Detection of Quinolone Resistance Genes among Selected Enterobacteriaceae Clinical Isolates

Abstract

Abstract Background Enterobacteriaceae are a large family of Gram-negative bacteria. Antibiotic resistance are major public health problems worldwide, that happens when bacteria develop the ability to defeat the drugs designed to kill them. Aim This study aimed to detect some quinolones (qnr) resistance genes in selected Enterobacteriaceae clinical isolates at Khartoum State. Methods The current was a descriptive cross-sectional study conducted from September to February 2023. A total of 100 Enterobacteriaceae clinical isolate was obtained from different laboratories in Khartoum states (Al Selah Hospital, Police Hospital, Fedal Hospital, Estak Hospital and Altra Laboratory). These strains (Escherichia coli, klebsiella spp, salmonella spp, pseudomonas spp and proteus spp) were re-identified using gram stain and conventional biochemical tetsts. All isolates were tested for selected type of antibiotic disk using modified Kirby-bauer testing. Qnr resistance genes (A&B) were detected using polymerase chain reaction (PCR). Results Urine was the most frequent specimens (50%), skin and wound (19%), sputum (13%), blood (10%), body fluid (5%), tissue (1%), stool (1%) and eye swab (1%). In antimaicrobial sensitivity test, 70% of isolates were resistance to Nalidixic acid and 49% were resistance to Ciprofloxacin. Among All clinical isolate 19% were positive for qnrA and (39%) for qnrB gene. Conclusion The qnrA and qnrB genes were highly prevalent in Enterobacteriaceae. They were not associated with the type of isolates and antimicrobials resistance profile.

المستخلص الخلفية ﺗﻌﺘﺒﺮ البﻜﺘﻴﺮﻳﺎ المعوية ﻓﺼﻴﻠﺔ ﻛﺒﻴﺮة ﻣﻦ البكتيريا سالبة الجرام, وتعتبر مقاومة المضادات الحيوية من المشكلات الرئيسية للصحة العامة في جميع انحاء العالم . يحدث ﻋﻨﺪﻣﺎ ﺗﻨﻤﻲ اﻟﺠﺮاﺛﻴﻢ ﻣﺜﻞ اﻟﺒﻜﺘﻴﺮﻳﺎ اﻟﻘﺪرة ﻋﻠﻰ ﻫﺰﻳﻤﺔ اﻷدوﻳﺔ اﻟﻤﺼﻤﻤﺔ ﻟﻘﺘﻠﻬﺎ. الهدف ﻫﺪﻓﺖ ﻫﺬه اﻟﺪراﺳﺔ إﻟﻰ اﻟﻜﺸﻒ ﻋﻦ ﺟﻴﻦ ﻣﻘﺎوﻣﺔ اﻟﻜﻴﻨﻮﻟﻮﻧﺎت في اﻟﻌﺰﻻت اﻟﺴﺮﻳﺮﻳﺔ اﻟﻤﻌﻮﻳﺔ اﻟﻤﺨﺘﺎرة ﺑﻮﻻﻳة اﻟﺨﺮﻃﻮم. الطريقة كانت الدراسة الحالية عبارة عن دراسة مقطعية وصفية أجريت في الفترة من سبتمبر إلى فبراير 2022. تم الحصول على مجموعه 100 عزلة إكلينيكية من البكتيريا المعوية من معامل مختلفة بولاية الخرطوم. تم إعادة تحديد هذه السلالات باستخدام صبغة جرام و البيوكيميائية التقليدية. تم اختبار مقاومة جميع العزلات لمضادات الميكروبات باستخدام اختبار كيربي باور المعدل. تم الكشف باستخدام تفاعل البلمرة المتسلسل عن جينات مقاومة الكينولون ( أ) و( ب) النتائج ﻛﺎن اﻟﺒﻮل أﻛﺜﺮ اﻟﻌﻴﻨﺎت ﺷﻴﻮﻋا(50%) واﻟﺠﻠﺪ واﻟﺠﺮوح (19%) و البلغم(13%) والدم(10%) وسوائل الجسم(5%) والانسجه(1%) والبراز(1%) ومسحه العين(1%) في اختبار حساسيه مضادات الميكروبات, وجد ان 70% من العينات مقاومة لحمض النالديكسيك اسد و 49% مقاومة للسيبروفلوكساسين. من بين جميع العزلات السريرية, كانت نسبه 19% موجه لجين qnrA وبالنسبه لجين qnrB كانت 49% . الخلاصة كانت جينات مقاومة الكينولون ( أ) و( ب) منتشرة بشكل كبير بين اﻟﻌﺰﻻت اﻟﺴﺮﻳﺮﻳﺔ اﻟﻤﻌﻮﻳﺔ. لم تكن هذه الجينات مرتبطة بنوع العزلات وشكل مقاومة مضادات الميكروبات