Possible association of ZNF804A gene polymorphism (rs1344706) among Sudanese patients diagnosed with schizophrenia

Abstract

الملخص المقدمة: تمكن العلماء مؤخرا من التوصل الى ان جين ZNF804A (zinc-finger protein 804A)هو الجين الاوثق صلة بالفصام (الشيزوفرانيا) وذلك عبر دراسة مجموعات سكانية متعدده و خاصة الاوربيه و الاسيويه. كما إن تعدد أشكال النوكليوتيدات المفردة rs1344706 الذى يوجد فى ذلك الجين هو أقوى أشكال النيوكليتيد علاقة بالفصام. و هذه العلاقة توصل اليها العلماء عبر دراسات على مستوى الجينوم (GWAS). الهدف من هذه الدراسة هو التحقق من ارتباط احادى النيكليوتيد rs1344706 بمرض الفصام فى في مجموعة من السودانيين الذين تم تشخيصهم بالفصام و مقارنتها بمجموعة سليمة لمعرفة ما اذا كان rs1344706 يلعب دورا في الفصام عند السودانيين و عليه يمكن استخدامه كمؤشر حيوي فى الكشف المبكر عن المرض. الطرق و الوسائل: أحتوت الدراسة على 100 عينة دم منها 50 من مرضى مصابين بالفصام و 50 آخرون سليمين و لا يعانوا من اى مرض نفسى. جمعت عينات المرضى من مستشفى التجانى الماحى و ملئ الاستبيان طبيب مختص. جمعت عينات المشاركين السليمين من مستشفى السلاح الطبى و ملئ الاستبيان الخاص من قبلهم. تطابقت عينات المرضى و السليمين فى الجنس و العمر. أجيزة الدراسة من قبل لجنة أخلاقيات البحث العلمى بجامعة النيلين كما ان جميع المشاركين فى الدراسة قاموا بامضاء استمارات المشاركة فى البحث. تم تحليل العينات مخبريا باستخدام تقنيةٌRFLP و تحليل البيانات و نتائج الاختبار تم تحليلها أحصائيا باستخدام برنامج SPSS-21.0. النتائج: كان مجموع العينات يتكون من 54% انثى و 46% ذكر تتراوح أعمارهم ما بين 14- عام70 و متوسط اعمارهم 33.7 عام. ظهر عليه المرض اول مرة فى مرحلتى الطفولة و المراهقه. اغلب المرضى كانوا من سكان مدينة الخرطوم. و شكلت قبيلة الفور العرقية الاكبر ما بين المرضى. اوضح التاريخ العائلى للفصام علاقة قوية بالقابلية للاصابة بالفصام. ربات البيوت شكلوا المجموعة الاكبر من بين المصابين بالفصام. كان النمط الجينى GG الاكثر شيوعا بين مجموعتى المرضى (50) و السليمين (49)، و ان عينة واحده فقط من الاشخاص السليمين كانت النمط الجينى GT و لم تكن تحمل اى من العينات النمط الجينى TT. و عليه فان rs1344706 ليس لها علاقة بالفصام فى المجموعة السودانية المتضمنة فى هذه الدراسة. الخلاصة: الإناث أكثر تأثرا من الذكور وعمر بداية المرض هو خلال مرحلة الطفولة والبلوغ. ربات البيوت أكثر عرضة للخطر من العاملين ، وقبائل "الفور" لديها أعلى معدل لمرض انفصام الشخصية بين المجموعة المدروسة والتاريخ العائلي لمرض الشيزوفرينيا له ارتباط قوي. لا يقترن rs1344706 G> T SNP في جين ZNF804A بالتأثر بمرض الشيزوفرينيا في السودان.

Abstract: Introduction: ZNF804A (zinc-finger protein 804A) has been recognized as a schizophrenia risk gene across different populations. Its intronic single-nucleotide polymorphism (SNP) rs1344706 is among one of the strongest susceptibility variants that have achieved genome-wide significance in genome-wide association studies (GWAS) for schizophrenia and has been widely and intensively studied. The aim of this case control study was to study rs1344706 in Sudanese diagnosed with schizophrenia in order to detect if this SNP plays a role in schizophrenic Sudanese. Materials and Methods: The study included 50 patients and 50 healthy controls, 54 females and 46 males. Patient samples were recruited from the clinic of El-Tigani El-Mahi hospital from already diagnosed schizophrenic patients. Controls were recruited from Omdurman Military Hospital. Patients and controls were matched based on age and sex. Pre-designed questionnaire that included demographic data and was filled by the patients’ clinician . The project was ethically approved by central institutional review board of Al-Neelain University. All samples were analysed for rs1344706 SNP using RFLP technique. Data were then analysed using SPSS-21.0 and results were represented as frequencies, OR, 95% CI and P value of >0.05 was considered significant. Results: The age range of all participants was between 14 and 70 years range, mean age was 33.7 years old. However the age of diagnosis with schizophrenia was > 20 years old. 54% were males and 46% were females. The majority of the patients were from Khartoum state and “Fur” tribes. Family history of schizophrenia showed strong association [P. Value (0.00), OR (10.422) and 95% CI (2.78 to 39.04)]. Housewives were the majority of the patients with lesser frequency and lack of association among officers, free lancer and farmers. The rs1344706 G>T SNP was not found among cases and 49 from controls samples carry the wild type genotype. Only one from the controls has the heterozygous genotype. Neither the patient nor the control samples carried the homozygous mutant genotype. Conclusion: