Shima Nader Mohamed Al-Amin2021-06-072021-06-072021-04http://hdl.handle.net/123456789/16394A dissertation Submitted in Partial Fulfillment for the Requirements of M.Sc. Degree in Medical Laboratory Sciences (Medical Microbiology)Abstract Background: Klebsiella species which carring ESBL enzymes are frequently resistant to other classes of antibiotics, this bacteria is continue to emerge against drug development so it was show clearly resistance to Carbapenem antibiotics. Aim: This study aimed to detect one of the resistant carbapeneme genes (KPC-2)the most prominent type in the world in many Khartoum State hospitals( Military Hospital central lab , ,Omdurman Maternity Hospital Lab, Al Buruj Medical lab ,,Ultra lab Medical analysis) during the period from February 2019 to August 2019. Materials and Methods: A total of)100( Klebsiella species clinical isolates were selected from different clinical specimens from different Khartoum State hospitals , Klebsiella species isolates were screened for the carbapenem antibiotics; Meropenem (MEM), Imipenem (IMP),by using Kirby and Bauer disk diffusion method ,then DNA was extracted by boiling method and Conventional PCR amplification method was used to detect KPC-2 resistant gene. Results: The designed primer set correctly detected all 22 (KPC2) gene from 100 samples of Klebsiella species (I0) 11.6% of them were carbapenem sensitive results and(12 ) 85.7% of them were carbapenem resistant and within (100 )clinical Klebsiella isolates negative genes were 78%(78/100) (76)88.4% of them are sensitive and(2) 14.3% were resistant., the most frequent samples that contain this resistant gene were urine11/100)11%(,followed by High vaginal swabs ,sputum 4/100)4%(,blood cultures 2/100)2%(,and wound swabs 1/100)1%(. .Conclusion:This high level of KPC-2 resistant gene among Klebsiellaspecies is a good indicator for Khartoum State hospitals of resistance to available antibiotics. المستخلص الخلفية: بكتريا ال (Klebsiella)التي لديها انزيمات (ESBL) لها قدره متجدده على مقاومه انواع اخرى من المضادات الحيويه وهي بكتريا تتطور تبعا لتتطور المضادات الحيويه الهدف: هدفت هذه الدراسه للتحقق من وجود أحد هذه الجينات المقاومه للمضادات الحيويه وهو KPC-2 أحد أكثر الانواع انتشارا في العالم وذالك تم في مستشفيات ولايه الخرطوم المذكوره(مستشفي السلاح الطبي ومستشفي امدرمان التعليمي ولابات البرج وأخيرا ألترا لاب) . المواد والطرق: تم اختيار 100 عينه من عينات سريريه مختلفه تحتوي علي بكتريا ال (Klebsiella) ثم اخضعت لاختبار المضادات الحيويه التي تنتمي الي عائله ال (carbapenem )وهما(imipenem meropenem)بإستخدام طريقه Kirby and Bauer disk diffusion) ), بعدها تم استخراج الحمض النووي بطريقه الغليان لتحضيره لعمليه الكشف عن الجين المقاوم KPC-2 باستخدام جهاز (PCR ) بالطريقه التقليديه . النتائج: طقم البرايمر المصمم استتطاع بنجاح أن يضاعف 22 عينه تحتوي علي الجين تحت الدراسه منهم (10)11.6% عينات ليه نتيجه (sensitive) لل(carbapenem) ومنها ايضا85 .7% (12)عينه ذات نتيجه (resistant)لإاختبارال(carbapenem ) ,اما بالنسبه للعينات التي لا تحتوي علي KPC-2والتي عددها 78 عيينه ) 88.4%76 (منها ذو نتيجه (sensitive) لإختبار ال (carbapenem) و2 )14.3(منها ذو نتيجه (resistant) لإختبار ال (carbapenem),اما بالنسبه للعينات العينات التي تحتوي علي هذا الجينKPC-2 فان اكثر العينات تكرارا هي عينه البول (11%), تليها المسحه المهبليه والبلغم (4%) ثم الدم (2%) وااخيرا مسحه الجرح (1%). الخلاصة: استخدام عينات انواع الكلبسيلا للكشف عن الجين المقاوم KPC-2 ووجوده بهذه النسبه العاليه مؤشر كافي بأن مستشفيات الخرطوم لديها بيانات تنذر بمقاومه البكتريا للمضادات الحيويه المتاحه للعلاجMedical MicrobiologyKlebsiella species isolatedMolecular detection of Carbapenem resistant gene (bla KPC-2) among Klebsiella species isolated from clinical specimens from different Khartoum State HospitalsThesis