كلية علوم المختبرات الطبية
Permanent URI for this communityhttps://repository.neelain.edu.sd/handle/123456789/488
Browse
1 results
Search Results
Item Human Leukocyte Antigen-A, -B and -DR Alleles Diversity among Sudanese Renal & Bone marrow donors(Neelain University, 2019) Elrabab Subahi Abuaglla ElmusharafAbstract Background: Human Leukocyte Antigen (HLA) is cell surface glycoproteins encoded by Major Histocompatibility Complex (MHC) gene of human genome. Human leukocyte Antigen is the most polymorphic genetic system in man and plays an important role in solid organ transplant, bone morrow transplant, and auto immune diseases. Objective: This study was carried out to determine the distribution and frequencies of the HLA-A, HLA-B, and HLA-DRB1 alleles among healthy unrelated renal and bone morrow donors, and compare them with that of geographically African and Arab related populations. Method: Three hundred fifty one healthy unrelated renal and bone morrow donors were typed for HLA-A, HLA-B, and HLA-DRB1 by using low resolution Polymerase Chain Reaction-Sequence Specific Primer (PCR-SSP) techniques. Results: A total of 18 HLA-A alleles, 32 HLA-B alleles, and 14 HLA-DRB1 alleles were identified in renal and bone morrow donors. In this study considerable allele diversity was revealed at each locus. The most frequent HLA-A* alleles in the population included: A*02(54.4%), A*30(39.8%), followed by A*68(16.8%), A*03(13.1%), A*01(11.4%) and A*24(11.4). HLA-A*34, -A*36, -A*66 and -A*69 were present at low frequencies (<2%) and HLA-A*25, A*43 and A*80 were absent. In the HLA-B* locus the most frequent alleles were B*51(23%), followed by B*41 (12.8%), B*39 (12.0%), B*50(12.0%), B*15:03(11.0%) and B*35(10.8%).The least frequent alleles were B*55(1%) and B*73(1%).B*46, B*48, B*54, B*56, B*59, B*78, and B*81 were absent in this study. IX In the HLA-DRB1* locus, DRB1*13(49.0%) was shown to be the most frequent allele followed by DRB1*03:01(22.8%), DRB1*15(21%), DRB1*07(19.9%), DRB1*08(19.9%) and DRB1*11(19.4%). The alleles with minimal frequencies were DRB1*302 (1.4%) and DRB1*09(0.8).Some alleles were found to be homozygote such as A*02 (8.0%) and A*30 (6.3%), B51 (3.1%), B41 (1.7%) and B07 (1.4%), DRB1*13(31%), DRB1*07(19%), DRB1*15(16.7%), and DRB1*301(11.9%). Conclusions: The study results revealed a considerable diversity in the frequencies and distribution of HLA alleles in the study population and confirmed the observations on other Sudanese population studies, with slight difference but largely consistent in allele frequencies values, that may explain the possible differences from one area to another within one country. The present results of allele distribution and frequencies demonstrated that Sudanese population shares HLA patterns with Arab related populations, North African and some of the neighboring African populations. Furthermore, HLA phenotype frequencies and distribution among Sudan population, if well documented, will serve many purposes including solid organ transplant, bone marrow transplant, studying HLA antigens associated diseases,. It is also a valuable resource for individuals who are interested in population genetics, allows a preliminary description of HLA allele distribution and diversity of Sudan population and gives new elements which may be helpful in the anthropologic studies. X مستخلص البحث الخلفية: مضادات كريات الدم البيضاء البشرية (HLA) هي بروتينات سكرية توجد على سطح الخلية المشفرة بواسطة جين نظام التوافق النسيجي الرئيسي (MHC) من الجينوم البشري. وهي النظام الوراثي متعدد الأشكال في الإنسان وتلعب دورا هاما في زراعة الأعضاء الصلبة ، وزراعة نخاع العظام ، وتشخيص أمراض المناعة الذاتية. أجريت هذه الدراسة في مركز إبن سينا مراض وزراعة الكلى الهدف: تهدف هذه الدراسة لتحديد توزيع وتردد الجينات المتعددة الاشكال HLA-B و HLA-Aو HLA-DRB1 بين المتبرعين الاصحاء لمرضى الكلى وزراعة نخاع العظام والذين لاتربطهم صلة قرابة ، ومقارنتهم بتلك الخاصة بالسكان الأفارقة والعرب وكذلك يمكن أن تكون مرجعاً للمهتمين بعلم بالأبحاث الأنثروبولوجية وعلم الجينات. الطريقة تم إجراء فحص التوافق النسيجيHLA-A Typing ، HLA-B ، HLA-DRB1 لثلاثمائة وخمسون من المتبرعين الاصحاء لمرضى الكلى وزراعة نخاع العظام والذين لاتربطهم صلة قرابة باستخدام تقنيات البلمرة المتسلسلة محددة رد الفعل. (PCR-SSP), النتائج والخلاصة تم تحديد مجموعه 18 أليل HLA- A ، و 32 HLA-B ، و 14HLA-DRB1 في المتبرعين الاصحاء لمرضى الكلى وزراعة نخاع العظام ,، و الأليلات الأكثر شيوعا بين المتبرعين في HLA- A تشمل A*30, A*02 تليها. A*01, A*03, A*68 والأليلات A*34 و A*36 و A * 66 و A*69 متواجدة بترددات منخفضة (أقل من 2٪) أما A*25 و A*43و A*80 لم تكن موجودة. XI بين الأليلات HLA-B B*51 هو الأكثر تكرارا، تليها B*41 و B*39 و B*50 و B*15:03) وB*35 والأليلات الأقل تكرارا B*55 و B*73 أماB* 46 ، B*48 ، B*54، B* 56، B*59 ، B*78، B*81 لم تكن تكن موجودة في هذه الدراسة. وفي ألأليلات DRB1*13 HLA-DRB1 هو أكثرألأليلات تكرارا يليهDRB1*03:01 وDRB1*15 و DRB1*07و DRB1*08و الأليلات المتواجدة بترددات منخفضة كانت DRB1*302 و DRB1*09 . وقد وجدت بعض الأليلات متماثلة الزيجوت مثلA*02 و A*30 و B*51 و B*41 وB*07 و DRB1*13 و DRB1*07 و DRB1*15و DRB1*03:01 إتفقت نتائج هذه الدراسة مع نتائج الدراسات السودانية الأخرى ، مع وجود اختلاف طفيف لكنه متناسق إلى حد كبير في قيم تردد الأليلات ، ذلك قد يفسر الاختلافات المحتملة من منطقة إلى أخرى داخل البلد الواحد . أشارت النتائج أيضا إلى بعض المشاركة في الأليلات مع بعض العرب وشمال افريقيا والأفارقة الآخرين علاوة على ذلك فإن ترددات النمط الظاهري لـ HLA وتوزيعها بين سكان السودان سوف تخدم العديد من الأغراض بما في ذلك زراعة الأعضاء الصلبة ، وزراعة النخاع العظمي إذا تم توثيقها بشكل جيد . كما يمكن استخدام هذه البيانات في دراسات HLA والأمرض المرتبطة بها.ويمكن أن تكون مرجعا قيما للأفراد المهتمين بعلم الوراثة السكانية ، وتنوع السكان في السودان ويضيف عناصر جديدة قد تكون مفيدة في الأبحاث الأنثروبولوجية.