Isolation and identification of aetiological agent of middle ear infection (otitis media) and their antibiotic susceptibility in Khartoum state.

Abstract

Abstract This study was done to investigate the occurrence of the middle ear infections among different ages and gender, besides isolation and identification of the causative aerobic bacteria and fungi that associated with middle ear infections and also to evaluate the antimicrobial activity with certain antibiotics against the isolated bacteria. One hundred samples were collected from Ear Nose Throat (ENT) Hospital of Khartoum. The causative bacterial agents were isolated by using different types of culture media and identified by using biochemical tests. Antimicrobial susceptibility tests for bacteria were performed using modified Kirby Bauer disc diffusion method, and using national committee for clinical laboratory standards (NCCLS). Fungi were isolated and identified by using culture media and examined microscopical examination. Gram-positive bacteria that were isolated in this study included Staphylococcus aureus (6.4%), Staphylococcus epidermidis (1.8%), Staphylococcus sabrophyticus (0.9%) Aerococcus viridians (11.8%), Listeria monocytogenes (0.9%) Bacillus badius (0.9%) Bacillus megatarium (0.9%) and Corynebacterium spp (0.9%). Gram -negative bacteria which were isolated included Aeromonas hydrophila (16.4%), Pseudomonas aeruginosa (4.6%), Proteus mirabilis(3.6%), Proteus vulgaris (1.8%), Proteus rettgeri (1.8%), Proteus vulgaris biogroup2(1.8%), Haemophillus influenza(1.8%), Erwinia herbicola (0.9%), Pseudomonas spp(5.5%) Acaligenes spp(1.8%), Citrobacter freundii (0.9%), Klebsiella spp(3.6%), Acinetobacter spp(4.6%), Chromobacterium violaceium(6.4%). Enterobacter aerogenes (0.9%), Actinobacillus spp (0.9%), Aerobacter spp (0.9%) and Escherichia fergusonii (0.9%). Antimicrobial susceptibility tests showed that Gram positive bacteria includes Staphylococcus aureus, Staphylococcus epidermidis, Staphylococcus sabrophyiticus, Listeria monocytogenes , Aerococcus viridians, Bacillus megaterium, and Bacilus budius were mostly susceptible to Gentamicin, Ciprofloxacin, Oflaxacin, while all of them were resistant to penicillin. Antimicrobial susceptibility results showed that all Gram-negative bacteria were mostly sensitive to Gentamicin, Ciprofloxacin and Amikacin. Erwinia herbicola was susceptible to all antibiotics except Ampicillin and Tetracycline. Proteus spp was susceptible to Chloramphenicol, Co-trimexazole, and Gentamicin, while they were susceptible to Ciprofloxacin and Amikacin. Pseudomonas aeruginosa was resistant to Tetracycline and Ampicillin, and susceptible to Gentamicin and Amikacin. The isolated fungi were Aspergillus niger (4.6%), Aspergillus nidulans (0.9%) and Penicillium sp (0.9%). These were isolated from females only, while Aspergillus terreus (0.9%) was isolated from infected male. Candida spp was of isolation percentage of 40% and 60% from infected males and females respectively whereas Aspergillus flavous was 75% and 25% from males and females respectively. Females and males who were infected with fungi showed a rate of (64.7%) and (35.3%) respectively. The percentage of chronic otitis media was (58.5%), and acute one was (41.2%). The highest fungi infections with otitis media were found in group aged (1-10) years old, while patients of less than one year showed no fungal infections.

الملخص تم إجراء هذه الدراسة للكشف عن حدوث الاصابة بالتهابات الأذن الوسطى ، بجانب العزل ، والتعرف على البكتيريا الهوائية ، والفطريات المسببة لالتهابات الأذن الوسطى . وكذلك تقييم النشاط الميكروبى لمجموعة مضادات حيوية ضد البكتيريا المعزولة. جمعت 100 عينة من مستشفى الأذن والانف والحنجرة ( الخرطوم )،وعُزلت ، وتم التعرف على الميكربات المصاحبة بواسطة الزراعة فى عدة أوساط مختلفة ،وبإجراء الاختبارات الكيموحيوية. تم استخدام تقنية كيربى باور المعدلة (الانتشار )لاجراء النشاط ضد الميكروبى،وذلك باستخدام العزلات الميكروبية القياسية .أما الفطريات فقد تم عزلها عن طريق الزرع والفحص المجهرى .العزلات البكتيرية الموجبة لصبغة جرام اشتملت على: الاستافيلوكوكس اوريس (6.4 % ) ،الاستافيلوكوكس ابيديرمس (1.8 % )،الاستافيلوكوكس سابروفايتكس ( 9 ,0 %)، والايروكوكس فيريدانس (11.8 %)،الليستيريا مونوسايتيجينس (9 . 0%) ،الباسيلس باديس (9. 0 %)،الباسيلس ميقاتاريوم (9 .0 %)،والكوراينوباكتريوم (9 .0 %) .العزلات البكتيرية السالبة لصبغة جرام اشتملت على الايروموناس هيدروفيلا (4. 16%)،الزائفة الزنجارية (6 , 4 %)،المتقلبة الرائعة (6 . 3 %)، المتقلبة الاعتيادية (8. 1 %)،البروتيس رترجى (8 .1%)،البروتيس فولجارس بيوقروب 2 (8 .1%)،هيموفيلس انفلونزا(8. 1%)،ايروينيا هيربيكولا (9 , 1 %)،وأنواع أخرى من السيدوموناس (5 . 5%),انواع الكاليجينس (8 . 1%)، ستروباكترفرندياى (9 .0%)، أنواع الكليبسيلا (6 . 3%)، أسيتوباكتر (6 . 4%)،كروموباكتر فايولاسيوم (4 . 6 %)، انتيروباكتر ايروجينس (9 . 0 %)، أكتينوباسيلس (9 . 0 %) ،أنواع ايروباكتر (9 . 0 %)، إشريشيا فيرجسوناى (9 . 0 %) .اختبار النشاط ضد الميكروبي أظهر أن العزلات الموجبة لصبغة جرام كانت ذات حساسية ضد الجنتامايسين،والسبروفلوكساسين ، اوفلاكساسين ، فى حين أنها مقاومة للبنسلين .أما العزلات السالبة لصبغة جرام ، فقد تفاوتت فى مدى قابليتها للتأثر بالمضادات الحيوية ، حيث أن معظمها كان حساساً للجنتامايسين ،السبروفلوكساسين والاميكاسين. ايروينيا هيربيكولا كانت حساسة لجميع المضادات الحيوية عدا الامبيسيلين والتتراسايكلي. أنواع كتيريا البروتيس اظهرت حساسية ضد الكلورامفينيكول ،كوـتراى مكسازول والجنتامايسين. السيدوموناس ايروجنوسا كانت مقاومة للمضادات الحيوية التتراسايكلين ، والامبيسيلين وذات حساسية ضد الجنتامايسين والاميكاسين. العزلات الفطرية التى عُزلت من الإناث فقط اشتملت على اسبيرجلس نايجر (6. 0%)، و اسبيرجلس نيدولانس (9.0 %)، وأنواع البنسيليوم (9.0 %). أما اسبيرجلس تيرس (9 .0 %)، فقد عُزلت من الذكور المصابين .كانت النسبة المئوية لانواع الكانديدا المعزولة من الذكور والإناث تساوى 40 % ، و60 % على التوالى، والنسبة المئوية لفطر اسبيرجلس فلافس كانت 75 % للذكور ،و25 % للاناث .النسبة المئوية للإناث المصابات بالفطريات كانت (7 .64 %)، والذكور المصاين (3 .35 %)، من مجموع العينات المختبرة. نسبة إلتهابات الأذن الوسطى الحادة كانت (2. 41 %)، أما الإلتهابات المزمنة كانت (5 .58 %)، أعلى نسبة لإلتهابات الأذن الوسطى كانت فى المدى العمرى مابين 1 ـ 10 سنوات ، أما المصابين فى الأعمار الأقل من سنة واحدة لم يظهروا أى وجود لعامل فطرى مسبب لالتهاب الأذن الوسطى.