Molecular Detection of blaNDM Gene in Multidrug Resistant Acinetobacter baumannii from Clinical Samples in Khartoum State.

Abstract

Abstract Background: Acinetobacter baumannii is an opportunistic bacterial pathogen with intrinsic and acquired resistance to many antibiotics. Antibiotic resistance is one of the most urgent threats to the public's health. PCR is one of most sensitive, specific and easy tests that used to detect many pathogens with known genetic sequences. Aim: Study was aimed to detect A.baumannii and the frequency of blaNDM gene in each isolate and correlate it with the age, gender and type of collected samples. Materials and Methods: The study was conducted in Khartoum State, during period from September 2019 to January 2020. 100 ready isolated and identified Acinetobacter spp. were collected from clinical samples from different hospitals, identified phenotypically and subjected to PCR test to detect A.baumannii and the frequency of blaNDM gene in each A.baumannii isolate. Result: Ninety six out of 100 isolates were identified as A.baumannii, which were subjected to PCR to detect blaNDM gene. Seven from 96 A.baumannii were NDM positive, three of them were from females and four were from males. Five of them were found within 26-50 years age group one within 51-75 years age group and one within 76-91 years age group with average age 50.9 years. Most were found in sputum specimen Conclusion: In the present study, the frequency of blaNDM among A.baumannii isolates was low (7.3%). ملخص الدراسة خلفية الدراسة: الراكدة البومانية هي بكتريا انتهازية ممرضة لديها مقاومة ذاتية ومكتسبة للعديد من المضادات الحيوية. تعتبر مقاومة المضادات الحيوية من أكثر التهديدات خطورة على الصحة العامة. يعد تفاعل البلمرة المتسلسل أحد أكثر الاختبارات حساسية، سهولة وتحديدا والتي تستخدم للكشف عن العديد من مسببات الامراض ذات التسلسل الجيني المعروف الأهداف: هدفت الدراسة للكشف عن بكتريا الراكدة البومانية ومعرفة نسبة جين المقاومة (NDM) في البكتريا المعزولة وعلاقة وجوده بالعمر، الجنس ونوع العينات المجمعة. طرق البحث: أجريت الدراسة بولاية الخرطوم، في الفترة من سبتمبر 2019 الى يناير 2020. تم جمع 100 عينة بكتريا معزولة ومحددة من مختلف العينات من مستشفيات مختلفة. تم اجراء تفاعل البلمرة المتسلسل لتحديد البكتريا (راكدة بومانية) ولمعرفة نسبة جين المقاومة (NDM) في البكتريا المعزولة. النتائج: 96 من أصل مئة عينه كانت راكدة بومانية. سبعه من أصل 96 عينة راكدة بومانية كانت تحتوي على جين المقاومة (NDM). 4 منهم ذكور و3 عينات لإناث بمتوسط عمر 50.9. خمسه منها تقع ضمن الفئة العمرية 26-50, واحده منها ضمن الفئة العمرية 51-75 وواحده منها ضمن الفئة العمرية 76-91. الخاتمة: توصلت الدراسة الى ان جين المقاومة موجود بنسبه منخضه (7.3%) في الراكدة البومانية.