Molecular Detection of the frame shift mutation (C.75544_7545delCT SNP) in NOTCH 1 gene in breast tumors

Abstract

Abstract: Background: NOTCH1 gene is an important gene that works as tumor suppressor and oncogene on the same time. The gene has sophisticated function in angiogenesis and tumorogenesis. NOTCH 1 has important role in breast cancer development. The c.7541_7542delCT SNP were found in almost 50% of chronic myeloid leukemia and some other leukemia. In a previous study; we have analyzed the SNP in the DNA from blood in some patients diagnosed with breast cancer, however we didn’t find association that is why, here we analyzed the SNP in breast cancer tissue and compared our findings with the immunihistochemical expression of the ER, PR and HER2/nue. Materials and Methods: Descriptive cross sectional study This was a case control study that included 81 females; 31 cases group and 50 control group. From Omdurman teaching hospital. All cases were diagnosed with adenocarcinoma of the breast. The SNP was analyzed using Allele specific PCR. Then for the caner tissue we retrieved the immunohistochestry results for PR, ER and HER2/neu. Results: put the frequencies The mean age of the cases group was 51.9 years and for the controls group was 21.4 years. All cases were adenocarcinoma and controls were benign lesions of the breasts. Grade II breast adenocarcinoma constituted the majority of the cases and there was a lack of proper, detailed of some cases other than adenocarcinoma without mentioning the grade. The c.7544-7545 delCT didn’t show association with adenocarcinoma of the breast in the studied group. VIConclusion: The mean age is similar to that of breast cancer in developing countries. The early grade of cancer in this study seems to be affected by the cancer diagnostic center but still national cancer registry would give a clearer picture for the grading. Lack of proper and detailed diagnosis for cancer could affect treatment strategy that is why doctors should give detailed pathological reports. The SNP was not associated with adenocarcinoma of the breast in this study, but it seems there is a correlation between NOTCH1 and HER2/neu2 results. Further functional studies would give a better story in this aspect الملخص مقدمة: جين NOTCH1 هو جين مهم يعمل ككابح للورم وجين سرطاني في نفس الوقت. للجين وظيفة متطورة في تكوين الأوعية الدموية وتكوين الأورام و له دور مهم في تطور سرطان الثدي. لقد تم أكتشاف أن المتغير c.7541_7542delCT يوجد في حوالي 50٪ من سرطان الدم النخاعي المزمن وبعض أنواع اسرطانات الدم الاخرى. في دراسة سابقة قمنا بتحليل SNP في الحمض النووي من الدم في بعض المرضى الذين تم تشخيص إصابتهم بسرطان الثدي ، ولكن لم نجد ارتباطًا ربما ان المتغير ذو علاقة بالنسيج السرطانى لهذا السبب ، قمنا هنا بتحليله في أنسجة سرطان الثدي وقارنا نتائجنا مع التعبير الكيميائي المناعي لـ .PR,PR, HER2/neu المواد والأساليب: كانت نوع هذه دراسة حالة ضابطة شملت 100 أنثى ؛ مجموعة 50 حالة و 50 مجموعة تحكم. تم تشخيص جميع الحالات بسرطان غدي في الثدي. تم تحليل SNP باستخدام. AS- PCR بالنسبة لأنسجة السرطان ، استرجعنا نتائج التحليل المناعي لـ PR و ER و. HER2 / neu النتائج: كان متوسط عمر مجموعة الحالات 51.9 سنة وللمجموعة الضابطة 21.4 سنة. كانت جميع الحالات عبارة عن سرطان غدي وكانت المجموعة الضابطة عبارة عن اورام حميدة في الثدي. شكّل سرطان الثدي من الدرجة الثانية غالبية الحالات وكان هناك نقص في التفاصيل التشخيصية لبعض الحالات. لم يُظهر c.7544-7545 delCT ارتباطًا بالسرطان الغدي للثدي في المجموعة المدروسة. و أظهرت المقارنة مع نتائج التحليل المناعى أرتباط ما بين بروتينى NOTCH1 و HER2/neu المناقشة: متوسط العمر مشابه لسرطان الثدي في البلدان النامية. يبدو أن الدرجة المبكرة من السرطان في هذه الدراسة قد تأثرت بمركز تشخيص السرطان ولكن لا يزال السجل الوطني للسرطان ذو أهمية كبيرة فهو يعطي صورة أوضح لمراحل السرطان الاكثر شيوعا. يمكن أن يؤثر عدم وجود تشخيص مناسب ومفصل للسرطان على استراتيجية العلاج ولهذا يجب على الأطباء تقديم تقارير مرضية مفصلة. لم يكن SNP مرتبطًا بالسرطان الغدي للثدي في هذه الدراسة ، ولكن يبدو أن هناك ارتباطًا بين نتائج NOTCH1 و HER2 / neu2 المزيد من الدراسات الوظيفية ستعطي نتائج أكثر توضيحا في هذا الجانب.