعتى المرضى (50) و السليمين (49)، و ان عينة واحده فقط من الاشخاص السليمين كانت النمط الجينى GT و لم تكن تحمل اى من العينات النمط الجينى TT. و عليه فان rs1344706 ليس لها علاقة بالفصام فى المجموعة السودانية المتضمنة فى هذه الدراسة. الخلاصة: الإناث أكثر تأثرا من الذكور وعمر بداية المرض هو خلال مرحلة الطفولة والبلوغ. ربات البيوت أكثر عرضة للخطر من العاملين ، وقبائل "الفور" لديها أعلى معدل لمرض انفصام الشخصية بين المجموعة المدروسة والتاريخ العائلي لمرض الشيزوفرينيا له ارتباط قوي. لا يقترن rs1344706 G> T SNP في جين ZNF804A بالتأثر بمرض الشيزوفرينيا في السودان. Abstract: Introduction: ZNF804A (zinc-finger protein 804A) has been recognized as a schizophrenia risk gene across different populations. Its intronic single-nucleotide polymorphism (SNP) rs1344706 is among one of the strongest susceptibility variants that have achieved genome-wide significance in genome-wide association studies (GWAS) for schizophrenia and has been widely and intensively studied. The aim of this case control study was to study rs1344706 in Sudanese diagnosed with schizophrenia in order to detect if this SNP plays a role in schizophrenic Sudanese. Materials and Methods: The study included 50 patients and 50 healthy controls, 54 females and 46 males. Patient samples were recruited from the clinic of El-Tigani El-Mahi hospital from already diagnosed schizophrenic patients. Controls were recruited from Omdurman Military Hospital. Patients and controls were matched based on age and sex. Pre-designed questionnaire that included demographic data and was filled by the patients’ clinician . The project was ethically approved by central institutional review board of Al-Neelain University. All samples were analysed for rs1344706 SNP using RFLP technique. Data were then analysed using SPSS-21.0 and results were represented as frequencies, OR, 95% CI and P value of >0.05 was considered significant. Results: The age range of all participants was between 14 and 70 years range, mean age was 33.7 years old. However the age of diagnosis with schizophrenia was > 20 years old. 54% were males and 46% were females. The majority of the patients were from Khartoum state and “Fur” tribes. Family history of schizophrenia showed strong association [P. Value (0.00), OR (10.422) and 95% CI (2.78 to 39.04)]. Housewives were the majority of the patients with lesser frequency and lack of association among officers, free lancer and farmers. The rs1344706 G>T SNP was not found among cases and 49 from controls samples carry the wild type genotype. Only one from the controls has the heterozygous genotype. Neither the patient nor the control samples carried the homozygous mutant genotype. Conclusion:Item Immunohistochemical Expression of Cyclin D1 in Sudanese Patients diagnosed with Prostatic adenocarcinoma(Al-Neelain University, 2019) Namarig Mohammad Farah Al- TaybeAbstract: Introduction: Cyclin D1 is a protein that is expressed in the G1 phase of the cell cycle and that has an important role in regulating the cell cycle and cancer progression. Its over-expression is believed to play an important role in both the tumor-genesis and grading of many cancers, including prostatic carcinoma. The aim of this study was to evaluate the expression of cyclin D1 in prostate cancer and its possible correlation with patients Gleason score. Material and method: This was a case control study which included 50 adenocarcinomas and 50 benign prostate hyperplasia. The expression of CyclinD1 was detected using immunohistochemistry technique. Immunohistochemistry prepared with tissue microarray has been also used with success in large scale efforts to create a map of protein expression on a more global scale. The histopathological diagnosis including tumor grades and diagnosis of control groups were all uploaded in an excel sheet. Data analysis was performed using SPSS statistical program. Result: The mean age was 66.7 for the case group and 60 for the control group. Cyclin D1 was expressed in cases group, the expression intensifies towards the advanced grades of cancer. And there was no expression for cyclin D1 in the majority of control group samples. Discussion: The mean age of the patients was within the common age of diagnosis of prostate cancer worldwide. Contradicting and agreeing with different international study; this study showed association between CyclinD1 expression and prostate cancer. And the significant association with the cancer grade indicates that Cyclin D1 plays an important role in the pathogenesis and evolution of prostate cancer. الملخص: المقدمة: Cyclin D1 هو بروتين يعبر عنه في المرحلة G1 من دورة الخلية وله دور مهم في تنظيم دورة الخلية وتطور السرطان. يُعتقد أن الإفراط في التعبير يلعب دورًا مهمًا في كل من نشأة الورم وتصنيف العديد من أنواع السرطان ، بما في ذلك سرطان البروستاتا. كان الهدف من هذه الدراسة هو تقييم التعبير عن cyclin D1 في سرطان البروستاتا وارتباطه المحتمل مع درجة Gleason للمرضى. الوسائل والطرق: شملت هذه دراسة 50 عينة سرطان بروستاتا و 50 عينة تضخم البروستاتا الحميد كمجموعة مستخدمة للمقارنة . تم الكشف عن تعبير CyclinD1 باستخدام كيمياء الأنسجة المناعية. تم إدخال جميع بيانات المريض ، بما في ذلك درجات الورم وكذلك تشخيص المجموعة المستخدمة للمقارنة في ورقة إكسل. تم إجراء تحليل البيانات باستخدام برنامج SPSS الإحصائي. النتائج: كان متوسط العمر 66.7 لمجموعة الحالة و 60 للمجموعة المستخدمة للمقارنة, أظهرت الدراسة أن تعبير Cyclin D1 في مجموعة الحالات كان موجب الظهور ويكثف التعبير نحو الدرجات المتقدمة من السرطان.بينما في المجموعة المستخدمة للمقارنة كان تعبير Cyclin D1 سالب الظهور في أغلب العينات . المناقشة: كان متوسط عمر المرضى ضمن العمر المشترك لتشخيص سرطان البروستاتا في جميع أنحاء العالم. يتعارض ويوافق مع دراسة دولية مختلفة ؛ أظهرت هذه الدراسة وجود ارتباط بين التعبير CyclinD1 وسرطان البروستاتا حيث أنه يزيد تعبير البروتين مع زيادة درجة السرطان . وعليه فإن تعبير بروتينCyclinD1 يمكن الإعتماد عليه في تشخيص سرطان البروستاتا والتفريق بينه وبين تضخم البروستاتا الحميد.Item Identification of Survivin in Esophageal Carcinoma by Immunohistochemical Technique among Sudanese Patients(Al-Neelain University, 2019) Sara Mahmoud Abdelmagid EssaAbstract Background: Esophageal cancer “Esc” is the 6th most common cause of cancer death worldwide with around 400,000 deaths in 2012 in Sudan earlier reports (1977) showed that the incidence of Ec was 1.4% of all malignant tumor. The disease affected both sex equally and was most common at the age group of(50-69).The two predominant histological subtypes of esophageal cancer are squamous cell carcinoma “SCC” which is more prevalent in developing countries and adenocarcinoma(AC)is common in the developed countries. These two forms of esophageal cancer are etiologically unrelated, because adenocarcinoma is primarily associated with gastric reflux and Barrett’sesophagus; whereas squamous cell carcinoma is mainly associated with multiple factors such as smoking, alcohol, hot tea drinks. Methods: This is retrospective cross-sectional hospital based study was done in Omdurman Teaching Hospital, during the period from January 2014 to January 2018.Fifty (50) paraffin embedded blocks previously diagnosed as esophageal carcinoma were collected One section of 3μm was cut from each paraffin block by rotary microtome, and stained by immunohistochemical method for detection of Survivin expression. Samples with adenocarcinoma were 12(24%) cases and samples with squamous cell carcinoma were 38(76%) of the cases. Results: The patients’ ages were ranged between 30 and 85 years old, with mean of 62.2 years. Over expression of Survivin was found in 7(14%) cases of adenocarcinoma samples and 5(10%) of the remained cases showed no over expression-results, while over expression was found in 2040%) cases of squamous cell carcinoma samples and 18 (36%) of the remained cases showed no over expression-results. This result showed significant association of Survivin expression and esophageal tumors (p. value 0.009). Conclusion: from result of our study we concluded that EC is higher in females’ patients more than males and Subtype of SCC is predominant than adenocarcinoma and the common grade found in this study in the both types of EC is the well differentiated grade. Recommendation: acoording to our result surivin immunohistochmistry could be used as adiagnosic marker. المستخلص الخلفية:سرطان المرىء بنوعيه (الغدي و الحرشفي) يُعتبر من الأورام الخطيرة جداً نظراً لقيمته التشريحية و الوظيفية, مما أدى إلى التكهن السيء الذي يتبع حالات هذا المرض والتي ترتبط بالوفاة. في السودان وعلى نطاق الدراسات الإحصائية التي أنجزت, وتم تسجيلها, والتي جعلت من هذا المرض نسبة إنتشار كبيرة وسط المرضى السودانيين. بحيث في كل مائة ألف هنالك عدد 5.8 شخص مصاب. الهدف من الدراسه هو الكشف عن مستقبلات السيرفافين في سرطان المرئ عند المرضى السودانيين باستخدام كيمياء الانسجه المناعيه . الطريقة:اجريت هذه الدراسة التحليليه الاسترجاعية في مستشفى امدرمان ’خلال الفترة من يناير2014الي يناير 2018.جُمعت خمسين عينه مشخصه مسبقا بسرطان المرئ. تم قطع شريحة واحدة بسمك 3 مايكرون من كل قالب شمعي برافين باستخدام المشراح الدوار ثم صبغت بواسطة كيمياء الانسجه المناعية للكشف عن مستقبلات السيرفافين ثم تم جمع البيانات من ملفات المرضى وتحليلها ببرنامج الاحصاء التحليليه. تمثل عدد الاورام الغديه12%)24)عينة بينما تمثل عدد العينات الحرشفيه 38(67%) عينة. النتائج:اغلبيه المرضى كانوا من الاناث يمثلوا 26(52%) والذكور يمثلوا 24 (48%) ترواحت اعمار المرضي بين 03الي 85 سنه مع متوسط العمر 57,5 سنه. اظهرت الدراسة فى مستقبلات السيرفافين كانت ايجابيه بنسبه (54%( فى 27 عينة وسالب الظهور بنسبه (46%) فى32عينهاظهرت هذه النتيجة انه لا توجد علاقه ذات دلاله احصائيه بين مستقبلات السيرفافين واورام المرئ p.vale0.009)) . الخلاصة: • سرطان المرئ اعلى نسبة في الاناث اكثر من الذكور . • نوع الخلايا الحرشفي هو اكثر شيوعا . • سرطان المرئ بنوعيه (الغدي و الحرشفي).الطور الاول الاكثر شيوعاItem Detection of Cyclin D1 Biomarker in Renal Cell Carcinoma by Immunohistochemical Technique(Neelain University, 2019) Amani Sayed Ahmed Ahmed DirarAbstract Background: Renal cell carcinoma is a kidney cancer that originates in the lining of the proximal convoluted tubule, a part of the very small tubes in the kidney that transport primary urine. Renal cell carcinoma responsible for approximately 90–95% of cases.Renal cell carcinoma is the third most common cancer of the genitourinary tract globallyand accounts for approximately 2-3% of all cancer deaths. Aim: The aim of this study was to detect the diagnostic value of cyclin D1 in renal cell carcinoma by using immunohistochemstry technique among Sudanese patients in Elrahma hospital Material and methods: This was case control hospital based study, conducted in Elrahma lab, Khartoum state. Eighty subjects including forty cases previously diagnosed with renal cell carcinoma and forty with benign renal lesion. The data were analyzed using statistical package for social program sciences (SPSS) Results:22.5% of patients with renal cell carcinoma were positive and 31 (77.5%) with negative for cycline D1 while 3 (7.5%) of patients with benign renal lesion with positive for cycline D1 and 37 (92.5%) were negative for cycline D1 and there are significant relation between cyclineD1 expression and renal cell carcinoma (p value 0.115). Conclusion: This study concluded that 77.5% of cases of renal cell carcinoma are negative for cyclin D1 immunostaining. Cyclin D1 had no significant value in the differentiation of different types of renal cell carcinoma and different grade. مستخلص مقدمه:سرطان خلايا الكلى هو سرطان الكلى الذي ينشأ في بطانة الأنبوبة الملتوية القريبة ، وهي جزء من الأنابيب الصغيرة جدًا في الكلية التي تنقل بشكل أساسي البول. هو النوع الأكثر شيوعًا من سرطان الكلى لدى البالغين ، وهو مسؤول تقريبًا عن 90-95 ٪ من الحالات. سرطان خلايا الكلى هو ثالث أكثر أنواع السرطان شيوعًا في الجهاز البولي التناسلي وحسابات ما يقرب من 2-3 ٪ من جميع وفيات السرطان. الهدف:الهدف من هذه الدراسة هو اكتشاف القيمة التشخيصية للسيكلين دي1 في سرطان الخلية الكلوية باستخدام تقنية المناعيه لدى المرضى السودانيين في الخرطوم. الطرق و المواد :هذه دراسة حاله و تحكم مسنده إلى مستشفى دراسة أجريت في مختبر الرحمة ، ولاية الخرطوم. ثمانون فردا بما في ذلك أربعون حالة تم تشخيصها سابقًا بسرطان الخلايا الكلوية وأربعون مع آفة حميدة كلوية كمجموعة تحكم. ثلاثة وعشرون من المرضى الذين يعانون من سرطان الخلايا الكلوية من الذكور وسبعة عشر من الإناث. اثنا عشر من المرضى الذين يعانون من سرطان الخلية كلوية كانوا أقل من 50 سنة وثمانية وعشرين كانو أكثر من 50 سنة. النتائج ::23 (57.5 ٪) كانوا من الذكور و 17 (42.5 ٪) من الإناث. أربعون من مرضى الورم الكلوي الحميدي. 20 (50.0 ٪) من المرضى الذين يعانون من سرطان الخلايا الكلوية كانت إيجابية و 20 (50.0 ٪) كانوا السلبي بينما كان 9 (22.5 ٪) من المرضى الذين يعانون من الأنسجة الحميدة الكلوية إيجابية و 31 (77.5 ٪)كانت سلبية لـ CD1وهناك علاقة معنوية بين تعبيرCD1 وسرطان خلايا الكلى (ص=0.001). الخلاصه:خلصت هذه الدراسة إلى أن 50 ٪ من حالات سرطان الخلايا الكلوية إيجابية CD1 المناعية. تعبيرCD1ليس له قيمة كبيرة في التمييز بينأنواع مختلفة من سرطان الخلايا الكلوية ودرجات مختلفة التوصيات: يمكن استخدام الموسم CD1بالإضافة إلى موسمات أخرى للتمييز بين الورم الكلوي الحميد والورم الكلوي الخبيث. لا يمكن استخدام CD1للتمييز بين الأنواع النسيجية المختلفة لـ سرطان خلايا الكلى. لا يمكن استخدام CD1كعلامة لتطور في سرطان الخلايا الكلويه الصافيه.Item Evaluation of Survivn Immunostain Expression in Ovarian Tumors among Sudanese patients(Neelain University, 2019) Shahinda Ahmed AbdelrazegAbstract Background: Ovarian cancer is one of the most common cancer in women, with worldwide incidence 238.619 incidence cases in 2012 according to international agency for research on cancer . Rational: Numerous studies demonstrated the rate of expression and subcellular localization of survivin to be correlated with progression and prognosis of ovarian cancer but in sudan no study was done. The aimed of our research was to reveal these correlations by analyzing expression levels in ovarian tumors and different stages using immunohistochemical technique. Aims: The study aimed to evaluate survivin immunohistochemical expression for ovarian tumors among Sudanese females. Material and Methods: This was a descriptive retrospective study todetect survivn expression by usiog immuhistochemical technique , that included randomly selected archived tissue blocks of 40 paraffin block samples was collected from patients previously diagnosed with ovarian cancer to represent cancer cases and 40 tissue blocks from patients diagnosed with benign ovarian tumors to represent control cases. All study samples were retrieved from national public health laboratory. period from 2016 to 2018. Data was analyzed using SPSS 23 computer program. Frequency, mean, and chi-square test values was calculated. Results: Eighty paraffin block were collected from patients samples previously diagnosed as ovarian tumors, 40(50%) samples were malignant and 40 (50%) samples were benign. The histopathological diagnosis of study benign ovarian tumors includes: 23(57.5%) serous cystadenoma, 7(17.5%) mucinous cystadenoma, 6(15) mature cystic teratoma , 4(10%) cystadenofibroma.The histopathologicaldiagnosis of malignant ovarian tumors includes: 25(64%) epithelial ovarian cancer, 2(17%) malignant germ cell tumors, 13 (19%) granulosa cell tumor. The age of study population in benign range between 15 and 80 years with mean age of 31 years, and in malignant range between 30 and 60 with mean age 45 years. Survivin positive expression was found in (16\40) samples of malignant tumors and (0/40) benign ovarian tumors. This result revealed showed significant association between survivin and malignant ovarian tumors with P .value (0.000) The survivin and their grade in ovarian tumors shows in grade 1 is 1(6%) with positive expression, grade 2 is 2(13%), and grade 3 is 13(81%). There was possible association between the tumor grade and survivin with P.value (0.001) Conclusion: Survivin is associated with ovarian cancer and its grades .and can be useful for prognostic marker but this use for grade with outcome. المستخلص المقدمه: يعد سرطان المبيض واحدًا من أكثر أنواع السرطان شيوعًا بين النساء ، حيث بلغت حالات الإصابة في جميع أنحاء العالم238.619حالة في عام 2012وفقًا لوكالة دولية للأبحاث حول السرطان. أظهرت العديد من الدراسات معدل التعبير والتمركز الخلوي الثانوي فالسرفافين ليرتبط بتقدم وتشخيص سرطان المبيض في السودان لم يتم اجراء الدراسة . وكان الهدف من ابحاثنا هو تحليل مستويات التعبير في الورام المبيض ومراحل مختلفة باستخدام تقنيه التعبير المناعي . الأهداف: تهدف الدراسة إلى تقييم التعبير المناعي لسرفافين بالنسبة لأورام المبيض بين الإناث السودانيات الطرق و الوسائل هذ الدراسه وصفيه مرجعيه للكشف عن السرفافين في سرطان المبيض بتقنية التعبير المناعي , والتي شملت نوعين من العينات، الاولى هى عينات من سرطان المبيض و الاخرى لاورام مبيض حميده و ذلك للمقارنه.تضمنت الدراسه 80 عينة عشوائية من الانسجة المحفوظه فى شمع البارفين. 40 من هذه العينات لسرطانات المبيض و 40 أخرى من اورام المبيض الحميده. أخذت العينات من معمل علم الامراض بالمعمل القومي للصحة العامة فالفترة من 2016-2018 .تم تحليل البينات باستخدام برنامج الحزمة لاحصائيه للعلوم الاجتماعية . النتائج:جمعت ثمانين كتلة من البارافين من عينات المرضى الذين شخصوا سبقًا كأورام المبيض، وكانت 40 (50٪) عينات خبيثة و 40 (50٪) عينات حميدة. التشخيص المرضي لاورام المبيض الحميدة تشمل : 23(57.5%)ورم غدي صليبي مصلي , 7(17.5%) غدي ملتحمي مخاطيي ,6(15%) ورم مسخي كيسي ناضج و, 4(10%) ورم غدي عرقي .التشخيص المرضي لاورام المبيض الخبيثه تشمل :26(64%)سرطان المبيض الظهاري, 2(17%)لورم الخليه الجنسيه الخبيث و13(19%) لورم الخلايا الحبيبية. تراوحتأعمار المرضى في الفئة الحميدة ما بين 15 و 80 عامًا مع متوسط العمر 31 عامًا ، وفي الفئة الخبيثة بين 30 و 60 عامًا مع متوسط العمر 45 تم العثور على تعبير إيجابيسرفافينفي (16 \ 40) عينات من الأورام الخبيثة و (0/40) أورام المبيض الحميدة. أظهرت هذه النتيجة وجود علاقة معنوية بين الأورام الناجحة والخبيثة مع (القيمة الاحتمالية = 0.000) اضهرت الدراسه ان سرفافين إيجابي ودرجة في أورام المبيض في الصف 1 هو 1 (6 ٪) مع التعبير الإيجابي ، والصف 2 هو 2 (13 ٪) ، والصف 3 هو 13 (81 ٪). كان هناك ارتباط ممكن بين درجة الورم وسرفافين (القيمة الاحتمالية = 0.001) الخلاصة: من خلال الدراسه أوصينا بما يلي ان السرفافين يميز أورام المبيض الخبيثة لذا يمكن أن يستخدم كذكر لتشخيص وكذلك يمكن أن يستخدم كموسم إنذاري للورمItem The role of BRCA1/2 genes mutations and The Epstein–Barr virus (EBV) in the Etiology of Breast cancer among Yemeni women patients.(Al-Neelain University, 2019-06) Ammar Saleh Abdullah OmarABSTRACT Background Breast cancer is a major health problems in both developing and undeveloped countries. It is the most frequently diagnosed malignant disease which affected most females in the Arab world including Yemen. Among many risk factors of BC, mutations in BRCA1/2 genes was found to be the primary cause in 5–10% of cases. The majority of deleterious mutations are frameshift, nonsense mutations and missense mutations. Most of the reported BRCA1/2 mutations are protein truncating mutations. The Epstein–Barr virus (EBV) is a widely researched candidate virus. Association of Epstein-Barr virus (EBV) with breast carcinomas uncertain for now. Aims The study aimed to reveal the presence of mutations in the two breast cancer susceptibility genes BRCA1 and BRCA2 and their possible contribution to a etiology of breast cancer and association of the Epstein–Barr virus (EBV) on the aetiology of breast cancer, in Yemeni women patients. Materials and methods This is a retrospective case-control study conducted at National Oncology Center, Sana'a, Yemen and Histopathology Laboratory of USTH, AL Kuwait University Hospital Histopathology laboratory and Aulaqi Specialized Med lab, during the period from May 2015 to May 2019. Archived paraffin embedded tissue blocks from 100 Yemeni women who were, pathologically diagnosed with breast cancer, were used as cases, 50 with benign breast diseases were used as a control. In this study a specific region of BRCA1 exon 11, exon 20 and exon 11 in BRCA2 was targeted using PCR and DNA sequencing. Conventional PCR and immunohistochemistry (IHC) were done separately for all samples to identify EBV latent member protein-1 (LMP-1) in breast cancer cells and controls. Results In this study, 150 sample patients were distributed based on age, breast lesions were 100 (66.7%) with breast cancer females were considered as a (case group) ranging their age between 20-75 years with a mean of 40.03 ± 1.332 years. While, another 50 sample patients were selected (33.3%) with benign breast tumors were considered as (control group) ranging between 19 to 62 years, with a mean age of 26.50 ± 1.340 years with statistically significant difference P value (< 0.0001). In this study, breast cancer was discovered rate of (72.3%) in the right breast and (27.2%) in the left breast. Out of forty mutation variants (26.7%) of the total number of samples with p value (0.0001 and Odd ratio 8.333) identified in the two exons of BRCA1, 27 in exon 11 and 6 in exon 20 were novel. Among them one nonsense, 6 frames-shift deletions, 2 frames-shift insertions, and 7synonymous were identified. The first three mutations comprised respectively 2.5%, 12.5% and 5% of all identified mutations and 1.9%, 7.1% and 1.3% of the total mutation frequency. In BRCA2 exon 11 identified for 35 (23.33% P value 0.0070 and Odds ratio 3.308) mutations (26/35; 74.2%) were also novel. Among them frameshift deletions comprised 8.6% of the identified mutations. Percentages of frameshift deletion and nonsense mutations calculated on the basis of the total number of mutation frequency were respectively 8.3% and 1.9%. Missense mutations in BRCA1and BRCA2 genes in the case group accounted to 44.2% and 38.2% of the total mutation frequency respectively. Seventeen novel missense mutations were identified in BRCA1 and 16 in BRCA2. Fourteen in BRCA1 and 7 in BRCA2 were predicted as deleterious by SIFT software. The damaging nature of 11 nsSNPs in BRCA1 and 3 in BRCA2 was further confirmed by PolyPhen software prediction. A novel missense mutation (c.1215G>T) in region D of exon 11 (BRCA1) was identified in two cases of the control group. In BRCA2 three cases in the control were nonsense mutation carriers and six more were missense mutation carriers in the same region of exon 11. Out of nine previously reported mutations two missense, one synonymous and one nonsense mutations were identified in region A of exon 11. Nine synonymous mutations were specified in the case group; 6 of them were novel variants and the remaining were previously reported. In EBV specimen is consider positive when LMP-1 was detected using PCR or IHC for same sample. PCR method was performed for EBV LMP-1, 37 out of 100 in case group were positive and 63 were negative. 50 controls 15 of them were positive for LMP-1 expression by PCR and 35 were negative. P value and Odd ratio were 0.4682, 1.370 respectively the p value non-significant when Odd ratio more than 1 that indicate related between EBV infections and breast cancer. However, when IHC was done 24 out of 100 cases were positive and 74 were negative and 10 out of 50 controls were positive and 40 were negative. Odd ratio were 0.6811. Conclusion This study concluded that in the identification of 40 mutation variants in two exons (11and 20) of BRCA1 out of them 33/40 (82.5 %) was a novel mutation and 35 variants in exon 11 of BRCA2 26/35, (74.3 %) of them was a novel. The finding of this study provide strong association between mutations in BRCA1 and BRCA2 genes and breast cancer amongst Yemeni women patients. EBV LMP-1, 37 out of 100 were positive and 63 were negative. Fifteen controls were positive for LMP-1 by PCR and 35 were negative, however, when IHC was done, 24 and 76 cases and 10 and 40 controls were respectively positive and negative, this finding provide significant association between EBV infection and breast cancer. الملخص المقدمة يعتبر سرطان الثدي من المشاكل الصحية الرئيسية في الدول المتقدمة وغير المتقدمة، ويعد كذلك من أكثر أنواع السرطانات الخبيثة انتشاراً في أوساط النساء في الوطن العربي بما في ذلك الجمهورية اليمنية. وتعد الطفرات الوراثية في جيني بركا1 وبركا2 من أكثر الأسباب شيوعاً للإصابة بسرطان الثدي، حيث تمثل ما نسبته 5-10 % من إجمالي الإصابة، حيث وغالبية الطفرات الوراثية في جيني بركا1 وبركا2 المنشورة في الدراسات السابقة ذات تأثير ضار في البروتينات. كما يعد فيروس الابشتاين بارا فيرس من أكثر أنواع الفيروسات انتشاراً، ولكن علاقة الفيروس بسرطان الثدي غير معروفة حتى الآن. الأهداف تهدف هذه الدراسة إلى التعرف على الطفرات الوراثية المحتملة في جيني بركا1 وبركا2، وكذلك الكشف عن فيروس الابشتاين بارا في أنسجة الثدي، واحتمالية كونه من المسببات لهذا السرطان لدى النساء اليمنيات المصابات بهذا النوع من السرطان. المواد والطرق تم إجراء هذه الدراسة المقارنة الرجعية في مدينه صنعاء (اليمن) في الفترة من مايو 2015م إلى مايو 2019م، حيث تم أخذ (150) عينية (عينة) نسيجية محفوظة في قوالب شمعية من كلٍ من: مركز الأورام، مستشفى جامعة العلوم والتكنولوجيا، مستشفى الكويت التعليمي، وكذلك مختبرات العولقي التخصصية. من هذه المائة والخمسين عينة هنالك 100 عينة تم تشخيصها مسبقاً بسرطان الثدي إضافة إلى خمسين عينة تحكيمية شُخصت بالورم الليفي. وفي هذه الدراسة تم استهداف 4 مناطق محددة في اكسون 11 جين بركا1 ومنطقة مستهدفة في اكسون 20، كما تم استهداف منطقتين في اكسون 11 في جين البركا 2 لدراستها، والكشف عن الطفرات الوراثية فيها باستخدام تفاعل سلاسل انزيم البوليمر وتسلسل الحمض النووي الدنا. وكذلك تم استخدام كيمياء الأنسجة المناعية وتفاعل سلاسل انزيم البوليمر مستهدفة جين البروتين الجداري الكامن1 للكشف عن فيروس الابشتاين بارا فيرس. النتائج في هذه الدراسة يتراوح العمر بين 20 –ا75عاماً في 100 حالة المرضية بسرطان الثدي بمتوسط عمري بين 40.03 ± 1.332، و 19-62 سنة بالنسبة للخمسين حالة التحكيمية بمتوسط عمري يتراوح بين 26.50 ± 1.340، وكانت القيمة الاحتمالية <0.0001. توزعت العينات في هذه الدراسة بين (72.3%) من الثدي الأيمن و(27.2%) من الثدي الأيسر. تم التعرف على 40 طفرة وراثية في اكسون 11 واكسون 20 في جين بركا1 منها 33 طفرة وراثية نادرة وبدلالة احتمالية 0.0001. كما تم التعرف على 35 طفرة وراثية في اكسون 11 جين بركا 2 منها 26 طفرة نادرة وبدلالة احتمالية 0.0070. وتم الكشف عن البروتين الغشائي الكامن لفيروس الابشتاين بار فيرس بواسطة تفاعل التسلسلي البوليمير حيث كانت 37 إيجابية و63 سلبية في العينات المائة المصابة بسرطان الثدي مقارنة بعدد 15 حالة إيجابية و35 حالة سلبية من الخمسين حالة التحكيمية، بينما تم اكتشاف البروتين الغشائي الكامن لفيروس الابشتاين بارا فيرس بواسطة تفاعل النسيج الكيمائي حيث كانت 24 إيجابية و76 سلبية في المائة عينة المشخصة بسرطان الثدي، بينما كانت عدد الحالات الإيجابية 10 والسلبية 40 في الحالات الخمسين التحكيمية. الخاتمة تعطي هذه الدراسة دليل مقنع بوجود علاقة بين الطفرات الوراثية في جيني بركا1 وبركا2 وسرطان الثدي بين النساء اليمنيات. من ناحية أخرى أثبت هذه الدراسة وجود علاقة ذات دلالة إحصائية بين الإصابة بفيروس الابشتاين بارا وسرطان الثدي.