Masters theses : Medical Laboratory Science
Permanent URI for this collectionhttps://repository.neelain.edu.sd/handle/123456789/495
Browse
1 results
Search Results
Item Molecular Detection of bla OXA-48 Gene Encoding Carbapenem Resistance Pseudomonas aeruginosa Clinical Isolates from Khartoum State hospitals(Al-Neelain University, 2019-11) Doha Omer Ali MohammedABSTRACT Background: Carbapenem resistance in P.aeruginosa is particularly worrisome because this class of β-lactam represents the last therapeutic resource for control of bacterial infection. Aim: This study aimed to detect the frequency of bla OXA-48 resistance gene among Pseudomonas aeruginosa clinical isolates during the period from November 2018 to November 2019. Methods: Hundred Pseudomonas aeruginosa clinical isolates represented 81 carbapenems ( imipenem and meropenem) resistant and 19 carbapenems sensitive isolates were collected from different specimens from Omdurman Teaching Hospital, Fedail Hospital and Soba Teaching Hospital for this study in Khartoum State-Sudan. All isolates were re-identified using conventional bacteriological techniques and their susceptibility to carbapenems were tested using Kirby-Bauer method for confirmation. All isolates were investigated for the presence of the bla OXA-48 gene using conventional PCR technique. Results: Based on PCR assays, 60 (60.0%) out of 100 Pseudomonas aeruginosa clinical isolates were positive for blaOXA-48 gene .Out of 81 carbapenem resistant isolates 54 (66.7%) were positive for bla OXA-48 gene, while among the (19) carbapenem sensitive isolates 6 (31.6%) were positive for blaOXA-48 gene. There was statistically significant association between carbapenem resistant isolates and the presence of blaOXA-48 gene (P-value = 0.006). Wound swabs were the predominant clinical samples detected harboring bla OXA-48 gene both among the sensitive 5 (83.3%) and carbapenem resistant isolates 29 (53.7)(P.value> 0.05). Conclusion: Our findings revealed high frequency ofbla OXA-48 among carbapenem resistant isolates whereas it was detected in low percentage among the sensitive isolates, so identification of bla OXA-48 producing strains and taking efforts to reduce the rate of transferring these gene between the different strains is essential for optimization of therapy and improves of patients outcomes. ملخص الدراسة خلفية الدراسة: تعد مقاومـــة الكاربابينيم في االزائفه الزنجاريه مثيرة للقلق بشكــل خاص لأن هذه الفئة من بيتا لاكتام تمثل آخر مورد علاجي للسيطرة على العدوى البكتيرية. الهدف: هدفت هذه الدراسة إلى الكشف عن مدى شيوع جين المقاومة-48 bla OXA بينالعــــــزلات السريريه للزائفة الزنجاريه خلال الفتره من نوفمبر 2018 إلي نوفمبر 2019 الطرق: تضمنت هذه الدراسه عدد 100 عزله سريريه للزائفه الزنجاريه وهى عباره عن 81 عزله مقاومه للكاربابينيمات (ميروبينيم وايميبينيم) وعدد 19عزله حساسه لهذه الكـــاربابينيمات, لقد تم جمعها من عينات مختلفه من مستشفى ام درمان التعليـمي , مستشفى فضيل و مستشفي سوبا التعليمي لغرض هذه الدراسة . لقد تم إعاده التعرف لجميع العزلات بإستخدام التقنيــات البكترولوجيه التقليديه, وتم إختبار قابليتها للتعرض للكاربابينيمات بإستخدام طريقه كيربي باور للتأكد. تم فحص جميع العزلات لوجود جين 48-blaOXAبإستخدام تقنية تفاعل البلمـــرة المتسلسل التقليديه . النتائج : استنادا إلى اختبارات نتائج تفاعلات البلمرة كانت 60 (60%)من اصل 100 عزله سريريه للزائفه الزنجاريه ايجابيه بالنسبه لجينblaOXA-48وقد اظهر عدد54 (66.7%) من ضمن 81 من العزلات المقاومه للكاربابينمات نتيجه ايجابيه لجين 48- blaOXA ، بينما من ضمن 19 عزله حساسه للكاربابينمات كانت فقط 6 (31.6%) ايجابيه لهذا الجين. لقد وجد ان هنالك ارتباط ذو دلالة إحصائية بين العزلات المقاومة للكاربابيننيم ووجود جين 48-blaOXA (القيمة ب 0.006). لقد وجد ان مسحات الجرح هي العيناتالسريرية السائدة التي تحتوي علي جين blaOXA-48 بين كل من العزلات الحساسه 48(83.3%) والعزلات المقاومـــــه للكاربابيننيم 29(53.7%) (القيمة ب > 0.05). الخاتمه : لذلك فإن التعرف على سلالات blaOXA-48 المنتجة وبذل الجهود لتقليل معدل نقل هذه الجينات بين السلالات المختلفة أمر ضروري لتحسين العلاج وتحسين نتائج المرضى .