Detection of E6 Oncogene Associated With HPV Type 16 by PCR Among Sudanese Women with Cervical cancer

Abstract

Abstract Backgraund: Human Papilloma viruses (HPV) are the main causative agent for cervical cancer world wild. Methods: This study conducted in Sudan during period from March to July 2017. The study is a retrospective cross sectional in nature which that aimed to detect the E6 oncogene of HR-HPV in Sudanese women diagnosed as cervical cancer in the Khartoum state, the age of this women are ranged between 35 to 72 and the mean age was 52. The DNA was extracted from paraffin embedded tissue blocks previously diagnosed as cervical cancer of the Sudanese women, a total of 50 after DNA extraction was detect by polymerase chains reaction (PCR) using specific primer for the HPV16 E6 oncogene. All the sample and data was collected from targeted hospitals in the Khartoum state. Result: The samples were stained by haematoxlin & Eosin to confirm the histological diagnosis of the cancer, the most common cancer type is Squamous cell carcinoma followed by adenocarcinoma, Transitional cell carcinoma, infiltrative Squamous cell carcinoma, in then the DNA sample was amplify by the primer to detect the gene. Positive reaction was in 72% of the total 50 sample and was most common in Squamous cell carcinoma followed with transitional cell carcinoma, and 28% were negative. Conclusion: This result was confirmed that E6 oncogene is causative agent for cervical cancer in Sudanese women with significance of the P.valu less than 0.005.

ملخص الأطروحه الخلفية: فيروس الورم الحليمي البشري (فيروس الورم الحليمي البشري) هي العامل المسبب الرئيسي لسرطان عنق الرحم العالم. المنهجية: أجريت هذه الدراسة في السودان خلال الفترة من آذار / مارس إلى تموز / يوليه 2017. هذه الدراسة عبارة عن مقطع عرضي بطبيعته يهدف إلى الكشف عن الجين المسرطن E6 من فيروس الورم الحليمي البشري البشري في كبار السن السودانيين الذين شخصوا بسرطان عنق الرحم في ولاية الخرطوم، تراوحت الأعمار ما بين 35 و 72 سنة وكان متوسط العمر 52 سنة. ثم تم استخراج الحمض النووي من البرافين جزءا لا يتجزأ من كتل الأنسجة التي تم تشخيصها سابقا مع سرطان عنق الرحم من النساء السودانيين، أي ما مجموعه 50 بعد استخراج الحمض النووي تم الكشف عن تفاعل سلاسل البوليميراز باستخدام سلسلة مكملة محدد للجين الورم HPV16 E6. تم جمع جميع العينات والبيانات من المستشفيات المستهدفة في ولاية الخرطوم وتم صبغ جميع العينات بصبغة هيماتوكسلين و يوسين لتأكيد التشخيص النسيجي للسرطان. النتائج: و كان السرطان الأكثر شيوعا كما سرطان الخلايا الحرشفية تليها السرطان الغدي، سرطان الخلايا الانتقالية ، إنفلاتراتيف سرطان الخلايا الحرشفية، في ذلك الحين تم تضخيم عينة الحمض النووي من قبل التمهيدي للكشف عن الجين. وكان رد فعل إيجابي في 72٪ من مجموع العينة 50 وكان الأكثر شيوعا في سرطان الخلايا الحرشفية تليها سرطان الخلايا الانتقالية، و 28٪ كانت سلبية، الأستنتاج: وأكدت هذه النتيجة أن الجين المسرطن E6 يصيب النساء السودانيات مع أهمية من P.valu أقل من 0.005.