Masters theses : Medical Laboratory Science
Permanent URI for this collectionhttps://repository.neelain.edu.sd/handle/123456789/495
Browse
1 results
Search Results
Item PCR Detection of Plasmodium Falciparum in Human Urine and Blood Samples(Al-Neelain University, 2017) Abdel Rahim Musa OmerAbstract Background: Current detection or screening for malaria infection necessitates drawing blood by finger prick or vein puncture, which poses risks and limitations for repeated measurement. Therefore this study aimed to present PCR detection of plasmodium Falciparum in human urine and blood and illustrates this potential application in genotyping malaria infection. Material and Methods: Urine and blood “ vein puncture sample “ were obtained from “20” thick film positive and “5”negative individuals immediately after examination of thick blood film “finger blood “ with positive malaria seen – each spogles .Plasmodium Falciparum DNA was extracted from blood and urine in separate groups. Results: Malaria infections exhibited primarily low-grade parasite densities, with a geometric mean of asexual parasites/μl. Regularly matching polymorphic MSP2 genotypes were found between the corresponding urine, and peripheral blood amplicons of each individual, with different inter-individual polymorphic genotypes. Amplicon yields were significantly dependent on DNA extraction method, parasite density and primer set (p < 0.001). A Qiagen kit extraction had more than 2× higher amplicon yield than the guanidine chloride method, for both urine Amplicon yields were 1.6 fold higher from urine. For each unit increase in log parasite density, the probability of amplicon enhanced 1.8 fold. Highest amplicon yields were obtained from the primer set with the shortest PCR product. الخـلاصـة الخلفية: الكشف الحالي أو الكشف عن عدوى الملاريا يستلزم رسم الدم عن طريق وخز الأصبع أو ثقب الوريد، مما يشكل مخاطر وحد للقياس المتكرر. ولذلك هدفت هذه الدراسة إلى تقديم كشف PCR من بلاسموديوم فالسيباروم في البول والدم البشري ويوضح هذا التطبيق المحتمل في عدوى ملاريا التنميط الجيني. المواد والطرق: تم الحصول على البول والدم من "عينة ثقب الوريد" من "20" فيلم سميك إيجابي و "5" أفراد السلبي مباشرة بعد فحص فيلم الدم السميك "دم الاصبع" مع وجود الملاريا - لكل سبوجلز (spogles). الحمض النووي لبلاسموديوم فالسيباروم المستخرجة من الدم والبول في مجموعات منفصلة. النتائج: أظهرت حالات العدوى بالملاريا في المقام الأول كثافة في طفيليات منخفضة المستوى، مع متوسط هندسي للطفيليات الجنسية / ميكرولتر. وجدت بانتظام مطابقة للوراثية متعددة الأشكال MSP2 بين البول، وأمبليكونس (amplicon) الدم المحيطي لكل فرد، مع مختلف الأنواع الوراثية متعددة الأشكال الفردية. وكان ناتج أمبليكون amplicon تعتمد بشكل كبير على طريقة استخراج الحمض النووي، وكثافة الطفيليات والمجموعة الأولية (ع <0.001). وكان استخراج كيتاغين أكثر من 2 × أعلى أمبليكون ناتج من طريقة كلوريد غوانيدين، لكلا البول. وكان ناتج أمبليكون amplicon 1.6 أضعاف من البول. لكل وحدة زيادة في كثافة الطفيليات، واحتمال تعزيز amplicon الى 1.8 أضعاف. تم الحصول على أعلى ناتج أمبليكون من مجموعة الأولية مع قصور في منتج PCR.