Molecular Detection of SV40, BKV and JCV in Esophageal and Colorectal cancer Patients in Khartoum State, Sudan

Abstract

ABSTRACT Background: The polyomaviruses that infect humans, BK virus (BKV), JC virus (JCV), and simian virus 40 (SV40), typically establish subclinical persistent infections. However, reactivation of these viruses in immunocompromised hosts is associated with renal nephropathy and hemorrhagic cystitis (HC) caused by BKV and with progressive multifocal leukoencephalopathy (PML) caused by JCV. Additionally, SV40 is associated with several types of human cancers including primary brain and bone cancers, mesotheliomas, and non-Hodgkin’s lymphoma. Objective: This study was designed to detect BKV, JCV, and SV40 among colorectal cancer and esophageal cancer patients in Khartoum State, Sudan during the period from October 2018 to November 2019 Methods: Paraffin embedded blocks of tumor specimen from 56 colorectal cancer patients and 25 from esophageal cancer patients were collected from khartoum teaching hospital and Medical Military Hospital, Sudan. Multiplex nested PCR was used to investigate the presence of BKV, JCV, and SV40 viruses in these specimens. Results: BKV, JCV, and SV40 DNAs were detected in 11 out of 56 (19.64%) colorectal cancer samples and 3 out of 25 (12%) esophageal cancer samples, . Out of 56 patients diagnosed with colorectal cancer patients, 17%, 1.75% were found positive for SV40, JCV respectively, BKV was not detected. Out of 25 patients diagnosed with esophageal cancer patients 8%, 4% were found positive for JCV, and BKV respectively, SV40 was not detected Conclusion: The incidence of BKV, JCV, and SV40 in colorectal and esophageal cancer patients in Khartoum State, was documented through the molecular detection of BKV, JCV, and SV40 indicating high prevalence rates for SV40 among colorectal cancer patients in Khartoum State. Detection of BKV, JCV, and SV40 using multiplex nested PCR was established. Generally, these findings are useful for future studies since there is little information available about BKV, JCV, and SV40 infection in Sudan. Keywords BKV, JCV, and SV40; colorectal; esophageal, Khartoum State; Sudan

ملخص الدراسة خلفية الدراسة: فيروسات البوليماف التي تصيب البشر، وفيروس(BKV) BK ، وفيروس JC ((JCV ، وفيروس simian 40 (SV40)، تؤسس عادةً للعدوى المستمرة تحت الإكلينيكي. ومع ذلك ، يرتبط تنشيط هذه الفيروسات في مضادات نقص المناعة مع اعتلال الكلية الكلوي والتهاب المثانة النزفي (HC) الناجم عن BKV ومع اعتلال الدماغ النسبي متعدد البؤر التقدمي (PML) الناجم عن JCV. بالإضافة إلى ذلك ، يرتبط SV40 بعدة أنواع من السرطانات البشرية ، بما في ذلك سرطانات الدماغ والعظام الأولية ، ورم الظهارة المتوسطة ، والأورام اللمفاوية غير هودجكين. الهدف : تم تصميم هذه الدراسة للكشف عن BKV ، JCV ، و SV40 بين مرضى سرطان القولون والمستقيم وسرطان المريء في ولاية الخرطوم ، السودان خلال الفترة من اكتوبر 2018 إلى نوفمبر 2019 الطريقة: تم جمع كتل بارافين من عينات الأورام من 56 مريض بسرطان القولون والمستقيم و 25 من مرضى سرطان المريء من مستشفى الخرطوم التعليمي والمستشفى الطبي العسكري بالسودان. تم استخدام PCR المتداخل Multiplex للكشف عن في وجود فيروسات BKV و JCV و SV40 في هذه العينات. النتائج: تم اكتشاف الحمض النووي BKV ، JCV ، و SV40 في 11 من أصل 56 (19.64 ٪) من عينات سرطان القولون والمستقيم و 3 25 (12 ٪) من عينات سرطان المريء ،. من بين 56 مريضاً تم تشخيصهم بمرضى سرطان القولون والمستقيم ، وجد أن 17٪ و 1.75٪ كانوا إيجابيين بالنسبة لـ SV40 ، JCV على التوالي ، لم يتم اكتشاف BKV. من بين 25 مريضا تم تشخيصهم بمرضى سرطان المريء وجد 8٪ ، ووجد 4٪ إيجابيين لـ JCV و BKV على التوالي ، لم يتم اكتشاف SV40 الخلاصة: تم تاسيس حدوث BKV ، JCV ، و SV40 في مرضى سرطان القولون والمستقيم والمريء في ولاية الخرطوم ، من خلال الاكتشاف الجزيئي لـ BKV ، JCV ، و SV40 مما يشير إلى معدلات انتشار عالية لمرضى سرطان القولون والمستقيم في ولاية الخرطوم. تم تأسيس اكتشاف BKV و JCV و SV40 باستخدام تفاعل البلمرة المتسلسل المتداخل متعدد الإرسال. بشكل عام ، تعد هذه النتائج مفيدة للدراسات المستقبلية نظرًا لوجود القليل من المعلومات حول عدوى BKV و JCV و SV40 في السودان. الكلمات الأساسية: BKV , JCV و SV40؛ القولون والمستقيم، المريء ، ولاية الخرطوم، السودان.