Molecular Detection Of The Aminoglycoside Resistant Gene (aac(6’)-Ib) In Clinical Staphylococcus aureus Isolates In Khartoum State.

Abstract

Abstract Background: Staphylococcus aureus is a microorganism resident in the skin and nasal membranes with a dreadful pathogenic potential to cause a variety of community and hospital-acquired infections, the frequency of these infections is increasing and their treatment is becoming more difficult, the ability of S. aureus to form biofilms and the emergence of multidrug-resistant strains are the main reasons determining the challenge in dealing with these infections. Aim: To detect Aminoglycoside resistance genes (aac (6’)-Ib) gene in clinical Staphylococcus aureus isolates in Khartoum state. Method: hundred clinical isolates of Staphylococcus aureus were collected from different specimen including wound, urine, HVS, blood, and pus Aspirate, from ShargAlneel Hospital, Alsaaha Specialized Hospital, Al-mo’alem Medical city and Al Alim Specialized Laboratory. It was re-identified by Gram stain, catalase test, coagulase test and mannitol fermentation. Then the DNA was extracted using the boiling method and finally conventional PCR was performed. Result: Wound swab was the most frequent specimens (57%), urine specimen (20%), blood specimen (4%), eye swab (6%), pus aspirate (5%), high vaginal swab (5%) and nasal swab (3%). In antimaicrobial sensitivity test (disk method), 2% (2/100) specimens are resistance to aminoglycoside. Among All clinical isolate 1% (1/100) were positive for aac (6') gene, in wound specimen (1%), the presence of the aac(6') gene inpatients 1% more than outpatients 0%. Conclusion In this study, S. aureus was isolated from variety specimens (wound, blood, urine, eye swab, nasal swab, high vaginal swab and pus aspirate). Among All clinical isolate when detecte by PCR found 1% aac(6′)-Ib gene, in wound specimen from hospitalized patient. The incidence of aminoglycoside resistance gene in this study was lower than that reported in studies in Turkey, Poland, China and Europe

المستخلص المكورات العنقودية الذهبية هي كائن حي مجهري يقيم في الجلد والأغشية الأنفية مع قدرة امراضية مروعة على التسبب في مجموعة متنوعة من العدوى المكتسبة في المجتمع والمستشفى ، ويزداد تواتر هذه العدوى ويصبح علاجها أكثر صعوبة ، وقدرة المكورات العنقودية الذهبية تشكل الأغشية الحيوية وظهور سلالات مقاومة للأدوية المتعددة هي الأسباب الرئيسية التي تحدد التحدي في التعامل مع هذه العدوة. الهدف: الكشف عن الجينات المقاومة للأمينوغليكوزيد في المكورات العنقودية الذهبية من العزلات الإكلينيكية المختلفة في ولاية الخرطوم. الطريقة: تم جمع مئة عزلة إكلينيكية من المكورات العنقودية الذهبية من عينات مختلفة بما في ذلك الجرح,البول, مسحة من أعلى المهبل ,الدم والقيح من مستشفى شرق النيل, مدينة المعلم الطبية, مستشفى الساحة التخصصي ومختبر العالِم التخصصي . وتم اعادة التعرف عليها بصبغة الجرام,اختبار الكاتلاز,اختبار تجلط البلازما وتخمير المانيتول. ثم تم استخراج الحمض النووي باستخدام طريقة الغليانو أخيراً تم إجراء طريقة تفاعل البوليمريزالمتسلسل. النتيجة: من العينات اللتي تم جمعها كانت عينة الجروح هي الأكثرشيوعاً من بين جميع العينات (57%), ثم عينة البول (20%)عينة الدم) 4%) مسحة العين (6%) ، ونضح القيح (5%) ، ومسحة المهبل عالية (5%) ومسحة الأنف (3%). في اختبار حساسية مضادات الميكروبات (طريقة القرص) 2% (2/100) العينات مقاومة للأمينوغليكوزيد. كانوجود الجينAAC(6)في المرضى الداخليين (1% ) أكثر من المرضى القادمون من العيادات الخارجية (0%). بين جميع العزلات السريرية تم الكشف عن1 % موجبة للجين المقاوم للأمينوغليكوزيدفي عينة الجرح. الخلاصة: في هذه الدراسة تم عزل المكورات العنقودية الذهبية من عينات متنوعة( الجرح , الدم ,بول, مسحة عين, مسحة انف , مسحة مهبلية عالية وصديد). عندما تم الكشف عن AAC(6')-Ib جين بطريقة تفاعل البوليمريز المتسلسل تم العثور على 1% عينة موجبةوكانت في عينة جرح لمريض داخل المستشفى.وكان معدل كشف الجين المقاوم للأمينوغليكوزيد في هذه الدراسة أقل مما تم الإبلاغ عنه في دراسات أجريت في تركيا وبولندا والصين وأوروبا.